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胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
李天亮
钟宁
+2 位作者
周小艳
崔亚洲
韩金祥
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
2010年第6期423-426,共4页
目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene On-tology,GO)分...
目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene On-tology,GO)分析。结果:98种基因共涉及50条信号通路,其中富集度P值<0.05的信号通路有15条,最具显著性的为HIFα-转录因子信号通路;98种基因在"细胞骨架生成"、"细胞骨架"及"蛋白结合"3种GO中富集度最为显著;在蛋白相互作用网络中,连接度最高的为Ezrin和Vimentin。结论:利用生物信息学方法对蛋白质组学数据进行挖掘,可以为进一步了解胰腺癌的发病机制提供新的思路。
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关键词
胰腺肿瘤
蛋白质组学
生物信息学
原文传递
题名
胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
李天亮
钟宁
周小艳
崔亚洲
韩金祥
机构
山东省医药生物技术研究中心山东省医学科学院卫生部生物技术药物重点实验室山东省医学分子生物学重点实验室
出处
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
2010年第6期423-426,共4页
基金
山东省科技攻关计划重大科技专项(2005GG1102003)
文摘
目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene On-tology,GO)分析。结果:98种基因共涉及50条信号通路,其中富集度P值<0.05的信号通路有15条,最具显著性的为HIFα-转录因子信号通路;98种基因在"细胞骨架生成"、"细胞骨架"及"蛋白结合"3种GO中富集度最为显著;在蛋白相互作用网络中,连接度最高的为Ezrin和Vimentin。结论:利用生物信息学方法对蛋白质组学数据进行挖掘,可以为进一步了解胰腺癌的发病机制提供新的思路。
关键词
胰腺肿瘤
蛋白质组学
生物信息学
Keywords
pancreatic neoplasms
proteomics
bioinformatics
分类号
R735.9 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析
李天亮
钟宁
周小艳
崔亚洲
韩金祥
《中华肿瘤防治杂志》
CAS
2010
3
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