基于生物信息学分析鉴定促进非小细胞肺癌耐药的关键基因

目的通过生物信息学分析基因表达综合数据库(GEO数据库)中吉非替尼敏感和耐药非小细胞肺癌(NSCLC)细胞的基因表达谱,研究导致NSCLC获得性耐药的潜在关键基因,为耐药NSCLC患者的预后评价提供新思路。方法通过GEO2R网络工具分析GSE123066和GSE83666数据集识别差异表达基因(DEGs)。通过韦恩图比较2组数据之间的DEGs找出关键的候选基因,然后对候选基因进行基因本体(GO)分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,并对所得到的基因进行临床预后分析、肿瘤组织及不同分期中的表达水平进行分析。结果筛选到46个核心DEGs与NSCLC耐药显著相关,通过Cytoscape确定8个关键基因在NSCLC细胞的吉非替尼耐药进展中起重要作用,分别是SOD2、GADD45A、NCF2、LOX、CYR61、SOX2、JUP和MUC1,最后生存分析发现SOD2与NSCLC吉非替尼耐药高度相关。结论SOD2可能是导致NSCLC细胞对吉非替尼获得性耐药的关键基因,其高表达与NSCLC不良预后相关,表明SOD2可能是未来具有临床应用价值的潜在治疗靶点。