生物信息学和网络药理学分析槲皮素靶向BIRC5抑制胶质母细胞瘤的增殖并影响预后

目的:本文旨在通过生物信息学和网络药理学方法分析影响胶质母细胞瘤预后关键基因和潜在中药靶点。方法:从基因表达数据库(GEO)获取脑胶质母细胞瘤数据集,GEO2R在线分析得到胶质瘤和正常脑组织之间差异基因。通过Venn图取三个差异基因集交集,共筛选出共有差异基因(DEGs),并进行GO和KEGG分析富集DEGs的分子功能和信号通路。将差异基因映射入STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape软件筛选Hub基因。GEPIA2数据库分析Hub基因转录表达及预后。TCMSP数据库获取车前子、丹参、金银花、连翘四种中药的生物信息并通过设置药物动力学标准获得活性组分,再通过perl软件从差异基因中获取对应的靶点基因,Cytoscape软件构建“中药成分-DEGs靶点”蛋白质互作网络,分析节点枢纽筛选出关联度较高的靶点基因和活性成分,与Hub基因对比获取最终的潜在关键基因和中药成分,在AutoDock和PyMol软件中进行中药成分和关键基因的分子对接验证。结果:下载得到三个数据库GSE14805、GSE29796、GSE35493,进行GEO2R分析和交集后共得到193个共有的差异表达基因,其中上调基因148个,下调基因45个,并借助Cytoscape软件获取蛋白质互作网络并筛选到15个Hub基因。GO和KEGG分析提示Hub基因主要参与细胞周期、细胞外基质的生物学过程和细胞组分中的细胞粘附连接、粘着斑及胞浆。通过网络药理学分析,建立活性成分–靶点基因相互作用网络后,筛选出潜在的治疗靶点BIRC5和靶向治疗胶质母细胞瘤的中药活性成分槲皮素。分子对接结果显示BIRC5蛋白受体和中药成分配体结合较稳定且有氢键相互作用的形成。结论:通过生物信息学和网络药理学方法分析提示槲皮素有潜在通过靶点BIRC5影响胶质母细胞瘤的增殖、侵袭和迁移,进而影响胶质母细胞瘤患者预后的作用,为胶质瘤治疗和新化疗药的研发提供了新思路。

亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与中国人群食管癌易感性的Meta分析

目的运用Meta分析的方法综合评价中国人群中亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性与食管癌发病的相关性。方法通过计算机文献检索中国生物医学文献数据库(CBM)和PubMed数据库,并结合文献追溯、网上查询(www.baidu.com;www.google.cn)的方法,收集所有关于MTH-FR基因多态性与食管癌易感性的病例对照研究或队列研究。以食管癌组与对照组人群基因型分布的OR值为效应指标,各资料间进行一致性检验,以确定采用固定或随机效应模型进行合并分析。发表偏倚用漏斗图和Egger’s线性回归检验来评估。结果共有在国内外发表的相关文献10篇纳入分析,Meta分析结果表明:MTHFRC677T基因多态和MTHFRA1298C基因多态合并OR值及其95%CI分别为1.97(1.69,2.30),0.84(0.66,1.08)。按是否吸烟进行分层发现吸烟组中MTHFR677CT/TT基因型与食管癌有关(OR=2.57,95%CI:1.73～3.80),而不吸烟组中未见MTHFR677CT/TT基因型与食管癌存在关联(OR=1.33,95%CI:0.94～1.88)。结论中国人群MTHFRC677T基因多态性与食管癌易感性有关,MTHFRA1298C基因多态性与食管癌易感性无统计学关联。吸烟可能会增加MTHFRC677T基因型个体患食管癌的危险性。

小肝癌射频消融术与手术切除术疗效的Meta分析

目的比较小肝癌射频消融术(radiofrequency ablation,RFA)与手术切除术的临床疗效。方法通过计算机检索Pubmed数据库、万方数据库、中国全文期刊数据库和维普数据库,并结合文献追溯、网上查询(www.baidu.com;www.google.com)的方法,收集关于RFA与手术切除术治疗小肝癌的临床对照研究文献,并按Cochrane协作网推荐的方法对符合纳入标准的12个研究共1639例病人进行Meta分析,发表偏倚用漏斗图评估。结果 RFA与手术切除治疗小肝癌后1、3年总生存率相似(P>0.05);但手术切除在提高术后1、3年无瘤生存率方面优于RFA(P<0.05);RFA术后并发症发生率明显低于手术治疗(P<0.05)。结论虽然RFA治疗小肝癌无瘤生存率低于手术切除术,但其远期总体生存率与手术切除治疗相近,且并发症发生率低,可作为小肝癌的首选治疗方法。

结核感染中IL-23R mRNA表达水平对Th17/IL-17免疫应答的影响

目的分析白介素23受体(interleukin 23 receptor,IL-23R)对结核感染中辅助型T细胞17(T helper cell 17,Th17)免疫应答的影响,探讨IL-23R在肺结核(tuberculosis,TB)发病机制中的作用。方法选取2015年5~10月于北京胸科医院住院的21名活动性肺结核病人(active tuberculosis,ATB),2015年5~7月于北京昌平区结防所结核病体检的21名结核潜伏感染者(latent tuberculosis infection,LTBI)和21名健康对照(healthy donor,HD)为研究对象;分离外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC),并做培养;检测PBMCs中IL-23R mRNA表达水平和PBMCs上清中IL-23和IL-17A水平;比较各组IL-23R mRNA表达水平,分析IL-23R表达水平对IL-17A水平的影响。结果 IL-23R mRNA表达水平:ATB组低于LTBI组(Z=-2.528,P=0.011),ATB组高于HD组(Z=-3.849,P<0.001);IL-17A水平:ATB组低于LTBI组(t=2.238,P=0.031),ATB组高于HD组(t=4.733,P<0.001);IL-23水平在三组中的差异无统计学意义(F=0.432,P=0.651);在ATB患者中,IL-23R mRNA表达水平与IL-17A水平呈正相关(r_s=0.438,P=0.047)。结论结核分支杆菌感染中,IL-23R的表达水平对Th17细胞介导的免疫应答起到调节作用,可能影响到TB的易感性和感染转归。