心肌炎和克山病患者分离的肠道病毒核酸序列分析

目的 分析自心肌炎和克山病患者分离的肠道病毒的核酸序列 ,探讨病毒病因的分子基础。方法 使用肠道病毒特异引物对从心肌炎和克山病患者分离的肠道病毒RNA进行RT PCR扩增 ,PCR产物经纯化后分别经不同的引物正反向直接核酸循环测序 ,并应用SeqEd和DNA软件及AssemblyLIGN软件对测序结果进行分析。结果 确定 7株病毒 5′端从核苷酸位点 40到 75 0之间710bp基因序列 ;序列分析结果发现 ,尽管为同血清型病毒 ,但其 5′端非编码区基因变异率仍在 15 %左右 ,而血清型为柯萨奇B5病毒则高达 34 0 8% ,与肠道病毒各血清型之间 5′端非编码区基因变异率无明显差异 ;对血清型为CVB3的两分离株病毒 5′端基因特殊位点分析 ,发现与CVB3标准株 (Nancy株 )比较 2 34位由T→C、6 90位由C→A。结论 确定了所分离到的一些肠道病毒 5′端非编码区基因序列 ;肠道病毒 5′端非编码区基因与血清型关系不大 ;CVB3分离株