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2016-2017年深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点 被引量:13
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作者 任燕 靳淼 +7 位作者 许少坚 张海龙 全德甫 赖晓玲 满云翔 郝夏琼 王金明 林启辉 《国际病毒学杂志》 2018年第2期109-112,共4页
目的分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。方法选取2016年10月-2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道(观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜)29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标... 目的分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。方法选取2016年10月-2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道(观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜)29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标本,共计317份,采用荧光定量PCR方法对样品进行诺如病毒检测,阳性样本进一步用逆转录PCR法同时对聚合酶区-衣壳区进行基因扩增,并进行测序和进化分析以鉴定其基因型。结果317例疑似病例中,实验室确诊156例,其中5岁以下儿童99例(63.46%,99/156)。29起聚集性胃肠炎疫情报告单位主要为幼儿园,占75.9%(22/29)。在317份标本中,156份为诺如病毒GII核酸阳性,阳性率为49.21%。未检出诺如病毒GI。对156份诺如病毒GH核酸阳性的标本进行聚合酶区-衣壳区序列逆转录PCR扩增,共82份阳性,获得82株毒株序列。系统发生树构建结果发现,2016年10月—2017年9月期间,引起深圳市龙华区诺如病毒疫情的基因型有4种,包括GII.P16-G11.2、GII.Pe-GII.4Sydney2012、GII.P17-GII.17和GH.P12-GII.3。其中,GII.P16-GII.2引起的有18起,占62.1%(18/29)。结论深圳市龙华区应进一步加强诺如病毒聚集性疫情监测,重点关注幼儿园5岁及以下儿童,并且要重点监测是否有变异株出现。 展开更多
关键词 腹泻 诺如病毒 基因型 种系发生
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2017年深圳市龙华区手足口病病原学特征分析 被引量:3
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作者 王金明 许少坚 +8 位作者 姚相杰 任燕 陈龙 全德甫 郝夏琼 叶春立 赖晓玲 满云翔 林启辉 《国际病毒学杂志》 2018年第4期258-261,共4页
目的 分析2017年深圳市龙华区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原学特点.方法 采用实时荧光PCR方法对哨点医院送检的242份HFMD临床诊断病例的肛拭子样品进行肠道病毒(enteroviurs,EV)、肠道病毒A组71型(EV71)和柯萨... 目的 分析2017年深圳市龙华区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原学特点.方法 采用实时荧光PCR方法对哨点医院送检的242份HFMD临床诊断病例的肛拭子样品进行肠道病毒(enteroviurs,EV)、肠道病毒A组71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV A16)核酸检测,并对非EV71非CV A16的其他肠道病毒和EV71的VP1区序列进行测定,亚型鉴定和系统进化分析.结果 实验室确诊病例有190例,阳性率为78.51%(190/242),其中,EV71感染32例(16.84%,32/190)、CV A16感染11例(5.79%,11/190)、CV A6感染126例(66.32%,126/190).实验室确诊病例中,男性占57.9% (110/190),女性占42.1%(80/190);3岁以下儿童占78.95%(50/190).系统进化树分析结果显示,2017年深圳市龙华区流行的EV71属于C4a进化分支,CV A6属于D3进化分支,CV A10属于C进化分支.结论 深圳市龙华区应进一步加强辖区HFMD监测,重点关注3岁以下儿童及病原谱构成和重要病原体进化情况. 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒属 生物进化 种系发生
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