2013-2014年宁夏甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异状况及序列分析

目的了解甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒的检测情况和血凝素(HA)基因变异情况。方法对宁夏流感监测哨点医院采集的流感样病例(ILI)标本采用RT-PCR方法进行核酸检测,对核酸检测阳性标本进行病毒分离;对甲型H1N1毒株提取病毒RNA,通过RT-PCR反应扩增HA1并测序,测定的序列利用生物信息软件进行分析。结果宁夏流感网络实验室共检测ILI标本6 122份,核酸检测阳性数917份,其中甲型H1N1498份,占54.31%,分离甲型H1N1毒株126株;变异氨基酸多数位于HA蛋白表面,其中部分位于抗原决定簇;关键位点第222位没有变化。结论 2013-2014年度,宁夏地区流行的流感毒株主要为甲型H1N1,遗传进化分析表明甲型H1N1病毒发生了一定程度的变异,造成2013-2014年在宁夏地区的再次流行。

2株H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因组序列分析

目的了解2株H9N2亚型禽流感病毒(AIV)毒株A/环境/宁夏/27740/2018(简称NX40)和A/环境/宁夏/27748/2018(简称NX48)血凝素(HA)基因变异情况。方法对全区禽流感监测点采集的环境标本采用Real time RT-PCR方法进行核酸检测,对核酸检测阳性标本进行病毒分离。对H9N2亚型分离株提取RNA,通过RT-PCR反应扩增HA基因片段并测序,测定的序列利用生物信息软件进行分析。结果 2株毒株的HA基因含有8个潜在的糖基化位点,226位的氨基酸残基均为Gln,裂解位点为RSSRGLF,受体结合位点为YWTNTLY,HA基因核苷酸同源性为88.2%~96.6%。结论 2株分离株对人的感染力没有增强,为典型的低致病力禽流感病毒;与参考株比较发生了一定程度的变异,2株毒株亲缘关系较近,与近年国内其他地区分离株同源性较高。

2013—2014年宁夏回族自治区柯萨奇病毒A10型分离株VP1区基因特征

目的分析宁夏回族自治区（宁夏）手足口病病例中柯萨奇病毒A10型（CV-A10）分离株的基因特征。方法于2013年1月--2014年12月，利用手足口病实验室网络监测系统，采集宁夏各市、县到当地人民医院就诊的手足口病病例标本，共采集2470份，其中粪便标本450份，咽拭子2020份。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离，获得的各种毒株用兼并引物进行VPl区基因扩增和序列测定。测序结果利用Blast进行病毒型别鉴定后，对鉴定为CV—A10的所有毒株进行同源性和系统进化分析。结果共收集到非EV—A71和非CV。A16的肠道病毒标本450份，分离到CV．A1036株，其中，2013年6株，2014年30株。36株毒株间的核昔酸和氨基酸同源性分别为90．6％～100．0％和90．2％--100．0％。与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现，36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高，分别为90．2％～98．9％和95．7％--99．7％。系统进化分析显示，36株宁夏CV．AIO分离株与C基因型代表株处于同一分支。结论CV—A10是引起宁夏地区手足口病的常见病原体，本次分离到的CV—A10均属于C基因型，具有较宽的同源性范围。

趋化因子SR-PSOX/CXCL16在HIV感染者中的表达

目的总结趋化因子SR-PSOX/CXCL16在HIV感染者中的表达特点,探讨趋化因子SR-PSOX/CXCL16与HIV感染者的肿瘤与心血管疾病高患病率的关系。方法设立HIV感染者组及健康对照组,采用ELISA法检测外周血SR-PSOX/CXCL16。同时HIV感染者组的血标本经流式细胞仪检测CD4细胞,部分病人检测病毒载量。分别比较HIV感染者组及健康组、HIV感染者组中的治疗者与非治疗者、不同传染途径、不同性别的SR-PSOX/CXCL16差异;比较CD4细胞计数、病毒载量及HIV感染者年龄与SR-PSOX/CXCL16的相关性。结果 HIV感染者组SR-PSOX/CXCL16表达水平显著高于健康对照组,差异有统计学意义(P<0.001);HIV感染者组中治疗者与非治疗者、不同传染途径、不同性别的SR-PSOX/CXCL16差异无统计学意义(P均>0.05);CD4细胞计数(r=0.199),病毒载量(r=0.017),HIV感染者年龄(r=0.031)分别与SR-PSOX/CXCL16进行相关分析,均无相关性(P均>0.05)。结论 HIV感染者的肿瘤和心血管疾病的高患病率可能与SR-PSOX/CXCL16在HIV感染者中的高表达有关,与治疗与否、传染途径、性别、年龄及疾病进展均无相关。

2016-2017年宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒感染状况及重组类型分析

目的了解宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒的感染状况及其重组现象。方法研究对象为2016年1月至2017年12月在宁夏5个市10家监测点医疗机构门急诊就诊的急性胃肠炎病例,共2 334例。收集病例临床资料和患者个人信息,采集粪便标本后统一送往宁夏疾病预防控制中心,采用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测,采用逆转录PCR对诺如病毒GⅡ型阳性标本的聚合酶区和衣壳蛋白区进行扩增、测序及基因分型,用MEGA-X软件进行进化分析,并用Simplot 3.5.1和RDP4软件进行重组分析。结果2 334例病例的年龄M(P25,P75)为1.42(0.68,7.69)岁;2016和2017年分别为1 133和1 201例;男女分别为1 343和991例;诺如病毒GⅠ型阳性率为0.86%(20例),GⅡ型为14.82%(346例)。346株GⅡ型毒株中有78株重组毒株完成测序,共发现12种重组类型,其中GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney_2012和GⅡ.P12/GⅡ.3为主要流行株,分别占35.90%(28株)和32.05%(25株),其次为GⅡ.P16/GⅡ.2,占12.82%(10株);首次在宁夏检出GⅡ.P7/GⅡ.6(2株)、GⅡ.P12/GⅡ.3(6株)、GⅡ.P16/GⅡ.1(2株)、GⅡ.P16/GⅡ.2(5株)、GⅡ.Pe/GⅡ.4(7株)型重组株,均为型间重组,重组位点多位于ORF1区。结论2016-2017年宁夏诺如病毒感染以GⅡ组为主,且均为重组株,GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney_2012和GⅡ.P12/GⅡ.3为主要流行株,其次为GⅡ.P16/GⅡ.2。

2016—2017年宁夏手足口病的病原构成及流行的EV-A71和CV-A16基因特征分析

目的了解引起2016—2017年宁夏自治区(宁夏)手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成,分析主要病原体肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)的基因特征。方法分析2016—2017年宁夏HFMD的核酸检测结果,确定HFMD的病原构成;对2016—2017年宁夏上送至国家HFMD网络监测实验室的肠道病毒毒株利用RT-PCR方法扩增VP1编码区并进行基因序列测定,BLAST分析确定毒株的血清型别,同时选取EV-A71和CV-A16分离株分别构建系统进化树。结果核酸检测结果显示,2016和2017年宁夏HFMD中阳性检出率最高的病原体分别为其他肠道病毒(enterovirus,EV)(397,43.72%)和EV-A71(918,56.18%),且不同月份检测出的优势病原体有差异。2017和2016年相比HFMD的病原构成由其他EV和CV-A16为主转变成EV-A71和其他EV为主。2016—2017年宁夏上送至国家HFMD网络监测实验室的EV-A71均属于C4基因亚型的C4a进化分支,CV-A16均属于B1基因亚型的B1b进化分支。结论宁夏HFMD的病原构成中,2017年EV-A71、CV-A16和其他EV的构成与2016年相比发生了动态变化,持续开展宁夏HFMD的病原构成中EV-A71的动态变化,对指导EV-A71疫苗的使用策略、集中优势医疗资源加强救治重症病例,降低重症HFMD的病死率具有重要意义。