云南边境地区3种外来动物疫病流行情况及病原特性研究

为评估云南边境地区外来动物疫病的风险状况,了解小反刍兽疫(PPR)、裂谷热(RVF)和施马伦贝格(SB)等3种重要外来动物疫病的流行情况,在云南昆明辖区内某大型牲畜交易市场及某规模化奶牛养殖合作社采集绵羊、山羊、牛、马及驴等不同动物鼻拭子样本及血液样本258份(包含境外家畜),应用已建立的PPRV/RVFV/SBV三重实时荧光定量RT-PCR方法进行检测。检测结果显示,在258份样本中,检测到PPRV核酸阳性样本1份,未检测到RVFV/SBV核酸阳性样本。对PPRV核酸阳性样本,应用普通RT-PCR扩增F-H基因接头位置序列和进一步核苷酸序列测序确定其为PPRV谱系Ⅳ型毒株,与2013年新疆伊犁山羊毒株(KM091959)及2014年吉林家养山羊毒株(KM816619)核苷酸同源性最高,达到99.2%。结果提示,云南边境地区交易的山羊中携带PPRV;未检测到RVFV和SBV。

一例PPRV阳性羊鼻拭子样本N、P、M、F、H基因的序列测定和遗传进化分析

为对采集自昆明某大型牲畜交易市场的一例PPRV阳性鼻拭子样本进行追根溯源,设计引物采用RT-PCR方法进行PPRV病毒基因组关键基因N、P、M、F、H核苷酸序列扩增,并进行序列测定和遗传进化分析。结果显示:N、P、M、F、H基因均有预期片段扩增,其读码框(ORF)长度分别为1 578、1 531、1 008、1 641及1 830 nt;N、P、M、F及H构建的遗传进化树均显示所测毒株为基因Ⅳ型,同2013年在新疆伊犁山羊中检测到的毒株(KM091959)同源性最高,N、P、M、F、H核苷酸同源性分别为99.2%、99.0%、99.4%、99.6%和99.3%,推断氨基酸同源性分别为98.7%、98.4%、100.0%、99.8%和99.3%。研究表明,检测到的毒株仍为2013~2014年我国PPRV流行期的基因Ⅳ型毒株,变异较小;所测毒株的N、P、M、F、H 5个关键基因中,M基因最保守、其次是F/H基因,而N、P基因略有变异。