肝细胞癌患者术后复发相关的6号染色体短臂拷贝数变异及靶基因

目的探讨染色体6p拷贝数变异（CNA）与肝细胞癌（HCC）术后肝内复发的相关性，探讨相关靶基因。方法采用微阵列比较基因组杂交和表达芯片分别检测CNAs和基因表达。6p CNAs与66例HCC复发的相关性采用生存分析。117例HCC的差异表达基因分析采用Mann-Whitney U检验。结果在66例HCC中，46例（69．7％）呈现6p CNAs。在8个高频（发生率〉20％）CNAs中，6p21．1增益是复发（HR=2．3，95％CI=1．1～5．1，P〈0．05），特别是近期复发（≤1年；HR=3．5，95％CI=1．4～8．2，P〈0．05）的独立预后因素。片段内BYSL、RPL7L1等9个基因表达水平在6p21．1增益组高于无增益组（均P〈0．05）。BYSL高表达与肿瘤直径大于6cm、血管侵犯和高肿瘤分期有关（均P〈0．05）；RPL7L1高表达与血管侵犯和高肿瘤分期有关（均P〈0．05）。结论6p21．1增益是HCC术后肝内复发特别是近期复发的独立预后因素，BYSL和RPLTL1可能是靶基因。

4号染色体长臂拷贝数变异及复发表征基因与肝癌复发

目的研究4号染色体长臂（4q）拷贝数变异（CNA）与肝细胞癌（HCC）术后复发的相关性，并探讨复发表征基因。方法纳入179例HCC，其中66例有术后复发随访资料。采用微阵列比较基因组杂交和表达芯片分别检测CNA和基因mRNA表达差异；CNA与复发相关性分析采用生存分析；癌与配对癌旁肝组织间拷贝数相关性采用Spearman检验；基因表达水平的组间比较采用Mann。WhitneyU检验。结果片段性或全臂4q丢失发生率为63．6％（42／66）。生存分析显示，8个非纯合丢失片段与HCC复发无关（P〉0．05）；而4q13．2纯合缺失是HCC复发的独立预后因素[风险比（HR）=2．26，95％可信区间（CI）=1．13～4．50，P〈0．05]。癌和配对癌旁肝组织的4q13．2拷贝数具有一致性（r=0．868，P〈0．05）。定位4q13．2基因的CNA与表达联合分析显示，基因纯合缺失HCC的UGT2817表达水平较非纯合缺失HCC及癌旁肝组织显著降低（P〈0．05）；UGT2817表达阴性HCC的血管侵犯发生率显著高于表达阳性者（P〈0．05）。结论遗传性4q13．2纯合缺失是HCC术后复发的独立预后因素，UGT2817可能是该复发相关片段的表征基因。

染色体8p拷贝数变异与肝细胞癌术后总生存的关系及靶基因筛选

目的 探讨染色体8p拷贝数变异（CNA）与肝细胞癌（HCC）术后生存的关系,筛选生存相关CNA内的潜在靶基因.方法 纳入HCC手术患者187例,其中66例有完整术后生存随访资料.分别采用Agilent 244K微阵列比较基因组杂交和Affymetrix U133 Plus2.0基因芯片方法检测8p CNA和基因表达差异.结果 8p12丢失（31/66,47％）是HCC术后生存的独立预后因素.8p12丢失患者的死亡风险为无丢失患者的4.1倍（95％CI=1.8～9.4,P＜0.05）.8p12片段内基因丢失与mRNA表达的联合分析显示,基因丢失HCC组TMEM66、DCTN6和MAK16 3个基因的mRNA表达水平显著低于基因无丢失HCC组（均P＜0.05）和癌旁肝组（均P＜0.05）.结论 染色体8p12丢失是HCC患者术后生存不良的独立预后因素.TMEM66、DCTN6和MAK16基因拷贝数依赖性表达下调可能参与了HCC不良预后的演进过程.

染色体17q区拷贝数变异与肝细胞癌总生存的相关性及靶基因的筛选

目的探讨染色体17q拷贝数变异（copynumbervariation，CNV）与肝细胞癌（hepatocellularcarcinoma，HCC）术后总生存（overallsurvival，OS）的相关性以及预后相关CNV内的潜在靶基因。方法纳入HCC手术患者174例，其中66例有完整术后OS随访资料。应用AgilentHu-244A微阵列比较基因组杂交和AffymetrixU133Plus2．0表达芯片分别检测染色体17qCNV和基因表达。结果17q25．1—25．3增益与0S显著相关（P一0．00002）。多因素Cox回归分析显示，17q25．1-25．3增益是0S的独立不良预后因素（HR：3．17，95％CI：1.39～7。26，P=0。006）。基因CNV与mRNA表达的联合分析显示，SLC9A3R1、GRB2、TK1等18个基因mRNA表达水平在基因增益HCC中显著高于基因无增益HCC（FDR-q〈0．05，P〈0．01）及癌旁肝组织（P〈0．01）。结论17q25．1.25．3增益与HCC不良预后有关，可作为HCC的一个预后预测因子。SLC9A3R1、GRB2、TK1基因可能是17q25．1-25．3增益的潜在靶基因。