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胰腺癌蛋白表达谱的生物信息学分析 被引量:3
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作者 李天亮 钟宁 +2 位作者 周小艳 崔亚洲 韩金祥 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2010年第6期423-426,共4页
目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene On-tology,GO)分... 目的:通过生物信息学方法分析胰腺癌蛋白质组学数据。方法:对通过蛋白质组学方法筛选出的98种胰腺癌表达上调蛋白使用NCI-Nature、Osprey1.2.0和DAVID软件分别进行信号通路分析、蛋白质相互作用分析及基因本体论(Gene On-tology,GO)分析。结果:98种基因共涉及50条信号通路,其中富集度P值<0.05的信号通路有15条,最具显著性的为HIFα-转录因子信号通路;98种基因在"细胞骨架生成"、"细胞骨架"及"蛋白结合"3种GO中富集度最为显著;在蛋白相互作用网络中,连接度最高的为Ezrin和Vimentin。结论:利用生物信息学方法对蛋白质组学数据进行挖掘,可以为进一步了解胰腺癌的发病机制提供新的思路。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 蛋白质组学 生物信息学
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