颊粘膜拭子检测孤独症谱系障碍儿童相关基因多态性的临床应用

目的探讨应用颊粘膜拭子采集样本以提取DNA进行孤独症谱系障碍(autism spectrum disorder,ASD)相关基因检测的可行性。方法纳入41例ASD患儿。采用棉拭子擦拭患儿颊粘膜,酚-氯仿-异戊醇法抽提基因组DNA;另采集患儿外周静脉血,用试剂盒提取基因组DNA。比较两种取材方法获得的基因组DNA总量、浓度与纯度。应用PCR-限制性酶切法对亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetra-hydrofolate reductase,MTHFR)基因C677T位点进行基因型分析,比较两种取材法获得的基因分型结果一致性。结果从颊粘膜提取的基因组DNA总量([5.87±2.58)μg vs(.2.00±0.92)μg]与浓度([143.25±72.78)mg/L vs(.66.68±24.43)mg/L]高于200μL血液提取的基因组DNA(P<0.01),而纯度与血液样本比较差异无统计学意义(P<0.05)。两种取材法进行MTHFR基因分型结果完全一致,并经Sanger测序验证。结论颊粘膜拭子是一种简单、无创、可靠的获取基因组DNA方法,可部分替代静脉血进行ASD相关基因多态性分析。