2013—2014年宁夏回族自治区柯萨奇病毒A10型分离株VP1区基因特征

目的分析宁夏回族自治区（宁夏）手足口病病例中柯萨奇病毒A10型（CV-A10）分离株的基因特征。方法于2013年1月--2014年12月，利用手足口病实验室网络监测系统，采集宁夏各市、县到当地人民医院就诊的手足口病病例标本，共采集2470份，其中粪便标本450份，咽拭子2020份。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离，获得的各种毒株用兼并引物进行VPl区基因扩增和序列测定。测序结果利用Blast进行病毒型别鉴定后，对鉴定为CV—A10的所有毒株进行同源性和系统进化分析。结果共收集到非EV—A71和非CV。A16的肠道病毒标本450份，分离到CV．A1036株，其中，2013年6株，2014年30株。36株毒株间的核昔酸和氨基酸同源性分别为90．6％～100．0％和90．2％--100．0％。与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现，36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高，分别为90．2％～98．9％和95．7％--99．7％。系统进化分析显示，36株宁夏CV．AIO分离株与C基因型代表株处于同一分支。结论CV—A10是引起宁夏地区手足口病的常见病原体，本次分离到的CV—A10均属于C基因型，具有较宽的同源性范围。