安徽省2013-2018年活禽市场H9N2亚型禽流感病毒血凝素基因遗传特征

目的分析2013年-2018年安徽省外环境中H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIVs)血凝素(hemagglutinin,HA)基因变异特征。方法将所有安徽省禽流感外环境监测点搜集的H9N2亚型核酸阳性样本接种鸡胚分离病毒,病毒RNA逆转录为cDNA后用特异性引物进行扩增,聚合酶链式反应产物通过基因测序后获得HA基因序列,应用分子生物学软件进行分析;使用DATAMONKEY在线服务器进行基因选择压力分析,并使用SWISS-MODLE软件构建分子突变三维构象。结果获得33株H9N2 AIVs属于h9.4.2.5进化分支,受体结合位点183、226和227位置分别突变为N、L和M,189和190位置存在多样性;2015年以后分离的毒株均携带6个糖基化位点;选择压力分析得出160位置承受较大的正向选择压力,至少呈现7种空间构象。结论安徽省外环境中存在的H9N2亚型AIVs具有感染哺乳动物的分子特征并具备抗原漂移能力,需密切关注该病毒的分子变异特征。

甘肃省首例人感染H7N9流感病毒分子特征分析

目的分析甘肃省首例人感染H7N9禽流感病例的发现过程及病毒分子特征,为本省禽流感防控提供科学依据.方法分析病例发现过程,对病例呼吸道标本进行实时荧光定量PCR检测并对分离毒株进行测序,分析该毒株血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因特征.结果该病例明确暴露于A(H7N9)禽流感病毒污染的环境,标本经核酸检测为A(H7N9)阳性.分离病毒的HA基因和NA基因均属于欧亚系的长三角株,并与山东省和江苏省禽间分离的A(H7N9)禽流感病毒相似度较高.该病毒HA蛋白发生了G186V、T160A和Q226L基因位点突变,HA基因165~167增加了一个糖基化位点NKS,HA序列糖基化22~24、38~40、240~242、411~413和483~445位点均未发生明显改变.结论甘肃省首例人感染H7N9禽流感病毒与已报道的H7N9病毒亲缘关系较高,加强基因水平病毒变异的监测有助于疫情的科学防控.