山东省三个鲤鱼群体遗传多样性及亲缘关系的微卫星标记分析

利用微卫星标记技术对3个鲤鱼群体(DP、WS和SY)的遗传多样性及亲缘关系进行研究．结果表明．3个群体的遗传多样性总体水平较高,其中SY群体最高,WS群体次之,DP群体最低．根据基因型频率(P)检验了各位点的Hardy- Weinberg平衡情况．Fis值表明3个群体中共有32个微卫星位点的杂合度观测值过剩．3个群体间,WS和SY群体间的遗传相似系数最大(0．8320),遗传距离最小(0．1680),表明这两个群体亲缘关系较近;WS和DP群体间的遗传相似系数最小(0．8288),遗传距离最大(0．1712),表明这两个群体亲缘关系较远．

用微卫星标记分析泰山螭霖鱼的遗传多样性

本文首次对泰山螭霖鱼进行分子遗传学研究 ,以了解其遗传多样性 ,养殖群体和野生群体有无遗传差异等。共选用了 31个微卫星标记 ,经筛选 ,其中 14个能在螭霖鱼得到稳定的PCR扩增。PCR扩增产物用 12 %的非变性聚丙烯酰胺凝胶 15 0V电泳 6～ 8h后 ,银染显色 ,观察并统计分析。结果表明 :泰山螭霖鱼野生群体和养殖群体在所有的位点均有相同的等位基因 ,PAGE结果都呈直线。这说明泰山螭霖鱼野生群体和养殖群体的遗传结构无差异 ,这也证明泰山螭霖鱼为一高度纯合的群体 ,是非常难得的育种和试验材料 。

利用微卫星标记分析东平湖黄颡鱼的遗传多样性

采用27对鲤微卫星引物对山东东平湖黄颡鱼进行全基因组扫描,结果有19对引物能获得稳定的扩增条带,其中有6个微卫星位点具有多态性。对这6个位点的扩增产物进行分析,结果显示:6个位点共检测到22个等位基因,每个位点的等位基因数从2个到6个不等;平均基因纯合率为41.67%,平均多态信息含量(PIC)为0.488,平均杂合度为0.5833。这表明东平湖黄颡鱼种群结构合理,群体遗传多样性较丰富,种质资源处于安全状态。

东平湖麦穗鱼群体遗传结构的微卫星标记分析

利用微卫星标记技术,采用26对鲤微卫星引物对山东东平湖麦穗鱼进行全基因组扫描.结果表明,有13对引物能获得稳定的特异性条带(占总数的50%),其中有6个微卫星位点具有多态性(占总数的23.1%).6个多态位点共检测到22个等位基因,每个位点的等位基因数从2个到7个不等,大小在80～406bp之间;平均多态信息含量(PIC)为0.5115,平均观测杂合度(H0)为0.6812,平均期望杂合度(HE)为0.5775.研究结果表明,东平湖麦穗鱼群体遗传多样性较丰富,种群结构合理,种质资源处于安全状态.

猪肌肉生长抑制素基因侧翼区新微卫星标记的鉴定及分析

提取包含猪肌肉生长抑制素基因的BAC克隆 ,以EcoRⅠ进行酶切并回收其中大于 4kb的酶切产物 ,连接到pGEM 3zf(+)载体后得到了亚克隆。测序分析表明 ,插入片段不属于猪肌肉生长抑制素基因的一部分 ,但其中包含 13拷贝的 (TG)n重复。以该重复序列的侧翼设计引物对猪的基因组进行分析 ,得到了PCR扩增产物。对一个“双肌臀”大白猪家系进行PCR扩增及非变性聚丙烯酰胺凝胶分析的结果表明 ,该位点以并显性方式遗传 ,是一个新的微卫星标记。对莱芜猪、长白猪、大白猪、杜洛克、皮特兰、民猪和二花脸 7个品种的 381个无关个体的检测均显示该基因座只有两个等位基因 ,重复数分别为 13和 19,是一种多态性较低的微卫星标记。与包含该基因的序列(AY2 0 812 1)比对分析表明 ,该微卫星属于肌肉生长抑制素基因 (MSTN)侧翼区的一个分子标记 ,在猪肉用性状QTL的精细定位和MSTN功能分析中将发挥重要作用。

一种从鱼类肌肉组织中提取基因组DNA的简易方法

以泰山螭霖鱼、黄河鲤鱼、东平湖鲫鱼为材料,采用改进的酚-氯仿抽提法和蛋白酶K消化法提取基因组DNA,并对其进行紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、微卫星PCR扩增等方法的鉴定。结果表明,本方法提取的鱼类基因组DNA浓度为0.9～3.25μg/μL,D260nm/D280nm值为1.79～1.87,电泳条带整齐明亮,适合微卫星PCR扩增。因此,本方法能够从鱼类肌肉组织中获得较为纯净的基因组DNA,适于进一步的分子生物学研究之用。

用改进的酚-氯仿法提取鱼类基因组DNA效果的分析

提取鱼类基因组DNA的研究报道并不多见,效果也各有差异。本文以泰山螭霖鱼、东平湖鲤鱼、东平湖鲫鱼为材料,采用改进的酚-氯仿法提取基因组DNA,并进行了紫外分光光度、琼脂糖凝胶电泳、微卫星PCR扩增等方法的鉴定。结果表明,本方法提取的基因组DNA浓度在0.9μg/μL^3.25μg/μL之间,A260/A280比值在1.79~1.87之间,电泳条带整齐明亮,适合微卫星PCR扩增,且整个操作过程使用试剂较少,简单易行。

肉兔AFLP分析体系的建立和优化

以法国伊普吕肉兔的6个品系、新西兰、加利福尼亚兔共8个种群为试材,建立了肉兔扩增片段长度多态性(AFLP)分析体系,对其分析过程中DNA提取、双酶切、连接、预扩增、选择性扩增、银染效果进行了确立。由72种引物组合中筛选出了15种引物组合,建立了肉兔的AFLP指纹图谱。条带清晰可辨,扩增信号强,无背景干扰。