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峨眉山藏酋猴mtDNA控制区序列变异及种群遗传多样性
被引量:
1
1
作者
姚永芳
钟丽菁
+5 位作者
刘家斌
李苹
王章训
胡江涛
简宏博
徐怀亮
《四川动物》
CSCD
北大核心
2013年第6期801-807,共7页
为更有效地保护藏酋猴Macaca thibetana野生种群,本文测定了来自峨眉山藏酋猴8个亚群体的47个样品mtDNA控制区5'端505 bp的序列,发现了27个变异位点(5.74%),定义了4种单倍型,其单倍型多样性(h)为0.236±0.079、核苷酸多样性(π)...
为更有效地保护藏酋猴Macaca thibetana野生种群,本文测定了来自峨眉山藏酋猴8个亚群体的47个样品mtDNA控制区5'端505 bp的序列,发现了27个变异位点(5.74%),定义了4种单倍型,其单倍型多样性(h)为0.236±0.079、核苷酸多样性(π)为0.00902±0.00354,单倍型之间的序列差异平均为0.623%,平均核苷酸差异(K)为4.274,单倍型序列之间变异较大,种群中的核苷酸多样性较高;将峨眉山的藏酋猴看成一个种群与同为四川地区的马边群体及安徽的黄山群体的相应序列进行比较,结果显示峨眉山藏酋猴种群mtDNA控制区序列与马边群体间的差异性较小,而与黄山群体间的差异性较大。分子方差分析(AMOVA)表明,90.04%的遗传变异发生在种群之间,仅有9.96%的变异发生在种群内。进一步分析表明,藏酋猴各地理种群间均不同程度地存在着一定的遗传分化(Fst=0.9004,P<0.05),种群间基因交流较贫乏(Nm<1)。基于最大似然法和邻接法构建的系统发生树均支持四川地区的藏酋猴种群和安徽黄山种群分别聚为不同的类群,支持将它们归入各自的管理单元;而本研究中的四川地区藏酋猴在系统发生树上也分为2个亚支,但这2个亚支并未与地理分布成完全的对应关系,应归为一个管理单元加以保护。
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关键词
峨眉山
藏酋猴
MTDNA控制区
遗传多样性
序列变异
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职称材料
题名
峨眉山藏酋猴mtDNA控制区序列变异及种群遗传多样性
被引量:
1
1
作者
姚永芳
钟丽菁
刘家斌
李苹
王章训
胡江涛
简宏博
徐怀亮
机构
四川农业大学动物科技学院
峨眉山管委会农林水利局
出处
《四川动物》
CSCD
北大核心
2013年第6期801-807,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目[批准号:30970383]
教育部"长江学者和创新团队发展计划"创新团队项目(编号:IRT0848)
四川省教育厅自然科学基金重点项目[批准号:08ZA076]
文摘
为更有效地保护藏酋猴Macaca thibetana野生种群,本文测定了来自峨眉山藏酋猴8个亚群体的47个样品mtDNA控制区5'端505 bp的序列,发现了27个变异位点(5.74%),定义了4种单倍型,其单倍型多样性(h)为0.236±0.079、核苷酸多样性(π)为0.00902±0.00354,单倍型之间的序列差异平均为0.623%,平均核苷酸差异(K)为4.274,单倍型序列之间变异较大,种群中的核苷酸多样性较高;将峨眉山的藏酋猴看成一个种群与同为四川地区的马边群体及安徽的黄山群体的相应序列进行比较,结果显示峨眉山藏酋猴种群mtDNA控制区序列与马边群体间的差异性较小,而与黄山群体间的差异性较大。分子方差分析(AMOVA)表明,90.04%的遗传变异发生在种群之间,仅有9.96%的变异发生在种群内。进一步分析表明,藏酋猴各地理种群间均不同程度地存在着一定的遗传分化(Fst=0.9004,P<0.05),种群间基因交流较贫乏(Nm<1)。基于最大似然法和邻接法构建的系统发生树均支持四川地区的藏酋猴种群和安徽黄山种群分别聚为不同的类群,支持将它们归入各自的管理单元;而本研究中的四川地区藏酋猴在系统发生树上也分为2个亚支,但这2个亚支并未与地理分布成完全的对应关系,应归为一个管理单元加以保护。
关键词
峨眉山
藏酋猴
MTDNA控制区
遗传多样性
序列变异
Keywords
Emei mountain
Macaca thibetana
mitochondrial DNA control region
genetic diversity
sequence variation
分类号
Q953 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
操作
1
峨眉山藏酋猴mtDNA控制区序列变异及种群遗传多样性
姚永芳
钟丽菁
刘家斌
李苹
王章训
胡江涛
简宏博
徐怀亮
《四川动物》
CSCD
北大核心
2013
1
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