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多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因组测序与同源性分析
被引量:
2
1
作者
章志勇
李营
+2 位作者
姜健阁
薛万华
边奕鑫
《临床检验杂志》
CAS
2022年第11期849-852,共4页
目的分析多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAB)耐药基因和基因同源性,为临床合理使用抗菌药物、制定医院感染防控策略提供依据。方法采用BD Phoenix-100全自动细菌鉴定及药敏分析仪对23株MDRAB进行鉴定及抗菌药物敏感性试验,用MALDI Biotyper全...
目的分析多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAB)耐药基因和基因同源性,为临床合理使用抗菌药物、制定医院感染防控策略提供依据。方法采用BD Phoenix-100全自动细菌鉴定及药敏分析仪对23株MDRAB进行鉴定及抗菌药物敏感性试验,用MALDI Biotyper全自动微生物质谱仪复核结果;利用Illumina HiSeq 4000系统进行全基因测序,使用glimmer3软件对基因组组装,使用tRNAscan-SE、RNAmmer和Rfam数据库对tRNA、rRNA和sRNA进行识别;根据菌株基因组序列,进行多位点序列分型(MLST),应用MEGA X version 10.1生物信息软件依据16S rDNA序列进行系统发育分析。结果药敏结果显示,14种药物耐药率为100%,仅米诺环素和多黏菌素B耐药率低于50%;根据全基因测序技术分析耐药基因,共检出36种耐药基因,除ANT(3″)基因检出率为30.43%,Vibrio cholerae varG基因检出率为21.74%,AAC(6′)基因检出率为4.35%,其余均高于50%。bla_(OXA-23)、bla_(OXA-66)和bla_(ADC-30)耐药基因检出率为100%,blaTEM-1耐药基因检出率为95.7%,未检出bla_(SHV)、bla_(IMP)、bla_(VIM)基因;MLST分型(Pasteur)分析结果显示23株菌株全部属于ST2一种序列分型,MLST分型(Oxford)分析结果显示23株菌株来自7个序列分型。系统发育分析显示23株菌和Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离近,而与醋酸钙不动杆菌进化距离远。但菌株18A独立为一支,其他22株菌与Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离更近。结论我院检出的MDRAB对常用抗菌药物高度耐药,携带多种耐药基因,且菌株之间存在同源性,应加强院感防控。
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关键词
多重耐药鲍曼不动杆菌
全基因组测序
耐药基因
同源性
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职称材料
肠道微生物群在围产期营养不良相关神经发育异常的作用及作用机制研究进展
2
作者
马炎
于鹏
+1 位作者
李营
边奕鑫
《山东医药》
CAS
2023年第36期103-106,共4页
营养不良是一种长期摄入不适当的数量、种类的营养素所造成的营养失衡状态,包括由于摄入不足、吸收不良或过度损耗某种营养素所造成的营养不足,也包含由于暴饮暴食或过度摄入某种特定的营养素而造成的营养过剩。围产期营养不良会对后代...
营养不良是一种长期摄入不适当的数量、种类的营养素所造成的营养失衡状态,包括由于摄入不足、吸收不良或过度损耗某种营养素所造成的营养不足,也包含由于暴饮暴食或过度摄入某种特定的营养素而造成的营养过剩。围产期营养不良会对后代的神经发育造成负面影响,营养供给直接影响大脑发育质量,各种营养素均是大脑结构形成和功能发育的重要物质基础。围产期饮食不均衡会导致母体营养不良,可能会影响生命早期肠道微生物群的定植,导致肠道微生物群失调。同时生命早期肠道微生物群失调,可能导致认知障碍和行为问题。微生物、微生物碳水化合物代谢在营养不良相关神经发育异常中发挥重要作用,蛋白质、脂质代谢相关微生物也与神经发育也密切相关。肠道微生物通过“肠—脑轴”影响神经发育,营养不良引起的微生物群改变也可能通过调节应激系统影响神经发育。
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关键词
肠道微生物
营养不良
神经发育异常
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职称材料
题名
多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因组测序与同源性分析
被引量:
2
1
作者
章志勇
李营
姜健阁
薛万华
边奕鑫
机构
山东大学齐鲁医院德州医院德州市人民医院检验科
山东大学
第二
医院
医学实验中心
出处
《临床检验杂志》
CAS
2022年第11期849-852,共4页
基金
山东省医药卫生科技发展计划项目(2017WS226)。
文摘
目的分析多重耐药鲍曼不动杆菌(MDRAB)耐药基因和基因同源性,为临床合理使用抗菌药物、制定医院感染防控策略提供依据。方法采用BD Phoenix-100全自动细菌鉴定及药敏分析仪对23株MDRAB进行鉴定及抗菌药物敏感性试验,用MALDI Biotyper全自动微生物质谱仪复核结果;利用Illumina HiSeq 4000系统进行全基因测序,使用glimmer3软件对基因组组装,使用tRNAscan-SE、RNAmmer和Rfam数据库对tRNA、rRNA和sRNA进行识别;根据菌株基因组序列,进行多位点序列分型(MLST),应用MEGA X version 10.1生物信息软件依据16S rDNA序列进行系统发育分析。结果药敏结果显示,14种药物耐药率为100%,仅米诺环素和多黏菌素B耐药率低于50%;根据全基因测序技术分析耐药基因,共检出36种耐药基因,除ANT(3″)基因检出率为30.43%,Vibrio cholerae varG基因检出率为21.74%,AAC(6′)基因检出率为4.35%,其余均高于50%。bla_(OXA-23)、bla_(OXA-66)和bla_(ADC-30)耐药基因检出率为100%,blaTEM-1耐药基因检出率为95.7%,未检出bla_(SHV)、bla_(IMP)、bla_(VIM)基因;MLST分型(Pasteur)分析结果显示23株菌株全部属于ST2一种序列分型,MLST分型(Oxford)分析结果显示23株菌株来自7个序列分型。系统发育分析显示23株菌和Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离近,而与醋酸钙不动杆菌进化距离远。但菌株18A独立为一支,其他22株菌与Acinetobacter baumannii strain ATCC 19606进化距离更近。结论我院检出的MDRAB对常用抗菌药物高度耐药,携带多种耐药基因,且菌株之间存在同源性,应加强院感防控。
关键词
多重耐药鲍曼不动杆菌
全基因组测序
耐药基因
同源性
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
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职称材料
题名
肠道微生物群在围产期营养不良相关神经发育异常的作用及作用机制研究进展
2
作者
马炎
于鹏
李营
边奕鑫
机构
山东大学
齐鲁
医院
德州
医院
德州市
人民医院
临床营养
科
山东大学
齐鲁
医院
德州
医院
德州市
人民医院
妇产
科
山东大学齐鲁医院德州医院德州市人民医院检验科
出处
《山东医药》
CAS
2023年第36期103-106,共4页
基金
山东省医药卫生科技发展计划项目(202012021330)。
文摘
营养不良是一种长期摄入不适当的数量、种类的营养素所造成的营养失衡状态,包括由于摄入不足、吸收不良或过度损耗某种营养素所造成的营养不足,也包含由于暴饮暴食或过度摄入某种特定的营养素而造成的营养过剩。围产期营养不良会对后代的神经发育造成负面影响,营养供给直接影响大脑发育质量,各种营养素均是大脑结构形成和功能发育的重要物质基础。围产期饮食不均衡会导致母体营养不良,可能会影响生命早期肠道微生物群的定植,导致肠道微生物群失调。同时生命早期肠道微生物群失调,可能导致认知障碍和行为问题。微生物、微生物碳水化合物代谢在营养不良相关神经发育异常中发挥重要作用,蛋白质、脂质代谢相关微生物也与神经发育也密切相关。肠道微生物通过“肠—脑轴”影响神经发育,营养不良引起的微生物群改变也可能通过调节应激系统影响神经发育。
关键词
肠道微生物
营养不良
神经发育异常
分类号
R153.1 [医药卫生—营养与食品卫生学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
多重耐药鲍曼不动杆菌耐药基因组测序与同源性分析
章志勇
李营
姜健阁
薛万华
边奕鑫
《临床检验杂志》
CAS
2022
2
下载PDF
职称材料
2
肠道微生物群在围产期营养不良相关神经发育异常的作用及作用机制研究进展
马炎
于鹏
李营
边奕鑫
《山东医药》
CAS
2023
0
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职称材料
已选择
0
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