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基于微卫星标记对6个花鲈群体的遗传多样性分析
被引量:
8
1
作者
黄皓
范嗣刚
+5 位作者
王鹏飞
陈佳
赵超
闫路路
邱丽华
潘滢
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期99-106,共8页
为了解中国不同地理群体花鲈(Lateolabrax maculatus)的遗传结构,从花鲈基因组序列中筛选出11个具有多态性的微卫星位点,对中国沿海地区(天津、长岛、青岛、上海、厦门和北海) 6个花鲈野生群体的遗传多样性进行分析。11个微卫星位点共...
为了解中国不同地理群体花鲈(Lateolabrax maculatus)的遗传结构,从花鲈基因组序列中筛选出11个具有多态性的微卫星位点,对中国沿海地区(天津、长岛、青岛、上海、厦门和北海) 6个花鲈野生群体的遗传多样性进行分析。11个微卫星位点共检测到57个等位基因,7个微卫星位点具有高度多态性。6个群体的等位基因数(N;)为3.909 1~4.636 4,有效等位基因数(N;)为2.293 4~2.773 5,观测杂合度(H;)为0.391 3~0.456 8,期望杂合度(H;)为0.505 1~0.566 2,多态信息含量(PIC)为0.388 8~0.518 9。青岛、上海和北海群体具有高度多态性,其余群体为中度多态性。上海群体的遗传多样性最高,长岛群体和厦门群体的遗传多样性低。6个群体间的遗传分化指数(F;)为0.022 6~0.055 2,其中天津群体和北海群体间的遗传分化最大,群体间的遗传分化程度低。基因流(N;)为4.276 6~11.220 8,6个群体间的基因交流频繁;分子方差分析(AMOVA)显示群体内变异占总变异的91%,群体间变异占9%。基于个体归类的聚类分析显示6个群体的花鲈个体均被划分到2个基因型类群中,无独立的基因型类群。UPMGA聚类树显示6个群体分为两支。
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关键词
花鲈
微卫星
遗传多样性
遗传分化
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职称材料
题名
基于微卫星标记对6个花鲈群体的遗传多样性分析
被引量:
8
1
作者
黄皓
范嗣刚
王鹏飞
陈佳
赵超
闫路路
邱丽华
潘滢
机构
上海海洋大学
水产
与生命学院
中国
水产
科学研究院南海
水产
研究所/广东省渔业生态环境
重点
实验室
宁德市富发水产有限公司/大黄鱼育种国家重点实验室
出处
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期99-106,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31802281)
广东省自然科学基金项目(2018A030313137)
+2 种基金
广州市珠江科技新星项目(201906010028)
中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2020XT09,2020TD21)
中国水产科学研究院南海水产研究所中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助(2021SD11)。
文摘
为了解中国不同地理群体花鲈(Lateolabrax maculatus)的遗传结构,从花鲈基因组序列中筛选出11个具有多态性的微卫星位点,对中国沿海地区(天津、长岛、青岛、上海、厦门和北海) 6个花鲈野生群体的遗传多样性进行分析。11个微卫星位点共检测到57个等位基因,7个微卫星位点具有高度多态性。6个群体的等位基因数(N;)为3.909 1~4.636 4,有效等位基因数(N;)为2.293 4~2.773 5,观测杂合度(H;)为0.391 3~0.456 8,期望杂合度(H;)为0.505 1~0.566 2,多态信息含量(PIC)为0.388 8~0.518 9。青岛、上海和北海群体具有高度多态性,其余群体为中度多态性。上海群体的遗传多样性最高,长岛群体和厦门群体的遗传多样性低。6个群体间的遗传分化指数(F;)为0.022 6~0.055 2,其中天津群体和北海群体间的遗传分化最大,群体间的遗传分化程度低。基因流(N;)为4.276 6~11.220 8,6个群体间的基因交流频繁;分子方差分析(AMOVA)显示群体内变异占总变异的91%,群体间变异占9%。基于个体归类的聚类分析显示6个群体的花鲈个体均被划分到2个基因型类群中,无独立的基因型类群。UPMGA聚类树显示6个群体分为两支。
关键词
花鲈
微卫星
遗传多样性
遗传分化
Keywords
Lateolabrax maculatus
Microstatelites
Genetic diversity
Genetic differentiation
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于微卫星标记对6个花鲈群体的遗传多样性分析
黄皓
范嗣刚
王鹏飞
陈佳
赵超
闫路路
邱丽华
潘滢
《南方水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
8
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