安徽省2022年小兽携带汉坦病毒基因序列分析

目的了解安徽省小兽携带汉坦病毒情况及病毒基因型特征。方法2021年9月-2022年12月,安徽省按照《全国病媒生物病原学监测方案(试行)》采集小兽样本,运用反转录实时荧光定量PCR方法检测小兽肺标本汉坦病毒核酸,对阳性标本进行S片段全长扩增、测序及基因序列分析。结果全省16个地市共检测4075份样本,包括8种小兽,其中褐家鼠、小家鼠、黄胸鼠和黑线姬鼠为优势种,分别占32.15%、21.87%、21.72%和20.86%。汉坦病毒核酸阳性率为1.47%(60/4075),包含汉滩病毒和首尔病毒。60份阳性标本通过交叉PCR法扩增获得19条S序列,遗传进化分析显示汉滩病毒属于H5亚型,首尔病毒为S3亚型,序列之间核苷酸相似性为72.00%~100%,氨基酸相似性为83.00%~100%。结论安徽省小兽中存在汉滩病毒和首尔病毒感染,应加强对小兽汉坦病毒的监测工作,为肾综合征出血热传染病防控提供科学依据。