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基于网络药理学及分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎机制的研究
1
作者
王恺
王琳
+2 位作者
于勇
张汝敏
侯念宗
《中国中西医结合急救杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期568-575,共8页
目的应用网络药理学与分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎(AP)的作用机制.方法于中药药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选大黄、枳实、厚朴的活性成分,应用瑞士目标预测(STP)数据库预测相关靶点.通过药物银行(DrugBank)数据库、基因卡...
目的应用网络药理学与分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎(AP)的作用机制.方法于中药药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选大黄、枳实、厚朴的活性成分,应用瑞士目标预测(STP)数据库预测相关靶点.通过药物银行(DrugBank)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库、人类孟德尔遗传在线(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)及药物基因组学知识库(PharmGKB)数据库中筛选出AP的相关靶点.运用String数据库构建靶点蛋白互作网络,采用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析,使用R3.6.2软件对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,通过Autodock 4.2.6软件以及Vina软件进行分子对接.结果共筛选出小承气汤与AP直接相关的交集靶点124个,通过网络拓扑分析发现11个靶点,包括视网膜母细胞瘤1(RB1)基因、蛋白激酶B(PKB)基因、细胞周期蛋白D1(CCND1)基因、禽髓细胞瘤病毒癌基因同源物(MYC)基因、雌激素受体1(ESR1)基因、网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(RELA)基因、激活蛋白1(AP-1)基因、p53基因、丝裂素活化蛋白激酶(MAPK1、3、14)基因为核心靶点.GO富集分析及KEGG通路富集分析显示,小承气汤可通过干预细胞凋亡、调节胰腺细胞增殖分化、抑制氧化应激等方面治疗AP,其中磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路是最重要的通路.选取小承气汤关键活性成分与核心基因靶点进行分子对接,结果表明,柚皮素分别与PKB、MAPK1、MAPK3;川陈皮素分别与AP-1、p53基因;木犀草素分别与CCND1、RB1 RELA;木犀草素四甲醚与MAPK14;芦荟大黄素与MYC;儿茶素与ESR1等11对成分-靶点对接的自由能较小,显示出良好的对接活性.结论通过网络药理及分子对接的方法证实小承气汤治疗AP具有多途径、多靶点作用的特点,并揭示了相关物质基础和作用机制,这为经典名方在临床的广泛应用提供了参考,也为后期的基础研究提供了理论依据.
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关键词
小承气汤
急性胰腺炎
网络药理学
分子对接
机制
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职称材料
题名
基于网络药理学及分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎机制的研究
1
作者
王恺
王琳
于勇
张汝敏
侯念宗
机构
山东第一医科大学附属淄博市中心医院重症医学科
山东
第一
医科
大学
附属
淄博市
中心医院
转化
医学
中心
出处
《中国中西医结合急救杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期568-575,共8页
基金
山东省淄博市重点研发计划(2020ZC010048)
山东省医药卫生科技发展计划(202010000131,202104070065)。
文摘
目的应用网络药理学与分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎(AP)的作用机制.方法于中药药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选大黄、枳实、厚朴的活性成分,应用瑞士目标预测(STP)数据库预测相关靶点.通过药物银行(DrugBank)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库、人类孟德尔遗传在线(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)及药物基因组学知识库(PharmGKB)数据库中筛选出AP的相关靶点.运用String数据库构建靶点蛋白互作网络,采用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析,使用R3.6.2软件对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,通过Autodock 4.2.6软件以及Vina软件进行分子对接.结果共筛选出小承气汤与AP直接相关的交集靶点124个,通过网络拓扑分析发现11个靶点,包括视网膜母细胞瘤1(RB1)基因、蛋白激酶B(PKB)基因、细胞周期蛋白D1(CCND1)基因、禽髓细胞瘤病毒癌基因同源物(MYC)基因、雌激素受体1(ESR1)基因、网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(RELA)基因、激活蛋白1(AP-1)基因、p53基因、丝裂素活化蛋白激酶(MAPK1、3、14)基因为核心靶点.GO富集分析及KEGG通路富集分析显示,小承气汤可通过干预细胞凋亡、调节胰腺细胞增殖分化、抑制氧化应激等方面治疗AP,其中磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路是最重要的通路.选取小承气汤关键活性成分与核心基因靶点进行分子对接,结果表明,柚皮素分别与PKB、MAPK1、MAPK3;川陈皮素分别与AP-1、p53基因;木犀草素分别与CCND1、RB1 RELA;木犀草素四甲醚与MAPK14;芦荟大黄素与MYC;儿茶素与ESR1等11对成分-靶点对接的自由能较小,显示出良好的对接活性.结论通过网络药理及分子对接的方法证实小承气汤治疗AP具有多途径、多靶点作用的特点,并揭示了相关物质基础和作用机制,这为经典名方在临床的广泛应用提供了参考,也为后期的基础研究提供了理论依据.
关键词
小承气汤
急性胰腺炎
网络药理学
分子对接
机制
Keywords
Xiaochengqi decoction
Acute pancreatitis
Network pharmacology
Molecular docking
Mechanism
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
基于网络药理学及分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎机制的研究
王恺
王琳
于勇
张汝敏
侯念宗
《中国中西医结合急救杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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