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基于高通量测序的锈腐病西洋参转录组分析
1
作者
庞玉雪
陈磊
+1 位作者
于红霞
王洪涛
《山东农业科学》
北大核心
2024年第7期46-56,共11页
为探究锈腐病对西洋参基因表达模式的影响,本研究采用RNA-seq方法分析比较健康与患锈腐病西洋参根与叶中的基因表达差异,并对差异表达基因(DEGs)进行功能聚类分析。结果显示:BL-vs-AL(感病叶片vs健康叶片)组中共鉴定出8 642个DEGs,包含...
为探究锈腐病对西洋参基因表达模式的影响,本研究采用RNA-seq方法分析比较健康与患锈腐病西洋参根与叶中的基因表达差异,并对差异表达基因(DEGs)进行功能聚类分析。结果显示:BL-vs-AL(感病叶片vs健康叶片)组中共鉴定出8 642个DEGs,包含上调表达4 463个,下调表达4 179个;BR-vs-AR(感病根vs健康根)组中共鉴定出5 308个DEGs,包含上调表达2 609个,下调表达2 699个。GO分析发现,大多数DEGs在细胞过程、代谢过程、细胞、催化活性等方面显著富集。KEGG分析表明,DEGs主要富集到苯丙素生物合成、不饱和脂肪酸的生物合成、MAPK信号通路等与植物抗病相关的代谢通路中。同时,在两组共有DEGs中预测到转录因子116个,分别归属到25类转录因子家族中。qRT-PCR验证7个DEGs结果与转录组测序结果的表达变化趋势相符。本研究明确了异质生境中感染锈腐病的西洋参相关基因的表达特征及相关代谢通路,可为深入研究西洋参抗锈腐病的分子机制提供一定的信息参考。
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关键词
西洋参
锈腐病
转录组测序
差异表达基因
功能聚类
通路富集
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职称材料
UPLC法测定西洋参不同部位中皂苷类成分及质量评价研究
2
作者
张燕停
任利鹏
+4 位作者
魏晓明
于红霞
王佳佳
段媛媛
刘政波
《特产研究》
2024年第2期115-122,127,共9页
本文旨在建立超高效液相色谱-二极管阵列检测器(UPLC-PDA)法同时测定山东西洋参中16种皂苷类成分的方法,并对山东省威海市5个地区11批西洋参芦头、主根、侧根和须根不同部位的皂苷含量进行测定,以期为山东西洋参质量控制与评价提供科学...
本文旨在建立超高效液相色谱-二极管阵列检测器(UPLC-PDA)法同时测定山东西洋参中16种皂苷类成分的方法,并对山东省威海市5个地区11批西洋参芦头、主根、侧根和须根不同部位的皂苷含量进行测定,以期为山东西洋参质量控制与评价提供科学依据。采用Acquity UPLC BEH C_(18)柱(2.1 mm×50 mm,1.7μm),流动相为水-乙腈,梯度洗脱,流速0.4 mL/min,柱温为30℃,进样量为2μL,PDA检测器,检测波长为203 nm。16种皂苷在0.05~1.00 mg/mL范围内线性良好,相关系数均大于0.999 1,加标回收率为92.45%~103.24%,RSD为0.31%~4.60%,灵敏度、准确度及精密度均符合要求。山东省威海地区西洋参芦头、主根、侧根和须根部位皂苷含量分别为(42.69±7.01) mg/g、(32.63±4.71) mg/g、(30.80±5.15) mg/g和(37.55±5.23) mg/g。通过主成分分析及正交偏最小二乘法分析,初步筛选出人参皂苷Re、Rc、Rb_(1)、Rb_(3)和Rb_(2)作为西洋参不同部位鉴别的潜在质量标志物。本研究建立的方法可用于西洋参皂苷含量测定及不同部位的区分,对西洋参质量进行初步评价。
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关键词
山东西洋参
人参皂苷
不同部位
超高效液相色谱法
质量评价
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职称材料
山东省威海地区西洋参皂苷含量分析
3
作者
牛序滕
苗琳
+2 位作者
徐钰菲
宋政建
于红霞
《特种经济动植物》
2023年第11期16-19,22,共5页
为评价威海地区西洋参的品质,以皂苷含量为切入点,了解西洋参的理化性质。收集了威海市7个乡镇12个村共36批西洋参,用液相色谱法测定西洋参中3种人参皂苷Rg1、Re、Rb1的含量,并将3种皂苷含量相加,对检测结果进行对比分析。结果表明,威...
为评价威海地区西洋参的品质,以皂苷含量为切入点,了解西洋参的理化性质。收集了威海市7个乡镇12个村共36批西洋参,用液相色谱法测定西洋参中3种人参皂苷Rg1、Re、Rb1的含量,并将3种皂苷含量相加,对检测结果进行对比分析。结果表明,威海地区西洋参皂苷含量高于其他地区,其中4年生西洋参中皂苷含量最高,为威海地区西洋参的品质研究提供了理论依据。
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关键词
威海地区
西洋参
人参皂苷含量
品质分析
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职称材料
山东“鲁十味”中药材西洋参种植关键技术研究现状与分析
被引量:
1
4
作者
冉志芳
段婉莹
+4 位作者
陈小莉
于红霞
张永清
郭兰萍
周洁
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期3719-3724,共6页
西洋参作为“鲁十味”药材之一,主要来源于栽培品。随着西洋参市场需求量的增加,药材品质备受关注,种植技术是影响西洋参产量与品质的重要因素。本研究结合西洋参的生物学特性和药材特征,对山东主产区西洋参选地整地技术、搭棚技术、田...
西洋参作为“鲁十味”药材之一,主要来源于栽培品。随着西洋参市场需求量的增加,药材品质备受关注,种植技术是影响西洋参产量与品质的重要因素。本研究结合西洋参的生物学特性和药材特征,对山东主产区西洋参选地整地技术、搭棚技术、田间管理技术和采收加工技术等关键种植技术的研究现状进行了综述与分析,以期为提升西洋参产量与品质、推动西洋参产业品牌培育提供借鉴。
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关键词
“鲁十味”
西洋参
关键种植技术
现状与分析
原文传递
题名
基于高通量测序的锈腐病西洋参转录组分析
1
作者
庞玉雪
陈磊
于红霞
王洪涛
机构
烟台大学生命科学学院
威海市文登区道地参业发展有限公司
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第7期46-56,共11页
基金
山东省自然科学基金面上项目(ZR2020MH367)。
文摘
为探究锈腐病对西洋参基因表达模式的影响,本研究采用RNA-seq方法分析比较健康与患锈腐病西洋参根与叶中的基因表达差异,并对差异表达基因(DEGs)进行功能聚类分析。结果显示:BL-vs-AL(感病叶片vs健康叶片)组中共鉴定出8 642个DEGs,包含上调表达4 463个,下调表达4 179个;BR-vs-AR(感病根vs健康根)组中共鉴定出5 308个DEGs,包含上调表达2 609个,下调表达2 699个。GO分析发现,大多数DEGs在细胞过程、代谢过程、细胞、催化活性等方面显著富集。KEGG分析表明,DEGs主要富集到苯丙素生物合成、不饱和脂肪酸的生物合成、MAPK信号通路等与植物抗病相关的代谢通路中。同时,在两组共有DEGs中预测到转录因子116个,分别归属到25类转录因子家族中。qRT-PCR验证7个DEGs结果与转录组测序结果的表达变化趋势相符。本研究明确了异质生境中感染锈腐病的西洋参相关基因的表达特征及相关代谢通路,可为深入研究西洋参抗锈腐病的分子机制提供一定的信息参考。
关键词
西洋参
锈腐病
转录组测序
差异表达基因
功能聚类
通路富集
Keywords
Panax quinquefolius
Rust root rot disease
Transcriptome sequencing
Differentially expressed gene
Gene ontology
Pathway enrichment
分类号
S567.530.1 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
UPLC法测定西洋参不同部位中皂苷类成分及质量评价研究
2
作者
张燕停
任利鹏
魏晓明
于红霞
王佳佳
段媛媛
刘政波
机构
中国农
业
科学院特产研究所
山东省
威海市
文登区
农
业
农村局
威海市文登区道地参业发展有限公司
出处
《特产研究》
2024年第2期115-122,127,共9页
基金
吉林省科技发展计划项目(20190304015YY)。
文摘
本文旨在建立超高效液相色谱-二极管阵列检测器(UPLC-PDA)法同时测定山东西洋参中16种皂苷类成分的方法,并对山东省威海市5个地区11批西洋参芦头、主根、侧根和须根不同部位的皂苷含量进行测定,以期为山东西洋参质量控制与评价提供科学依据。采用Acquity UPLC BEH C_(18)柱(2.1 mm×50 mm,1.7μm),流动相为水-乙腈,梯度洗脱,流速0.4 mL/min,柱温为30℃,进样量为2μL,PDA检测器,检测波长为203 nm。16种皂苷在0.05~1.00 mg/mL范围内线性良好,相关系数均大于0.999 1,加标回收率为92.45%~103.24%,RSD为0.31%~4.60%,灵敏度、准确度及精密度均符合要求。山东省威海地区西洋参芦头、主根、侧根和须根部位皂苷含量分别为(42.69±7.01) mg/g、(32.63±4.71) mg/g、(30.80±5.15) mg/g和(37.55±5.23) mg/g。通过主成分分析及正交偏最小二乘法分析,初步筛选出人参皂苷Re、Rc、Rb_(1)、Rb_(3)和Rb_(2)作为西洋参不同部位鉴别的潜在质量标志物。本研究建立的方法可用于西洋参皂苷含量测定及不同部位的区分,对西洋参质量进行初步评价。
关键词
山东西洋参
人参皂苷
不同部位
超高效液相色谱法
质量评价
Keywords
Panax quinquefolium L.
ginsenoside
different parts
UPLC
quality evaluation
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
山东省威海地区西洋参皂苷含量分析
3
作者
牛序滕
苗琳
徐钰菲
宋政建
于红霞
机构
威海市文登区道地参业发展有限公司
出处
《特种经济动植物》
2023年第11期16-19,22,共5页
基金
山东省重点研发计划(2022TZXD0034)。
文摘
为评价威海地区西洋参的品质,以皂苷含量为切入点,了解西洋参的理化性质。收集了威海市7个乡镇12个村共36批西洋参,用液相色谱法测定西洋参中3种人参皂苷Rg1、Re、Rb1的含量,并将3种皂苷含量相加,对检测结果进行对比分析。结果表明,威海地区西洋参皂苷含量高于其他地区,其中4年生西洋参中皂苷含量最高,为威海地区西洋参的品质研究提供了理论依据。
关键词
威海地区
西洋参
人参皂苷含量
品质分析
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
山东“鲁十味”中药材西洋参种植关键技术研究现状与分析
被引量:
1
4
作者
冉志芳
段婉莹
陈小莉
于红霞
张永清
郭兰萍
周洁
机构
济南大学生物科学与技术学院
山东中医药大学药学院
威海市文登区道地参业发展有限公司
中国中医科学院中药资源中心
出处
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第8期3719-3724,共6页
基金
中国博士后科学基金项目(No.2021M701404)
国家重点研发计划子课题(No.2017YFC1700705)
+1 种基金
高校院所科研带头人工作室项目(No.2020GXRC060)
中央本级重大增减支项目(No.2060302)。
文摘
西洋参作为“鲁十味”药材之一,主要来源于栽培品。随着西洋参市场需求量的增加,药材品质备受关注,种植技术是影响西洋参产量与品质的重要因素。本研究结合西洋参的生物学特性和药材特征,对山东主产区西洋参选地整地技术、搭棚技术、田间管理技术和采收加工技术等关键种植技术的研究现状进行了综述与分析,以期为提升西洋参产量与品质、推动西洋参产业品牌培育提供借鉴。
关键词
“鲁十味”
西洋参
关键种植技术
现状与分析
Keywords
‘Lu Shi Wei'
Panacis Quinquefoli Radix
Key cultivation techniques
Current status and analysis
分类号
S567.53 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于高通量测序的锈腐病西洋参转录组分析
庞玉雪
陈磊
于红霞
王洪涛
《山东农业科学》
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
UPLC法测定西洋参不同部位中皂苷类成分及质量评价研究
张燕停
任利鹏
魏晓明
于红霞
王佳佳
段媛媛
刘政波
《特产研究》
2024
0
下载PDF
职称材料
3
山东省威海地区西洋参皂苷含量分析
牛序滕
苗琳
徐钰菲
宋政建
于红霞
《特种经济动植物》
2023
0
下载PDF
职称材料
4
山东“鲁十味”中药材西洋参种植关键技术研究现状与分析
冉志芳
段婉莹
陈小莉
于红霞
张永清
郭兰萍
周洁
《中华中医药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
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