基因多态性与结直肠癌化疗毒性及疗效的关系

结直肠癌是发病率和死亡率双高的一种癌症,化疗是临床中最常用的治疗手段之一,但不同患者对同样的化疗方案的不良反应和药物敏感性相差很大。越来越多的研究证实这种个体差异与基因多态性密切相关。目前,基因多态性在结直肠癌靶向治疗中的研究已经普遍被人们接受,在化疗中的研究也越来越广泛。联合化疗在结直肠癌临床治疗中效果更显著,明确这些基因多态性位点对于结直肠癌的精准化疗及联合化疗等治疗方法具有重要的指导意义。本文对临床上结直肠癌常用的化疗药物和化疗方案相关的基因多态性及其意义做一综述。

粗毛纤孔菌转录组密码子偏好性分析

粗毛纤孔菌(Inonotus hispidus)是桑黄的一种,具有极高的药用价值。本研究为了揭示粗毛纤孔菌转录组编码序列对密码子使用的偏好性及特点,利用CodonW、Python软件等对粗毛纤孔菌转录组进行分析计算,共筛选出符合条件的10716条编码序列。结果显示:GC、GC3s的平均值分别为51.7%和50.8%,ENC的平均值为59.41,且ENC值大于35的占97.8%,密码子偏好性较弱。ENC-plot绘图发现基因并没有均匀的分布在曲线的两边,偏倚性分析显示基因主要分布于中心的周围,说明粗毛纤孔菌在密码子使用偏好性上是受突变压力和自然选择等多重因素的影响。经筛选共选出14个最优密码子,且在最优密码子中第三位碱基更倾向于使用G和C。粗毛纤孔菌桑黄与库德里阿兹威酵母、家蚕、拟南芥和大肠杆菌密码子使用频率对比发现差异较大。本研究为粗毛纤孔菌桑黄在进化及外源生物中的表达提供参考。