tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制

随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定。tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和tRNA应激诱导RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA。为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等。同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具。大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式。随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物。因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述。

转录因子在肝癌中调节作用的研究进展

肝癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,由于预后不良而具有较高死亡率,其中,肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是肝癌最常见的类型。转录因子是在细胞转录过程中通过与基因启动子DNA序列结合而影响靶基因表达的调节因子。研究表明,转录因子通过多种方式调节肝癌发生发展的各个方面,起着重要的作用。本文主要围绕转录因子在肝癌发生发展相关过程的功能和作用进行总结与展望,包括引发肝癌的病毒感染过程,肝癌细胞的增殖、凋亡、转移和活力,以及作为肝癌治疗和预后的生物标记物等多个方面。

胃癌中长非编码RNA调节网络的研究进展

长非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200 nt、因缺少完整的阅读编码框而不编码蛋白质的功能性RNA分子。胃癌是我国常见的恶性肿瘤之一,其发病率仅次于肺癌,居我国第二位。越来越多的证据表明,lnc RNA在转录、转录后和表观遗传水平调控基因的表达及稳定性,参与肿瘤的发生和发展,对于评估癌前病变的发生、判断化疗的疗效和胃癌的预后具有重要意义。该文就近年来关于lnc RNA调节网络对胃癌发生发展机制的作用研究进展作一综述。