基于TCGA和ICGC数据库构建肾透明细胞癌的免疫相关预后模型

目的 构建和验证肾透明细胞癌(kidney clear cell carcinoma, KIRC)的免疫相关预后模型在临床风险分层和预后预测的应用价值,探索肿瘤免疫微环境的特征。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium, ICGC)下载KIRC队列mRNA表达数据集,分别作为目标数据集和验证数据集,从免疫学数据库和分析平台(Immunology Database and Analysis Portal, ImmPort)中下载免疫相关基因列表。基于以上数据集,筛选出差异表达的免疫相关基因并以此构建和验证预后模型。基于预后模型得出的风险评分对肿瘤样本进行分组,探究不同风险评分等级下的免疫细胞浸润水平、免疫检查位点及其配体表达水平的差异。结果 共筛选出11个差异表达且关联预后的免疫相关基因,以此构建的预后模型预测3年、4年、5年生存率的ROC曲线下面积分别为0.669、0.707和0.750。基于该模型得到的高风险评分与较高的肿瘤分期(P<0.05)、较差的预后(P<0.000 1)均显著相关,并在验证数据集中得到进一步验证。在对总生存时间的风险率上,风险评分比差异表达的任一单个免疫相关基因高(风险率:1.93 vs 1.37),但与肿瘤分期Ⅲ期相当(风险率:1.93 vs 1.97)。基于风险评分分组,在高风险组和低风险组间的浸润程度存在显著差异的免疫细胞类型达12种(P<0.05),其中,调节T细胞、M0型巨噬细胞、活化的记忆CD4+T细胞和休眠树突状细胞的浸润程度高低与预后均显著相关(P<0.05)。此外,免疫治疗相关靶点的表达水平在不同风险评分等级中存在显著差异(P<0.05)。结论 构建的KIRC免疫相关预后模型在评估肿瘤分期和预后具有潜在的临床应用价值,有望为临床风险分层和免疫治疗提供证据。