PPARα、γ、δ三靶点激动剂设计、虚拟筛选及分子动力学模拟研究

目的:设计并筛选过氧化物酶体增殖物激活受体α、γ、δ(PPARα、γ、δ)三靶点激动剂,探讨其与三靶点相互作用情况。方法:根据PPARα、γ、δ三靶点激动剂2D药效团特征设计一系列小分子;通过分子对接方法对其进行虚拟筛选;应用分子动力学方法模拟其与PPARα、γ、δ的相互作用。结果:设计得到一系列苯氧乙酸类衍生物作为PPARα、γ、δ三靶点激动剂;对接结果表明通过柔性的连接基团连接一个芳香基团的苯氧乙酸类衍生物可以与PPARα、γ、δ活性位点良好结合;分子动力学结果表明模拟过程中受体与激动剂复合物体系是稳定的,苯氧乙酸类衍生物可以在PPAR配体结合位点灵活波动并与受体AF-2螺旋周期性地形成氢键,使AF-2螺旋稳定于激活构象从而引导协同因子与受体结合来激动受体启动转录过程。结论:通过柔性连接基团连接一个芳香基团的苯氧乙酸类衍生物可以作为PPARα、γ、δ三靶点激动剂。

PTP1B中Arg221各种突变下底物与催化结构域相互作用变化的理论研究(英文)

蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)在胰岛素受体去磷酸化过程中发挥重要作用。本研究目的在于阐述PTP1B催化位点中Arg 221的作用。各种Arg 221的突变体通过HyperChem Release 7.0软件生成。结果表明Arg 221的突变会对底物与蛋白相互作用产生显著影响。当Arg 221突变为碱性残基时,底物与蛋白之间总静电相互作用能增加,但与催化相关残基的静电相互作用能降低,其余的突变则导致底物与蛋白之间总静电相互作用能降低。这一结果表明,Arg 221突变为碱性残基可减弱PTP1B的催化活性,但使底物与蛋白的结合能力增强,其余的突变则会同时减弱酶的催化活性及底物与蛋白的结合能力。

2-(4-甲氧基苯基)亚肼基乙酸与乙醛酸反应密度泛函理论研究(英文)

本文应用量子化学密度泛函理论（DFT）研究了2-（4-甲氧基苯基）亚肼基乙酸与乙醛酸的反应机理及动力学行为，并研究了不同取代基对反应的影响。在RB3LYP／6—31G＊水平上，优化了各反应通道的反应物、中间体、过渡态及产物的几何构型，计算了各驻点的振动频率、零点能和电荷分布。计算结果表明，该反应有2条反应通道，分别生成（2z）和（2E）－3-（4．甲氧基苯基二氮烯基）丙烯酸。产物发生了键长的平均化和电荷的重新分布。两反应通道具有相同的反应入口，Z式产物为主要产物，2－（4－甲氧基苯基）亚肼基乙酸中苯环对位被给电子基团取代，有利于反应进行。