LRRC31在前列腺癌中的表达及临床意义

目的探讨富含亮氨酸的重复序列蛋白(leucine-rich repeat-containing protein 31,LRRC31)在前列腺癌(prostate cancer,PCa)患者中的表达水平及对临床预后意义。方法通过在肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载并分析前列腺相关患者基因表达数据共500例,其中前列腺癌数据490例,导管及小叶肿瘤9例,囊性、黏液性及浆液性肿瘤1例。明确LRRC31在前列腺癌组织与正常前列腺组织之间的表达差异,分析LRRC31的表达与前列腺癌患者年龄、分期以及总生存时间的相关性,探讨LRRC31对于前列腺癌细胞的作用机制。结果LRRC31在前列腺癌细胞中的表达水平明显高于其在癌旁组织中的表达水平,差异有统计学意义(P=0.022),LRRC31的表达在患者年龄分布上差异无统计学意义(P=0.347);高表达LRRC31的前列腺癌患者的T分期明显高于低表达的患者,差异有统计学意义(P<0.001);发生周围淋巴结受累的前列腺癌患者的LRRC31的表达水平与未发生周围淋巴结受累的患者的LRRC31的表达水平比较,差异无统计学意义(P=0.123);LRRC31低表达的前列腺癌患者的总生存期明显优于LRRC31高表达的前列腺癌患者,差异有统计学意义(P=0.024)。根据基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)结果表明,LRRC31可能通过多种细胞代谢途径及细胞通路影响前列腺癌的发生,包括谷胱甘肽代谢、Notch信号通路、苯丙氨酸代谢、RIG-I样信号通路、RNA降解、小细胞肺癌及泛素介导的蛋白水解途径。结论LRRC31基因与前列腺癌患者的不良预后相关,可以作为前列腺癌的独立危险因素。

DLGAP5基因突变与甲基化在肾透明细胞癌中的预后及意义

目的探讨DLGAP5(discs large homolog associated protein 5)基因在肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)患者中的表达水平、与T细胞免疫的关系、相关临床预后意义、基因突变水平以及甲基化程度(表观遗传学方面),以提供一种更新的肾透明细胞癌的早期诊断方法及相应治疗方案。方法通过在UCSC Xena数据库下载并分析KIRC相关基因表达样本数据共607例,其中,正常样本72例,肿瘤样本535例,且所有样本表达DLGAP5基因。明确DLGAP5基因在肾透明细胞癌组织与正常肾组织之间的表达差异,探究肾透明细胞癌患者DLGAP5基因表达与T淋巴细胞和T细胞表达基因之间的相关性,研讨DLGAP5基因突变水平以及甲基化水平,探讨DLGAP5基因对于肾透明细胞癌预后的预测能力。结果DLGAP5基因在肾透明细胞癌细胞中的表达水平明显高于其在正常肾脏组织中的表达水平;DLGAP5低表达组(n=266)总生存数明显优于DLGAP5基因高表达组(n=265)的患者(P=0.001),尤以明确KIRC诊断后的第1年变化程度最为明显,其中,DLGAP高表达组死亡51人,而DLGAP5低表达组仅死亡40人。12年后,DLGAP5高表达组患者全部死亡,而DLGAP5低表达组中仍有1人存活;DLGAP5基因在经过单因素独立预后分析(P<0.001)和多因素独立预后分析(P=0.001)后,可确定为肾透明细胞癌的高风险独立预后因子;DLGAP5基因表达量与CD8~+T细胞含量(Rho=0.298,P<0.001)、CD2免疫基因表达量(Rho=0.393,P<0.001)、CD3D免疫基因表达量(Rho=0.354,P<0.001)呈正相关关系以及CD3E免疫基因表达量(Rho=0.353,P<0.001)呈正相关;DLGAP5的基因突变水平无法作为患者预后的诊断指标;cg10130446甲基化位点的甲基化程度与患者预后呈负相关(P=0.006),DLGAP5的cg10130446甲基化位点可作为患者预后判断的生物学指标和新的治疗靶点。结论DLGAP5基因在肾透明细胞癌细胞中的表达水平明显高于其在正常肾脏组织中的表达水平;DLGAP5基因低表达组总生存期明显优于DLGAP5基因高表达组的患者;DLGAP5基因在经过单因素独立预后分析和多因素独立预后分析后,可确定为肾透明细胞癌的高风险独立预后因子;DLGAP5基因表达量与CD8^(+)T细胞含量,CD2免疫基因表达量,CD3D免疫基因表达量以及CD3E免疫基因表达量呈正相关;DLGAP5的基因突变水平无法作为患者预后诊断指标;DLGAP5基因与肾透明细胞癌患者的不良预后相关,cg10130446甲基化位点可以作为肾透明细胞癌的独立危险因素以及新的治疗靶点。