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题名家蚕eIF2α全长cDNA克隆及生物信息学分析
被引量:2
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作者
高贵田
陈克平
姚勤
徐家萍
王林玲
陈慧卿
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机构
江苏大学生命科学研究院
安徽省农业科学研究院蚕桑研究所
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出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期1031-1037,共7页
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基金
国家"973"项目(2005CB121006)
江苏大学高级人才基金(1291180009)
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文摘
目的克隆家蚕eIF2α全长cDNA,分析家蚕抗BmDNV-Z品系、感性品系eIF2α的点突变。方法利用荧光差异显示技术,在易感浓核病毒中国镇江株(BmDNV-Z)的家蚕品系华八中获得感性特异条带G13-1b650,通过电子延伸,设计特异引物验证。结果克隆了家蚕eIF2α(BmeIF2α)全长cDNA。其全长为1100bp(GenBank登录号:DQ073458),ORF框为999bp,编码332个氨基酸。BmeIF2α蛋白与草地贪夜蛾eIF2α蛋白同源性高达94.3%。具有保守的磷酸化位点S(51)R(52)R(52)R(54)R(56)K(60)R(63)。BmeIF2α有推定的3个蛋白激酶C磷酸化、5个酪氨酸激酶磷酸化、9个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化、3个依赖cAMP与cGMP蛋白激酶磷酸化位点,2个酪氨酸硫酸盐化位点,1个糖基化位点。结论家蚕易感品系的eIF2α在113~127位的“HVAELLHYETSEQSE”为酪氨酸硫酸盐化位点,而完全抗性品系eIF2α发生C378→T突变,导致Ser126→Leu,缺少了113~127位的酪氨酸硫酸盐化位点。
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关键词
家蚕
EIF2Α
荧光差异显示
生物信息学分析
酪氨酸硫酸盐化
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Keywords
Bombyx mori
eIF2α
FDD
Bioinformatical analysis
Tyrosine-sulfated
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
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