目的:通过生物信息学方法分析甲状腺乳头状癌预后相关基因,为后续实验提供理论基础,以便进一步研究甲状腺乳头状癌发生的可能机制。方法:利用生物信息学方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载甲状腺乳头状癌...目的:通过生物信息学方法分析甲状腺乳头状癌预后相关基因,为后续实验提供理论基础,以便进一步研究甲状腺乳头状癌发生的可能机制。方法:利用生物信息学方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载甲状腺乳头状癌和癌旁组织样本的RNA测序数据,通过差异分析获取差异基因;利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes Genomes,KEGG)进行差异基因生物学功能和通路富集分析;通过蛋白交互网络分析法(protein-protein interaction,PPI)筛选出关键基因;通过生存分析研究关键基因对甲状腺乳头状癌患者生存预后的影响。结果:在TCGA数据库中共筛选出甲状腺乳头状癌患者237例,其中甲状腺乳头状癌组织212例,甲状腺癌旁组织25例。通过差异基因分析后共筛选出715个差异基因;通路富集分析显示,神经信号转导活性、逆行内源性大麻素信号为主要的信号通路;通过PPI法共筛选出18个关键基因,包含9个上调基因和9个下调基因;通过生存分析发现高表达OPRK1的患者预后较差。结论:OPRK1的表达水平变化与患者的生存时间存在显著相关性,具体机制有待进一步研究。展开更多
目的:探讨盆腔超声在特发性中枢性性早熟(Idiopathic central precocious puberty,ICPP)女童诊断中的临床应用价值。方法:回顾性分析我院及汕头潮南民生医院2019年1月至2020年1月20例采用盆腔超声诊断ICPP女童的临床资料,对临床及实验...目的:探讨盆腔超声在特发性中枢性性早熟(Idiopathic central precocious puberty,ICPP)女童诊断中的临床应用价值。方法:回顾性分析我院及汕头潮南民生医院2019年1月至2020年1月20例采用盆腔超声诊断ICPP女童的临床资料,对临床及实验室确诊为真性性早熟的20例女童与27例正常女童进行盆腔超声检查,检查其子宫上下径、前后径、左右径、容积,左右卵巢大小、容积、超过4mm的最大卵泡直径,将盆腔超声的测量数据做相关性分析并采用ROC曲线诊断其工作效能,计算其曲线下面积。结果:使用Mann-Whitney U法分析得出,真性性早熟组与正常组子宫、左右卵巢各项数值比较,均高于后者;相关性分析结果中得出,盆腔超声测量左右卵巢及子宫各数据结果呈现正相关,盆腔声检测子宫(上下径、前后径、左右径、容积)效能的AUC依次为0.985、0.822、0.967、0.831,敏感度依次为95%、80%、90%、85%,特异度依次为92.6%、77.8%、100%、70.4%;盆腔超声检测左卵巢(上下径、左右径、前后径、容积)效能AUC依次为0.976、0.805、0.946、0.784,敏感度依次为95%、75%、85%、50%,特异度依次为100%、74.1%、85.2%、100%;盆腔超声检测患者右卵巢(上下径、前后径、左右径、容积)AUC依次为0.991、0.839、0.983、0.828,敏感度依次为90%、75%、95%、60%,特异度依次为100%、77.8%、88.9%、96.3%,组间差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:盆腔超声诊断ICPP女童效能较高,值得为临床提供借鉴参考。展开更多
文摘目的:通过生物信息学方法分析甲状腺乳头状癌预后相关基因,为后续实验提供理论基础,以便进一步研究甲状腺乳头状癌发生的可能机制。方法:利用生物信息学方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载甲状腺乳头状癌和癌旁组织样本的RNA测序数据,通过差异分析获取差异基因;利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes Genomes,KEGG)进行差异基因生物学功能和通路富集分析;通过蛋白交互网络分析法(protein-protein interaction,PPI)筛选出关键基因;通过生存分析研究关键基因对甲状腺乳头状癌患者生存预后的影响。结果:在TCGA数据库中共筛选出甲状腺乳头状癌患者237例,其中甲状腺乳头状癌组织212例,甲状腺癌旁组织25例。通过差异基因分析后共筛选出715个差异基因;通路富集分析显示,神经信号转导活性、逆行内源性大麻素信号为主要的信号通路;通过PPI法共筛选出18个关键基因,包含9个上调基因和9个下调基因;通过生存分析发现高表达OPRK1的患者预后较差。结论:OPRK1的表达水平变化与患者的生存时间存在显著相关性,具体机制有待进一步研究。
文摘目的:探讨盆腔超声在特发性中枢性性早熟(Idiopathic central precocious puberty,ICPP)女童诊断中的临床应用价值。方法:回顾性分析我院及汕头潮南民生医院2019年1月至2020年1月20例采用盆腔超声诊断ICPP女童的临床资料,对临床及实验室确诊为真性性早熟的20例女童与27例正常女童进行盆腔超声检查,检查其子宫上下径、前后径、左右径、容积,左右卵巢大小、容积、超过4mm的最大卵泡直径,将盆腔超声的测量数据做相关性分析并采用ROC曲线诊断其工作效能,计算其曲线下面积。结果:使用Mann-Whitney U法分析得出,真性性早熟组与正常组子宫、左右卵巢各项数值比较,均高于后者;相关性分析结果中得出,盆腔超声测量左右卵巢及子宫各数据结果呈现正相关,盆腔声检测子宫(上下径、前后径、左右径、容积)效能的AUC依次为0.985、0.822、0.967、0.831,敏感度依次为95%、80%、90%、85%,特异度依次为92.6%、77.8%、100%、70.4%;盆腔超声检测左卵巢(上下径、左右径、前后径、容积)效能AUC依次为0.976、0.805、0.946、0.784,敏感度依次为95%、75%、85%、50%,特异度依次为100%、74.1%、85.2%、100%;盆腔超声检测患者右卵巢(上下径、前后径、左右径、容积)AUC依次为0.991、0.839、0.983、0.828,敏感度依次为90%、75%、95%、60%,特异度依次为100%、77.8%、88.9%、96.3%,组间差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论:盆腔超声诊断ICPP女童效能较高,值得为临床提供借鉴参考。
