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乌鳢globin基因家族的鉴定及在鳃和鳃上器官中的表达模式分析
1
作者
陶泽鑫
李建龙
+4 位作者
温海深
李超
孙冬磊
陈基伟
李昀
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期141-151,共11页
为了探究珠蛋白(Globin)在具有耐低氧和空气呼吸能力的乌鳢(Channa argus)中发挥的作用,本文对乌鳢的globin基因家族进行研究。在基因组中鉴定得到18个globin基因,分属于Hb、Mb、Ngb和Cygb四个亚家族,其中Hb亚家族拷贝数最多,达14个,其...
为了探究珠蛋白(Globin)在具有耐低氧和空气呼吸能力的乌鳢(Channa argus)中发挥的作用,本文对乌鳢的globin基因家族进行研究。在基因组中鉴定得到18个globin基因,分属于Hb、Mb、Ngb和Cygb四个亚家族,其中Hb亚家族拷贝数最多,达14个,其余各亚家族仅有1~2个拷贝。系统进化分析表明,乌鳢globin基因与硬骨鱼类聚为一枝,在进化上较为保守。对乌鳢globin基因结构分析得到4种保守结构域和5个motif。利用转录组测序技术对仔稚鱼(受精后3~8 d)和幼鱼(4月龄)的鳃和鳃上器官中globin基因进行表达量检测。在仔稚鱼中,hbae1(包括hbae1.1、hbae1.2和hbae1.3)、hbb2(包括hbb2.1、hbb2.2和hbb2.4)和hbaa的表达量在鳃上器官发育过程中呈显著升高趋势,而hba1和hbb1的表达量则显著降低。在幼鱼中,在空气暴露胁迫后,hbb2.2和cygb的表达量在鳃和鳃上器官中均发生显著变化,hbae1.1、hbae1.2和hbba的表达量在鳃中发生显著变化,hbae1.3和hbb2.1的表达量在鳃上器官中发生显著变化。这些在鳃上器官发育过程中和空气暴露胁迫中表达量出现显著变化的globin基因可能在乌鳢空气呼吸及低氧胁迫中发挥了生物学功能。
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关键词
乌鳢
空气呼吸
globin基因
空气暴露
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题名
乌鳢globin基因家族的鉴定及在鳃和鳃上器官中的表达模式分析
1
作者
陶泽鑫
李建龙
温海深
李超
孙冬磊
陈基伟
李昀
机构
海水养殖教育部重点实验室(中国
海洋
大学)
威海海洋职业学院海洋生物系
青岛农业大学
海洋
科学与工程
学院
出处
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期141-151,共11页
基金
山东省鱼类产业技术体系项目(SDAIT-12-03)
国家自然科学基金项目(32072947)资助。
文摘
为了探究珠蛋白(Globin)在具有耐低氧和空气呼吸能力的乌鳢(Channa argus)中发挥的作用,本文对乌鳢的globin基因家族进行研究。在基因组中鉴定得到18个globin基因,分属于Hb、Mb、Ngb和Cygb四个亚家族,其中Hb亚家族拷贝数最多,达14个,其余各亚家族仅有1~2个拷贝。系统进化分析表明,乌鳢globin基因与硬骨鱼类聚为一枝,在进化上较为保守。对乌鳢globin基因结构分析得到4种保守结构域和5个motif。利用转录组测序技术对仔稚鱼(受精后3~8 d)和幼鱼(4月龄)的鳃和鳃上器官中globin基因进行表达量检测。在仔稚鱼中,hbae1(包括hbae1.1、hbae1.2和hbae1.3)、hbb2(包括hbb2.1、hbb2.2和hbb2.4)和hbaa的表达量在鳃上器官发育过程中呈显著升高趋势,而hba1和hbb1的表达量则显著降低。在幼鱼中,在空气暴露胁迫后,hbb2.2和cygb的表达量在鳃和鳃上器官中均发生显著变化,hbae1.1、hbae1.2和hbba的表达量在鳃中发生显著变化,hbae1.3和hbb2.1的表达量在鳃上器官中发生显著变化。这些在鳃上器官发育过程中和空气暴露胁迫中表达量出现显著变化的globin基因可能在乌鳢空气呼吸及低氧胁迫中发挥了生物学功能。
关键词
乌鳢
空气呼吸
globin基因
空气暴露
Keywords
Channa argus
air-breathing
globin genes
air exposure
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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作者
出处
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1
乌鳢globin基因家族的鉴定及在鳃和鳃上器官中的表达模式分析
陶泽鑫
李建龙
温海深
李超
孙冬磊
陈基伟
李昀
《中国海洋大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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