期刊导航
期刊开放获取
河南省图书馆
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌耐药基因及分子分型特征分析
1
作者
李涛
张帅
孔凡明
《预防医学论坛》
2024年第4期296-300,共5页
目的 了解临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌的耐药基因携带情况及分子分型情况,为监测和预防单相鼠伤寒沙门菌感染提供参考。方法 收集2017-2022年27株临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌(来自腹泻患者粪便)进行全基因组测序,基于测序数据进行耐药...
目的 了解临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌的耐药基因携带情况及分子分型情况,为监测和预防单相鼠伤寒沙门菌感染提供参考。方法 收集2017-2022年27株临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌(来自腹泻患者粪便)进行全基因组测序,基于测序数据进行耐药基因预测及分类分析,与公共数据库中的23株单相鼠伤寒沙门菌基因组数据共同进行多位点序列分型(MLST)和核心基因组序列分型(cgMLST)分型分析,以NC_003197基因组为参考序列鉴定所有基因组的单核苷酸多态性(SNP)位点,构建基于SNP位点的系统发育树。结果 27株临沂菌株共预测到9类36种不同的耐药基因,其中携带率较高的耐药基因是aac(6′)-Iaa(27/27)、aph(6)-Id(24/27)、aph(3'')-Ib(23/27)、blaTEM-1B(16/27)、sul2(20/27)、tet(B)(18/27)及qnrS1(10/27),同时携带3类或3类以上耐药基因的菌株占92.59%。多位点序列分型显示27株临沂菌株均为ST34型,分为12个cgMLST型,其中2246331298为优势型别,在23株公共数据库菌株中未发现相同的cgMLST型别。27株临沂菌株与10株ST34型及另外两株ST7832型、ST2379型公共数据库菌株聚集于一个分支内,该分支内26株临沂菌株聚集成簇。结论 临沂市单相鼠伤寒沙门菌耐药严重,菌株呈现明显的遗传多样性,存在潜在暴发的风险。
展开更多
关键词
单相鼠伤寒沙门菌
全基因组测序
血清型
分子分型
耐药基因
原文传递
题名
临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌耐药基因及分子分型特征分析
1
作者
李涛
张帅
孔凡明
机构
临沂市
疾病
预防控制中心细菌检验科
山东省重大疾病和传染病防治工作领导小组办公室疫情研判组
出处
《预防医学论坛》
2024年第4期296-300,共5页
文摘
目的 了解临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌的耐药基因携带情况及分子分型情况,为监测和预防单相鼠伤寒沙门菌感染提供参考。方法 收集2017-2022年27株临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌(来自腹泻患者粪便)进行全基因组测序,基于测序数据进行耐药基因预测及分类分析,与公共数据库中的23株单相鼠伤寒沙门菌基因组数据共同进行多位点序列分型(MLST)和核心基因组序列分型(cgMLST)分型分析,以NC_003197基因组为参考序列鉴定所有基因组的单核苷酸多态性(SNP)位点,构建基于SNP位点的系统发育树。结果 27株临沂菌株共预测到9类36种不同的耐药基因,其中携带率较高的耐药基因是aac(6′)-Iaa(27/27)、aph(6)-Id(24/27)、aph(3'')-Ib(23/27)、blaTEM-1B(16/27)、sul2(20/27)、tet(B)(18/27)及qnrS1(10/27),同时携带3类或3类以上耐药基因的菌株占92.59%。多位点序列分型显示27株临沂菌株均为ST34型,分为12个cgMLST型,其中2246331298为优势型别,在23株公共数据库菌株中未发现相同的cgMLST型别。27株临沂菌株与10株ST34型及另外两株ST7832型、ST2379型公共数据库菌株聚集于一个分支内,该分支内26株临沂菌株聚集成簇。结论 临沂市单相鼠伤寒沙门菌耐药严重,菌株呈现明显的遗传多样性,存在潜在暴发的风险。
关键词
单相鼠伤寒沙门菌
全基因组测序
血清型
分子分型
耐药基因
Keywords
Monophasic Salmonella typhimurium
Whole genome sequencing
Serotype
Molecular typing
Drug resistant gene
分类号
R378.23 [医药卫生—病原生物学]
R372 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
临沂市人源单相鼠伤寒沙门菌耐药基因及分子分型特征分析
李涛
张帅
孔凡明
《预防医学论坛》
2024
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部