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江西部分地区猪粪便戊型肝炎病毒核酸检测及序列分析 被引量:2
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作者 谢宝东 何后军 潘金发 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2009年第1期12-14,共3页
采集江西省A猪场2-3月龄猪粪便40份,B猪场2-3月龄猪粪便40份,利用反转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)RNA,结果表明,A猪场7份样品为阳性,阳性率17.5%。B猪场10份样品为阳性,阳性率25.0%。总... 采集江西省A猪场2-3月龄猪粪便40份,B猪场2-3月龄猪粪便40份,利用反转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)RNA,结果表明,A猪场7份样品为阳性,阳性率17.5%。B猪场10份样品为阳性,阳性率25.0%。总阳性率21.3%。对4份PCR扩增阳性产物进行纯化并测序,利用生物学软件进行序列分析和进化树绘制,4个分离株ORF2 348 bp同源性为92.1%-97.5%,为同一基因型,与HEV1、HEV2、HEV3同源性分别为70.7%-77.4%、72.5%-75.7%和71.6%-76.8%,与HEV4型的同源性79.2%-83.9%。4个分离株与HEV4型的代表株T1在同一分支上,属基因4型。与中国大陆6株猪源HEV比较,同源性为79.0%-87.3%,提示中国大陆猪源HEV的基因型比较一致,同属HEV 4型。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 RT-nPCR 基因型
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