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肾透明细胞癌VSIG4表达及其与免疫细胞浸润的相关性研究
1
作者
刘杭丰
刘盛露
+3 位作者
段连瑞
昝丽坤
马彦杰
杨利军
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期918-924,共7页
目的:探究VSIG4在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与免疫细胞浸润和预后的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载ccRCC的RNA-seq数据和患者相应的临床数据;通过Wilcoxon秩和检验分析ccRCC及正常肾组织中VSIG4 mRNA表达水平;Wi...
目的:探究VSIG4在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与免疫细胞浸润和预后的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载ccRCC的RNA-seq数据和患者相应的临床数据;通过Wilcoxon秩和检验分析ccRCC及正常肾组织中VSIG4 mRNA表达水平;Wilcoxon秩和或Kruskal-Wallis秩和检验分析VSIG4表达与临床病理参数的相关性;Kaplan-Meier法分析VSIG4表达与患者预后的相关性;基因集富集分析(GSEA)探究VSIG4在ccRCC中参与的信号通路;使用R软件运行CIBERSORT算法分析VSIG4表达与肿瘤浸润免疫细胞的相关性;Western blotting检测人正常肾上皮细胞系293T和人肾癌细胞系ACHN、A-498、786-O、OS-RC-2中VSIG4蛋白表达。结果:VSIG4在ccRCC中的表达水平显著高于正常组织(P<0.05);VSIG4的表达与患者远处转移分期和淋巴结转移分期显著相关(P<0.05);生存分析显示,VSIG4高表达组患者总体生存率显著低于低表达组患者(P<0.05);GSEA富集分析结果显示,VSIG4主要在凋亡、趋化因子信号通路、细胞黏附分子等信号通路富集;VSIG4表达与M1巨噬细胞呈负相关(r<0,P<0.05),而与M2巨噬细胞呈正相关(r>0,P<0.05);免疫印迹结果表明,肾癌细胞中VSIG4蛋白表达均高于人正常肾上皮细胞系。结论:VSIG4在ccRCC中高表达,且与预后呈负相关,可能成为ccRCC患者预后的生物标志物。
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关键词
肾透明细胞癌
VSIG4
肿瘤浸润免疫细胞
生物信息学分析
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题名
肾透明细胞癌VSIG4表达及其与免疫细胞浸润的相关性研究
1
作者
刘杭丰
刘盛露
段连瑞
昝丽坤
马彦杰
杨利军
机构
山西
医科
大学
基础医学院药理学教研室
山西
医科
大学
基础医学院生物化学与分子生物学教研室
山西
省肿瘤医院病理科
山西
医科
大学
第一附属医院泌尿外科
山西医科大学靶向药物研究中心
出处
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期918-924,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81972325)
山西省应用基础研究计划青年项目(202103021223226)。
文摘
目的:探究VSIG4在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与免疫细胞浸润和预后的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载ccRCC的RNA-seq数据和患者相应的临床数据;通过Wilcoxon秩和检验分析ccRCC及正常肾组织中VSIG4 mRNA表达水平;Wilcoxon秩和或Kruskal-Wallis秩和检验分析VSIG4表达与临床病理参数的相关性;Kaplan-Meier法分析VSIG4表达与患者预后的相关性;基因集富集分析(GSEA)探究VSIG4在ccRCC中参与的信号通路;使用R软件运行CIBERSORT算法分析VSIG4表达与肿瘤浸润免疫细胞的相关性;Western blotting检测人正常肾上皮细胞系293T和人肾癌细胞系ACHN、A-498、786-O、OS-RC-2中VSIG4蛋白表达。结果:VSIG4在ccRCC中的表达水平显著高于正常组织(P<0.05);VSIG4的表达与患者远处转移分期和淋巴结转移分期显著相关(P<0.05);生存分析显示,VSIG4高表达组患者总体生存率显著低于低表达组患者(P<0.05);GSEA富集分析结果显示,VSIG4主要在凋亡、趋化因子信号通路、细胞黏附分子等信号通路富集;VSIG4表达与M1巨噬细胞呈负相关(r<0,P<0.05),而与M2巨噬细胞呈正相关(r>0,P<0.05);免疫印迹结果表明,肾癌细胞中VSIG4蛋白表达均高于人正常肾上皮细胞系。结论:VSIG4在ccRCC中高表达,且与预后呈负相关,可能成为ccRCC患者预后的生物标志物。
关键词
肾透明细胞癌
VSIG4
肿瘤浸润免疫细胞
生物信息学分析
Keywords
Clear cell renal cell carcinoma
VSIG4
Tumor-infiltrating immune cells
Bioinformatics analysis
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
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1
肾透明细胞癌VSIG4表达及其与免疫细胞浸润的相关性研究
刘杭丰
刘盛露
段连瑞
昝丽坤
马彦杰
杨利军
《中国免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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