2株肠致病性大肠埃希菌与肠杆菌科诊断血清的交叉凝集情况分析

我们对从临床标本中分离出的30株经全面生化反应鉴定符合率〉99.9%的大肠埃希菌（Escherchia coli,E.coli）,用4种E.coli诊断血清和沙门菌属、志贺菌属共6种诊断血清进行了凝集试验,以了解普通E.coli菌株与各诊断血清之间是否存在交叉凝集反应。现报告如下。

威海市一例输入性新型冠状病毒奥密克戎BA.2的全基因组测序分析

目的结合高通量测序技术和生物信息学技术,从新冠肺炎感染者咽拭子标本中直接测定病毒基因组序列,并从基因组水平上了解输入性新型冠状病毒(novel coronavirus 2019,2019-nCoV)的全基因组特征和变异情况,从而进行病毒的分型和溯源。方法选取1例威海市境外输入性2019-nCoV感染病例的咽拭子标本,采用2019-nCoV全基因组序列捕获结合NGS高通量测序技术进行全基因组测序。所得测序数据使用病毒变异分析软件,进行序列拼接和变异位点分析;对病毒进行分型,并构建进化树,追踪病毒的潜在来源。结果成功获得2019-nCoV的全基因组序列,基因组全长29808 bp,平均测序深度达5013.11×;全基因组共发生51处核苷酸突变,分布于8个编码区(ORF1ab、S、ORF3a、E、M、ORF6、ORF7a和N);病毒分型结果显示病毒属于奥密克戎BA.2型;进化分析显示,该病毒序列与来自日本的参考株共同处于同一分支。结论本研究构建的测序方法和分析结果可用于2019-nCoV的变异分析和病例溯源,对COVID-19疫情防控具有重要意义。

恒温氧化还原反应-氢化物原子荧光法测定水中总硒含量

目的 建立一种操作简单、准确的氢化物原子荧光法测定水中总硒含量的方法,为实现样品消解的标准化操作流程提供参考。方法 在恒温氧化还原反应-氢化物原子荧光法过程中,取10.00 mL水样于锥形管中,采用聚丙烯锥形管,在水样中加入硝酸,110℃恒温消解水中硒15 min,加入还原剂盐酸和硫脲溶液,110℃恒温消解35 min,冷却,加水至刻度,完成样品消解。测定检出限、精密度、加标回收率,计算相对标准偏差(RSD),进行标准物质测定。确定最优实验条件后,用氢化物原子荧光法测定总硒含量。结果 在优化条件下,四价硒线性范围为1.00~10.00 μg/L,r=0.9997;四价硒加标回收率为97.98%~101.00%,相对标准偏差(RSD)为0.99%~1.28%;六价硒加标回收率为96.32%~98.82%,RSD为0.84%~1.44%;标准物质测定值在可信范围内;最低检出限0.20 μg/L。结论 本实验中氢化物原子荧光法测定水中四价硒、六价硒的方法优化后,测定结果的线性、检出限、精密度、准确度均满足方法学要求,恒温消解法能准确测定水中总硒含量,操作简单。

国内首起新型冠状病毒Gamma变异株的全基因组测序分析

目的对引发2022年5月山东省荣成市COVID-19疫情的SARS-CoV-2进行全基因组测序,分析核苷酸和氨基酸变异情况并进行溯源。方法应用高通量测序技术对15份来源于某水产进口公司相关COVID-19聚集性病例鼻咽拭子样本和3份环境样本进行病毒全基因组测序。使用病毒序列和变异分析软件,对测序原始数据进行全基因组序列拼接和变异位点分析并对病毒进行分型,利用进化分析软件构建系统发育树,并结合病例流行病学调查结果,追溯病毒的潜在来源。结果成功获得13条来源于病例样本的SARS-CoV-2全基因组序列,长度为29653~29780 bp,平均测序深度为1756~6565 X,基因组覆盖度为99.20%~99.63%;Pangolin分型结果显示13个SARS-CoV-2基因组均属于VOC/Gamma(P.1.15)分支;与武汉参考株(NC_045512.2)相比,13条SARS-CoV-2全基因组序列分别存在40~41个核苷酸突变位点;在7个蛋白质结构域(ORF1a、ORF1b、S、ORF3a、ORF8、ORF9b及N蛋白),存在23~24个氨基酸变异位点。进化分析显示该病毒序列与来自阿根廷的参考株(EPI_ISL_4082233)共处于同一子分支上。结论本研究从荣成市一起冷链进口水产关联的COVID-19聚集性疫情病例样本中测序获得13个Gamma变异株全基因组序列,及时将病毒来源指向于2021年的南美进口海鲜。本研究所采用的测序方法和分析结果可以为SARS-CoV-2的变异分析和病例溯源提供参考,也提示我们SARS-CoV-2在冷链物品表面的存活与传播能力不容小觑,有待进一步探索。

济南地区市售猪肾中镉的分布特征

为了解猪肾中镉的分布特征。于2018年3月采自济南市不同集贸市场和超市的20份猪肾样品用石墨炉原子吸收光谱法分别测定肾皮质、肾髓质、肾盂黏膜及邻近脂肪组织中镉的含量。结果显示肾皮质镉含量中位数为0.94 mg/kg,范围为0.028～22 mg/kg;肾髓质镉含量中位数为0.84 mg/kg,范围为0.013～9.1 mg/kg,肾盂黏膜及邻近脂肪组织镉含量中位数为0.38 mg/kg,范围为0.006 0～4.0 mg/kg。提示肾皮质、肾髓质、肾盂黏膜及邻近脂肪组织中镉蓄积存在差异,肾盂黏膜及邻近脂肪组织<肾髓质<肾皮质。

1例境外输入性恶性疟配子体的检出

目的了解恶性疟配子体发生、发展原因及检出经过。方法根据流行病学调查及疟疾血检结果对1例疟疾案例进行分析。结果报道了1例境外输入性恶性疟病例的诊疗情况。患者非洲务工1年,感染疟疾数次,回国前再次发病并在当地抗疟治疗6 d,10 d后回国再次感到发热、出汗、头痛。到乳山疾控中心采血镜检,后经威海市疾控中心复核及山东省寄生虫病防治研究所疟疾诊断参比实验室复核,确诊为恶性疟。因为及时给予患者科泰复药物治疗,痊愈,3个月随访,未见异常。结论由于近几年对疟疾认识的提高,早发现早治疗使得恶性疟很少发展成配子体,因此恶性疟配子体的检出显得弥足珍贵。