目的筛选黄芪建中汤中治疗慢性萎缩性胃炎的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立单味药-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎的潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台(TCMSP)中的药动学参数[...目的筛选黄芪建中汤中治疗慢性萎缩性胃炎的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立单味药-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎的潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台(TCMSP)中的药动学参数[口服利用度(OB)和药物相似性(DL)]筛选黄芪建中汤的潜在活性成分,整合靶点预测网站服务器(STPD)与人类基因数据库(Genecard)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)预测和筛选其治疗慢性萎缩性胃炎的作用靶点,借助Cytoscape构建"单味药-活性成分-作用靶点"网络。通过Systems Dock Web Site对4个主要活性成分与作用靶点进行分子对接验证。采用String数据库与Cytoscape软件绘制蛋白质相互作用网络,并利用Dis Ge NET数据库对作用靶点类型进行归属。采用DAVID数据库对黄芪建中汤作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果通过OB和DL参数筛选得到118个潜在活性成分,共涉及16个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分为52个,主要通过调控癌症通路、病灶黏连、精氨酸和脯氨酸代谢、血管内皮生长因子(VEGF)信号转导与神经营养因子信号通路等发挥对慢性萎缩性胃炎的治疗作用。结论黄芪建中汤对慢性萎缩性胃炎的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制与物质基础提供了科学依据。展开更多
构建柴胡活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨柴胡抗抑郁的作用机制。通过TCMSP数据库、文献挖掘和本实验室已有研究获取柴胡主要活性成分,利用DRAR-CPI服务器、Gene Cards和OMIM数据库预测...构建柴胡活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨柴胡抗抑郁的作用机制。通过TCMSP数据库、文献挖掘和本实验室已有研究获取柴胡主要活性成分,利用DRAR-CPI服务器、Gene Cards和OMIM数据库预测和筛选柴胡活性成分抗抑郁的作用靶点。采用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络,采用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。采用DAVID数据库对靶点进行GO及KEGG通路分析,通过Dis Ge NET数据库对靶点所属的类型进行归属。筛选得到柴胡15个活性成分,涉及50个作用靶点。网络分析结果表明,柴胡主要涉及细胞过程、代谢过程、对应激的应答等生物过程,通过调节PI3K-AKT、MAPK、Rap1、Ras、Fox O和neurotrophin等信号通路来发挥抗抑郁作用。本研究体现了柴胡多成分-多靶点-多途径的作用特点,为进一步开展柴胡抗抑郁作用机制的研究提供了新思路和新方法。展开更多
文摘目的筛选黄芪建中汤中治疗慢性萎缩性胃炎的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立单味药-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎的潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台(TCMSP)中的药动学参数[口服利用度(OB)和药物相似性(DL)]筛选黄芪建中汤的潜在活性成分,整合靶点预测网站服务器(STPD)与人类基因数据库(Genecard)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)预测和筛选其治疗慢性萎缩性胃炎的作用靶点,借助Cytoscape构建"单味药-活性成分-作用靶点"网络。通过Systems Dock Web Site对4个主要活性成分与作用靶点进行分子对接验证。采用String数据库与Cytoscape软件绘制蛋白质相互作用网络,并利用Dis Ge NET数据库对作用靶点类型进行归属。采用DAVID数据库对黄芪建中汤作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果通过OB和DL参数筛选得到118个潜在活性成分,共涉及16个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分为52个,主要通过调控癌症通路、病灶黏连、精氨酸和脯氨酸代谢、血管内皮生长因子(VEGF)信号转导与神经营养因子信号通路等发挥对慢性萎缩性胃炎的治疗作用。结论黄芪建中汤对慢性萎缩性胃炎的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制与物质基础提供了科学依据。
文摘构建柴胡活性成分-作用靶点网络和蛋白相互作用网络,对靶点涉及的功能和通路进行分析,探讨柴胡抗抑郁的作用机制。通过TCMSP数据库、文献挖掘和本实验室已有研究获取柴胡主要活性成分,利用DRAR-CPI服务器、Gene Cards和OMIM数据库预测和筛选柴胡活性成分抗抑郁的作用靶点。采用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络,采用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。采用DAVID数据库对靶点进行GO及KEGG通路分析,通过Dis Ge NET数据库对靶点所属的类型进行归属。筛选得到柴胡15个活性成分,涉及50个作用靶点。网络分析结果表明,柴胡主要涉及细胞过程、代谢过程、对应激的应答等生物过程,通过调节PI3K-AKT、MAPK、Rap1、Ras、Fox O和neurotrophin等信号通路来发挥抗抑郁作用。本研究体现了柴胡多成分-多靶点-多途径的作用特点,为进一步开展柴胡抗抑郁作用机制的研究提供了新思路和新方法。