植物RNA病毒不依赖帽子翻译机制的研究进展

真核生物系统中,mRNA 5′末端帽子结构通过结合翻译起始因子eIF4E进而招募40S核糖体亚基,对蛋白翻译的起始调控至关重要,而3′末端poly(A)尾则通过介导mRNA环化提高翻译效率。然而,许多植物RNA病毒的基因组缺乏5′帽子结构,甚至3′末端也不带poly(A)尾,这些病毒进化产生了位于基因组RNA5′末端或3′末端的不依赖帽子翻译元件。本文将重点讨论位于植物病毒基因组RNA 3′末端的不依赖帽子翻译元件(Cap-independent Translation Element,3′CITE),就其结构特征、调控翻译起始和RNA环化等方面的研究进展进行了综述。

国际病毒分类委员会(ICTV)2017分类系统与第九次分类报告的比较及数据分析

本文结合国际病毒分类委员会(ICTV)第九次报告和ICTV官方网站公布的2017版分类系统,比较了二者的差异;同时就2017版分类系统的数据进行了全面分析,包括不同核酸类型病毒的种类和比例,植物病毒的种类和比例,以及2017版分类系统中几个值得关注的问题。

两种类型黄瓜花叶病毒卫星RNA的序列、结构以及对辅助病毒的致病性调控分析

黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)卫星RNA(satellite RNA,satRNA)通常影响CMV的致病性。本研究设计了检测satCMV的简并引物,通过RT-PCR从山东省泰安市3种自然发病寄主中检测到satCMV,发现了两类长度有明显差异的satCMV:白菜与萝卜中克隆的satCMV为339个核苷酸,二者的核苷酸一致率为99.41%;烟草中克隆的satCMV为383个核苷酸,与白菜和萝卜中satCMV的核苷酸序列一致率均为71.06%。系统进化分析表明这两类长度有明显差异的satCMV亲缘关系较远。两种类型的satCMV与CMV-Fny混合接种对CMV致病症状的调控存在明显差异。利用m Fold软件分析了两类不同长度的CMV卫星RNA基因组及其互补链的RNA结构特征,表明两类sat CMV与CMV互作的活跃度以及核心结构域存在差异。两类satCMV全基因组的克隆以及结构分析为研究不同类型satCMV与CMV的互作及其对CMV致病性的影响奠定了基础。