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题名链状亚历山大藻生长衰亡相关基因的筛选
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作者
仲洁
隋正红
王春燕
丁弘叶
周伟
张杨
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机构
中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室
山东嫁禾生化(沂南)有限公司
青岛海底世界
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出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期431-437,共7页
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基金
高校博士点基金资助课题(20100132110007)
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文摘
采用抑制性消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了衰亡期的链状亚历山大藻(Alexandriumcatenella)特异表达的cDNA文库。共获得800个克隆,利用巢式引物进行PCR筛选,最终确定阳性克隆556个。利用斑点杂交技术对这些阳性克隆进行差异筛选,获得差异表达克隆160个。测序后得到片段125个,经过归类,获得21种序列,其中6种在NCBI中经Blast,获得功能基因与其匹配,这些功能基因分别是CHK1类似检测点蛋白(checkpoint-like protein)、核酸外切酶复合体、谷氧还蛋白、Na+/K+ATPase、叶绿体中的一个开放阅读框和pG1蛋白,其他blast无同源序列,可能为新基因。推测链状亚历山大藻的衰亡过程可能涉及到DNA损伤、mRNA降解过程、氧化还原状态的变化、离子动态平衡的变化以及叶绿体一些生理状况的变化等过程。
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关键词
链状亚历山大藻
衰亡
抑制性消减杂交
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Keywords
Alexandrium catenella
decline
suppression subtractive hybridization
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
X173
[环境科学与工程—环境科学]
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