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基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制
被引量:
3
1
作者
鲁迪
宋佳卉
+14 位作者
马子建
张鹏越
许磊
韦川
陈颖
周莎
朱继峰
李娅琳
赵嘉庆
朱明星
赵瑞
王海
陈晓军
赵巍
苏川
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期277-285,共9页
目的观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(miRNA)表达水平、探讨miRNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序...
目的观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(miRNA)表达水平、探讨miRNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序平台进行高通量测序。分别采用miRBase数据库和miRDeep2工具进行已知miRNA注释和新miRNA预测,并进行差异分析。采用miRanda软件和TargetScan软件分别预测差异表达miRNA靶基因后取交集,进行基因本体(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,匹配可靶向决定Th17细胞和Treg细胞生成的关键转录因子(RORC和FOXP3)或重要调控通路(PI3K⁃Akt和mTOR通路)相关基因的miRNA。结果细粒棘球蚴病患者与健康对照血清中共有53个差异表达miRNA,其中47个上调表达miRNA、6个下调表达miRNA。GO富集分析显示,差异表达miRNA功能涉及DNA转录翻译、细胞成分、细胞形态、神经发育及代谢分解等过程。KEGG富集分析显示,这些差异表达miRNA靶基因涉及的主要信号通路包括MAPK、PI3K⁃Akt、mTOR等信号通路。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,有3个潜在靶向调控RORC的miRNA、15个潜在靶向PI3K⁃Akt、mTOR信号通路的miRNA。结论细粒棘球蚴感染后可使患者血清miRNA表达谱出现明显改变,差异表达miRNA可能通过靶向Th17/Treg关键转录因子或PI3K⁃Akt、mTOR通路而导致Th17/Treg免疫失衡,进而利于细粒棘球蚴在宿主体内长期寄生并慢性致病。
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关键词
细粒棘球蚴
微小RNA
辅助性T细胞17
调节性T细胞
免疫失衡
原文传递
题名
基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制
被引量:
3
1
作者
鲁迪
宋佳卉
马子建
张鹏越
许磊
韦川
陈颖
周莎
朱继峰
李娅琳
赵嘉庆
朱明星
赵瑞
王海
陈晓军
赵巍
苏川
机构
南京
医科
大学
基础
医学院
南京
医科
大学
公共卫生
学院
宁夏
医科
大学
医学
科学技术
研究
中心
、宁夏
医学
科学
研究
所
江苏省南京亿科人群健康
研究
院
宁夏常见传染病防治研究重点实验室、宁夏医科大学基础医学院
宁夏
回族自治区石嘴山市疾病预防控制中心
南京
医科
大学
国际教育
学院
出处
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期277-285,共9页
基金
西藏自治区科技计划项目(XZ201703⁃GB⁃01)
宁夏回族自治区重点研发项目(2018BEG02003)
宁夏回族自治区自然科学基金(2018AAC03209)。
文摘
目的观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(miRNA)表达水平、探讨miRNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序平台进行高通量测序。分别采用miRBase数据库和miRDeep2工具进行已知miRNA注释和新miRNA预测,并进行差异分析。采用miRanda软件和TargetScan软件分别预测差异表达miRNA靶基因后取交集,进行基因本体(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,匹配可靶向决定Th17细胞和Treg细胞生成的关键转录因子(RORC和FOXP3)或重要调控通路(PI3K⁃Akt和mTOR通路)相关基因的miRNA。结果细粒棘球蚴病患者与健康对照血清中共有53个差异表达miRNA,其中47个上调表达miRNA、6个下调表达miRNA。GO富集分析显示,差异表达miRNA功能涉及DNA转录翻译、细胞成分、细胞形态、神经发育及代谢分解等过程。KEGG富集分析显示,这些差异表达miRNA靶基因涉及的主要信号通路包括MAPK、PI3K⁃Akt、mTOR等信号通路。在差异表达变化倍数居前20位的miRNA中,有3个潜在靶向调控RORC的miRNA、15个潜在靶向PI3K⁃Akt、mTOR信号通路的miRNA。结论细粒棘球蚴感染后可使患者血清miRNA表达谱出现明显改变,差异表达miRNA可能通过靶向Th17/Treg关键转录因子或PI3K⁃Akt、mTOR通路而导致Th17/Treg免疫失衡,进而利于细粒棘球蚴在宿主体内长期寄生并慢性致病。
关键词
细粒棘球蚴
微小RNA
辅助性T细胞17
调节性T细胞
免疫失衡
Keywords
Echinococcus granulosus
microRNA
T helper type 17
regulatory T cell
Immune imbalance
分类号
R532.32 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制
鲁迪
宋佳卉
马子建
张鹏越
许磊
韦川
陈颖
周莎
朱继峰
李娅琳
赵嘉庆
朱明星
赵瑞
王海
陈晓军
赵巍
苏川
《中国血吸虫病防治杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
原文传递
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