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1例人感染腺病毒55型病原体的分离鉴定及进化分析
被引量:
1
1
作者
曹孟婵
张其威
+3 位作者
金爱武
刘敏鸿
李贤相
徐四清
《国际病毒学杂志》
2018年第3期188-192,共5页
目的对1例人感染腺病毒55型病原体进行分离鉴定及进化分析。方法选取2015年5月安庆市某流感监测哨点医院采集的一例被诊断为急性上呼吸道感染患者的咽拭子标本作为研究样本,提取标本总核酸,采用人腺病毒通用引物进行real—time荧光定...
目的对1例人感染腺病毒55型病原体进行分离鉴定及进化分析。方法选取2015年5月安庆市某流感监测哨点医院采集的一例被诊断为急性上呼吸道感染患者的咽拭子标本作为研究样本,提取标本总核酸,采用人腺病毒通用引物进行real—time荧光定量PCR检测。将检出的阳性标本感染Hep-2细胞进行病毒分离。对成功分离的腺病毒毒株进行六邻体基因的扩增、纯化并测序。测序结果提交GeneBank上Blast,同源分析确定型别、制作系统进化树以及分析六邻体基因和氨基酸序列。结果对咽拭子标本中的病毒核酸进行荧光定量PCR检测,结果显示,腺病毒核酸DNA检测呈阳性(Ct〈24)。同源比对结果显示,该株的六邻体(Hexon)基因与辽宁株、江苏株、河北株、山西株、安庆株(GenBank号分别为KP896483、KX289874、KP896478、FJ643676、KP279748)的同源性可达100%,与安徽株(KC551973)可达99.96%,存在一个核苷酸C→T的无义突变。进一步的分析显示,该株与参考株在系统发生树上处于同一进化分支,Hexon蛋白氨基酸的同源性为100%。结论此ADR标本由人腺病毒55型感染引起,其Hexon蛋白氨基酸没有出现变异。
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关键词
人腺病毒
核酸序列同源性
流感
进化分析
原文传递
题名
1例人感染腺病毒55型病原体的分离鉴定及进化分析
被引量:
1
1
作者
曹孟婵
张其威
金爱武
刘敏鸿
李贤相
徐四清
机构
安徽省安庆市疾病预防控制中心微生物检验科
南方医
科
大学公共卫生学院
出处
《国际病毒学杂志》
2018年第3期188-192,共5页
文摘
目的对1例人感染腺病毒55型病原体进行分离鉴定及进化分析。方法选取2015年5月安庆市某流感监测哨点医院采集的一例被诊断为急性上呼吸道感染患者的咽拭子标本作为研究样本,提取标本总核酸,采用人腺病毒通用引物进行real—time荧光定量PCR检测。将检出的阳性标本感染Hep-2细胞进行病毒分离。对成功分离的腺病毒毒株进行六邻体基因的扩增、纯化并测序。测序结果提交GeneBank上Blast,同源分析确定型别、制作系统进化树以及分析六邻体基因和氨基酸序列。结果对咽拭子标本中的病毒核酸进行荧光定量PCR检测,结果显示,腺病毒核酸DNA检测呈阳性(Ct〈24)。同源比对结果显示,该株的六邻体(Hexon)基因与辽宁株、江苏株、河北株、山西株、安庆株(GenBank号分别为KP896483、KX289874、KP896478、FJ643676、KP279748)的同源性可达100%,与安徽株(KC551973)可达99.96%,存在一个核苷酸C→T的无义突变。进一步的分析显示,该株与参考株在系统发生树上处于同一进化分支,Hexon蛋白氨基酸的同源性为100%。结论此ADR标本由人腺病毒55型感染引起,其Hexon蛋白氨基酸没有出现变异。
关键词
人腺病毒
核酸序列同源性
流感
进化分析
Keywords
Human adenoviruses
Nucleic acid sequence homology
Influenza
Phylogenetic analysis
分类号
R512.7 [医药卫生—内科学]
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
1例人感染腺病毒55型病原体的分离鉴定及进化分析
曹孟婵
张其威
金爱武
刘敏鸿
李贤相
徐四清
《国际病毒学杂志》
2018
1
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