安徽省皖南山区钩端螺旋体病流行菌群(型)更迭分析

目的 对安徽省皖南山区钩端螺旋体病 (简称钩体病 )流行菌群 (型 )更迭情况进行研究 ,掌握菌群动态 ,为钩体病防制提供科学依据。方法 分别采用细菌分离培养和显微凝集试验 (MAT)对自然人群、病人、疑似病人及宿主动物进行病原学调查和血清学分析。结果 该地区自然人群及病人血清抗钩端螺旋体抗体现以赛罗群棉兰型为主 ,其阳性率分别为 3 4.13 %和 2 5 .82 %。结论 皖南山区流行菌群 (型 )与 2 0世纪 90年代相比出现更迭现象 ,从黑线姬鼠肾组织标本中新分离出赛罗群棉兰型钩体菌株 ,啮齿动物仍是该地区钩体病的主要宿主 ,水牛是棉兰型钩体病宿主之一。

安徽省2株人感染H9N2流感病毒基因特征

目的分析2015年安徽省2株人感染H9N2禽流感病毒分离株全基因组特征。方法对安徽省2015年4月和9月流感监测网络实验室先后发现并确诊的2例H9N2禽流感病毒感染病例及其病毒分离株全基因组序列进行分析，使用Mega6．0等软件解析2株H9N2毒株全基因组特征。结果安徽省首次报道人感染H9N2禽流感病毒病例，对病毒分离株分析显示，其HA和NA基因与中国2013年禽间流行的H9N2病毒高度同源，属于A／Chicken／Shanghai／F／98（H9N2）支系；而PB2和MP基因属于A／quail／HongKong／G1／97支系，与H7N9、H10N8和H6N2具有较高的相似度。氨基酸序列比对发现该2株病毒出现多个人易感倾向位点分子特征：HA蛋白发生Q226L、H183N和E190T突变，且HA裂解位点为PSRSSR＼GL排列，NA蛋白茎部发生63～65位氨基酸缺失，M2蛋白s31N突变，以及PA一100A、PA一356R和PA一409N。结论安徽省首次报道的人感染禽源H9N2流感病毒为H9N2系间重配病毒，存在多个人易感位点。

安徽省2018-2019年小肠结肠炎耶尔森菌分型分布及分子特征分析

目的了解2018-2019年安徽省小肠结肠炎耶尔森菌分型分布及分子特征。方法收集2018-2019年腹泻患者、动物粪便、食品等不同类型样本进行小肠结肠炎耶尔森菌的分离,对菌株进行系统生化鉴定、血清型分型、毒力基因PCR检测及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果 2 186份样本中共分离到97株小肠结肠炎耶尔森菌,主要血清型为O∶3型和O∶5型,O∶3血清型21株,占21.65%(21/97),O∶5血清型17株,占17.53%(17/97),毒力基因分布为黏附侵袭位点基因(ail+)、耐热性肠毒素A基因(ystA+)、耐热性肠毒素B基因(ystB-)、黏附素(yadA+)和yop调节子转录活化因子(virF+)占19.59%(19/97),ail-、ystA-、ystB+、yadA-和virF-占63.92%(62/97)。PFGE分子分型显示腹泻患者和宿主猪的菌株相似性≥95.00%。结论在安徽省食品、环境和部分腹泻患者中小肠结肠炎耶尔森菌分离株大多为非致病性菌株,动物宿主猪和腹泻患者中存在致病性小肠结肠炎耶尔森菌,猪体内分离的菌株与人感染密切相关,猪是小肠结肠炎耶尔森菌致病性菌株的主要宿主。

安徽省2008-2010年宋内氏志贺菌分子流行病学分析

目的对安徽省2008-2010年宋内氏志贺氏菌进行分子流行病学分析,为安徽省的菌痢检测和监测搭建分子平台。方法应用纸片扩散(kirby-bauer,K-B)法进行药物敏感试验;应用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)方法对20株宋内氏志贺氏菌进行基因分析;运用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)技术进行亲缘性分析。结果 20株宋内氏志贺菌对氟哌酸(ciprofloxacin,CIP)和先锋必(cefoperazone,CPZ)最为敏感,敏感率达100%;多重PCR结果显示除志贺毒素1(shiga toxin 1,SET1)为阴性外,其余三种基因:侵袭性质粒H抗原(invasion plasmid antigen H,ipaH)、志贺肠毒素2(shiga toxin 2,SET2)、志贺菌增殖和侵袭相关的毒力基因(invasion associated locus,ial)皆为阳性;20株菌用XbaⅠ酶切后经PFGE电泳后可分为6个主要型别。结论安徽省受试20株宋内氏志贺菌多重耐药现象严重且基因型高度一致;菌型呈多种型别并存的趋势,说明安徽省宋内氏菌的来源属于多克隆系。

安徽省一起布鲁菌病疫情的实验室诊断及病原学特征研究

目的对2014年安徽省一起人感染布鲁菌疑似患者进行表型和分子生物学检测,以明确诊断。方法对患者进行流行病学调查,采用血培养法对经试管凝集试验检测为布鲁菌抗体阳性的患者和病羊血液进行荧光PCR及细菌分离培养,应用传统方法和分子生物学方法对可疑菌落进行种型鉴定。结果 136份高危者及疑似布病患者血清抗体筛查22份阳性,31份患者、病羊和外环境采样标本经荧光PCR检测5份阳性。2株安徽省分离株经传统方法和种型特异性PCR均鉴定为羊种生物3型布鲁菌。结论从患者和病羊均分离出羊种生物3型布鲁菌,结合流行病学资料分析,安徽省此次疫情由人直接接触病羊而感染布鲁菌所致。

2011年-2012年安徽省B型流感病毒HA基因特性分析

目的分析2011年-2012年安徽省B型流感病毒流行病学特点及血凝素基因变异情况。方法收集安徽省2011年-2012年B型流感阳性标本,病毒分离培养后选取16株对其HA基因扩增并测序。结果 14株Victoria系与2009年-2012年北半球疫苗株B/Brisbane/60/2008相比,核苷酸同源性在98.5%-99.5%之间,氨基酸同源性在95.4%-99.3%之间;2株Yamagata系与疫苗株B/Wisconsin/01/2010相比,核苷酸同源性为99.3%,氨基酸同源性为99.3%,仅有1个-4个抗原位点发生变化,未出现新的变异株。结论 2011年-2012年安徽省以B型Victoria系为流行株,未发现明显变异,WHO推荐的疫苗株B/Brisbane/60/2008起到积极的预防作用。

安庆市2022—2023年发热伴血小板减少综合征病原学检测结果分析

目的分析安庆市2022—2023年发热伴血小板减少综合征(SFTS)病原学检测结果,为SFTS的科学防控提供基础资料。方法采用RT-PCR方法对安庆市医疗卫生机构临床送检的520份疑似SFTS病例血清标本开展大别班达病毒(DBV)核酸检测,采用SPSS25.0对阳性病例流行病学信息进行分析,对部分分离到的病毒株进行S基因测序并构建系统进化树。结果502份疑似SFTS病例血清样本中,DBV核酸阳性151份,阳性检出率为30.08%;其中男性阳性检出率(27.83%)与女性阳性检出率(31.72%)比为0.88∶1;各年龄组阳性检出率差异有统计学意义(χ^(2)=15.271,P=0.033),71~80岁组人群占比最高(占38.84%);农民病例占比最高(占84.77%);病例时间分布在4—10月,其中5月份病例占比最高(占27.82%);不同县(区)间的阳性检出率差异有统计学意义(χ^(2)=18.080,P=0.021),其中太湖县病例占比最高(占34.75%)。测序获得21份毒株S片段基因全长序列,其中F型10株,A型5株,E型5株,B型1株。结论安庆市及周边县(区)SFTS发病具有一定地域性和季节性,从事农务劳作的中老年群体为高危人群,DBV流行主要基因型为F型。

一起宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发病原学检测及分子溯源

目的对淮南市发生的一起宋内志贺菌暴发疫情进行病原学溯源分析,并对菌株毒力基因和耐药谱进行检测。方法采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便,进行多重病原体核酸检测和分离培养,对分离的宋内志贺菌进行毒力基因PCR检测、微量肉汤法药敏检测、脉冲场电泳和全基因组测序溯源分析。结果56份黏稀样粪便分离出38株宋内志贺菌(阳性率67.86%),血清型均为宋内志贺菌Ⅰ相;3份末梢水和井水革兰阴性菌(GN)增菌液荧光PCR检测志贺菌阳性;菌株毒力基因携带情况为侵袭性质粒抗原H(ipaH)阳性(38份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)阳性(31份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)/肠毒素2基因(sen)阳性(1份);耐药谱显示14种抗生素中9种100.00%耐药,仅亚胺培南、氯霉素、头孢他啶、环丙沙星为有效药物;36株菌XbaⅠ限制性酶切图谱带型完全一致,其中3株菌株基因组ST型分析均为ST152型;全基因组测序和分析验证了此次暴发由单一克隆群菌株引起,且揭示此次暴发分离株与数据库中3株中国菌株、1株韩国菌株聚集成一个大簇,而与其他国家的菌株距离较远。结论本起由水源污染单一宋内志贺菌克隆引起,分离株为低毒力株,呈多重耐药表型。

2016年淮南市禽流感外环境H9N2病毒基因组特征分析

目的分析淮南市2016年2—4月外环境标本中H9N2亚型禽流感病毒基因组特征。方法选取H9N2亚型荧光PCR检测核酸阳性标本(Ct值≤30),经鸡胚分离培养提取RNA,扩增8个基因节段进行全基因序列测定,分析淮南株各基因节段分子特征,构建进化树进化分析。结果淮南市外环境2株H9N2禽流感毒株血凝素(hemagglutinin,HA)基因和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因与A/Anhui-Lujiang/39/2018/H9N2人源株核苷酸同源性分别为98.2%~98.3%/97.2%~94.9%,氨基酸序列同源性为98.9%~98.8%/99.2%~98.6%,其余6个内源基因与A/Anhui/1/2013/H7N9、A/Anhui/33163/2016/H5N6高度同源;基因进化分析显示,2016年淮南市2株H9N2亚型禽流感毒株为G57基因型,淮南市2株H7N9分离株、安徽人感染A/Anhui/1/2013/H7N9和A/Anhui/33163/2016/H5N6内源基因均为G57-like基因型;HA蛋白受体结合域氨基酸S132D、K138T、T189D、V/A190T、Q226L变异,NA茎区缺失了"TEI"序列,H274Y、R292K、N294S耐药位点未发生变异,PA基因I550L,PB1基因I368V,PB2基因I504V,NS1基因P42S,M1基因N30D、T215A,M2基因耐药S31N位点均发生突变。结论淮南市活禽市场H9N2病毒与人感染H9N2安徽株A/Anhui-Lujiang/39/2018/H9N2高度同源,处于同一进化分支,均为G57基因型,可提供内源基因与人感染H7N9、H5N6亚型禽流感病毒重组;HA受体结合域氨基酸位点、NA茎区缺失序列、聚合酶活性增加,均加强病毒感染人类的能力,M2离子通道抑制剂(金刚烷烃类)耐药,NA抑制剂(磷酸奥司他韦)仍为敏感药物。

一起急性胃肠炎暴发疫情的病原分子特征分析

目的了解合肥市一起急性胃肠炎疫情的病原分子特征。方法采用实时荧光PCR(Real-time PCR)对13份肛拭标本同时进行札如病毒、诺如病毒、星状病毒核酸检测,检出的札如病毒核酸阳性标本采用传统RT-PCR扩增VP1基因片段,并测定基因序列,构建系统进化树。结果 Real-time PCR检出8份札如病毒核酸PCR阳性标本,诺如病毒、星状病毒核酸结果均为阴性。1份RT-PCR扩增产物测序成功,基因序列比对和进化分析显示为札如病毒GⅡ.3基因亚型。结论引起该起急性胃肠炎疫情的病原体为GⅡ.3型札如病毒。

新型冠状病毒肺炎“物传人”现象及环境合理消毒概述

新型冠状病毒肺炎(简称“COVID-19”)“物传人”途径备受国内外学者争议。本文通过梳理COVID-19 “物传人”案例、传播方式的差异性以及消毒方法的可能影响,进一步分析COVID-19 “物传人”途径的传播风险大小,同时探讨不同消毒剂和消毒方式的消毒效果,为进一步开展阻断COVID-19传播的研究和公共卫生实践提供科学参考。