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2016-2017年深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点
被引量:
13
1
作者
任燕
靳淼
+7 位作者
许少坚
张海龙
全德甫
赖晓玲
满云翔
郝夏琼
王金明
林启辉
《国际病毒学杂志》
2018年第2期109-112,共4页
目的分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。方法选取2016年10月-2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道(观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜)29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标...
目的分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。方法选取2016年10月-2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道(观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜)29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标本,共计317份,采用荧光定量PCR方法对样品进行诺如病毒检测,阳性样本进一步用逆转录PCR法同时对聚合酶区-衣壳区进行基因扩增,并进行测序和进化分析以鉴定其基因型。结果317例疑似病例中,实验室确诊156例,其中5岁以下儿童99例(63.46%,99/156)。29起聚集性胃肠炎疫情报告单位主要为幼儿园,占75.9%(22/29)。在317份标本中,156份为诺如病毒GII核酸阳性,阳性率为49.21%。未检出诺如病毒GI。对156份诺如病毒GH核酸阳性的标本进行聚合酶区-衣壳区序列逆转录PCR扩增,共82份阳性,获得82株毒株序列。系统发生树构建结果发现,2016年10月—2017年9月期间,引起深圳市龙华区诺如病毒疫情的基因型有4种,包括GII.P16-G11.2、GII.Pe-GII.4Sydney2012、GII.P17-GII.17和GH.P12-GII.3。其中,GII.P16-GII.2引起的有18起,占62.1%(18/29)。结论深圳市龙华区应进一步加强诺如病毒聚集性疫情监测,重点关注幼儿园5岁及以下儿童,并且要重点监测是否有变异株出现。
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关键词
腹泻
诺如病毒
基因型
种系发生
原文传递
2017年深圳市龙华区手足口病病原学特征分析
被引量:
3
2
作者
王金明
许少坚
+8 位作者
姚相杰
任燕
陈龙
全德甫
郝夏琼
叶春立
赖晓玲
满云翔
林启辉
《国际病毒学杂志》
2018年第4期258-261,共4页
目的 分析2017年深圳市龙华区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原学特点.方法 采用实时荧光PCR方法对哨点医院送检的242份HFMD临床诊断病例的肛拭子样品进行肠道病毒(enteroviurs,EV)、肠道病毒A组71型(EV71)和柯萨...
目的 分析2017年深圳市龙华区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原学特点.方法 采用实时荧光PCR方法对哨点医院送检的242份HFMD临床诊断病例的肛拭子样品进行肠道病毒(enteroviurs,EV)、肠道病毒A组71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV A16)核酸检测,并对非EV71非CV A16的其他肠道病毒和EV71的VP1区序列进行测定,亚型鉴定和系统进化分析.结果 实验室确诊病例有190例,阳性率为78.51%(190/242),其中,EV71感染32例(16.84%,32/190)、CV A16感染11例(5.79%,11/190)、CV A6感染126例(66.32%,126/190).实验室确诊病例中,男性占57.9% (110/190),女性占42.1%(80/190);3岁以下儿童占78.95%(50/190).系统进化树分析结果显示,2017年深圳市龙华区流行的EV71属于C4a进化分支,CV A6属于D3进化分支,CV A10属于C进化分支.结论 深圳市龙华区应进一步加强辖区HFMD监测,重点关注3岁以下儿童及病原谱构成和重要病原体进化情况.
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关键词
手足口病
肠道病毒属
生物进化
种系发生
原文传递
题名
2016-2017年深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点
被引量:
13
1
作者
任燕
靳淼
许少坚
张海龙
全德甫
赖晓玲
满云翔
郝夏琼
王金明
林启辉
机构
广东省深圳市龙华区疾病预防控制中心龙华新区传染病预防控制重点实验室龙华区公共卫生应急检测重点实验室
中国
疾病预防控制中心
病毒病
预防
控制
所
深圳市
疾病预防控制中心
病原生物研究所
出处
《国际病毒学杂志》
2018年第2期109-112,共4页
基金
深圳市龙华区科技创新项目(20150618A0410009)
文摘
目的分析深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点。方法选取2016年10月-2017年9月期间深圳市龙华区共6个街道(观湖、民治、龙华、大浪、福城和观澜)29起聚集性胃肠炎疫情中的317例疑似病例作为研究对象。收集研究对象肛拭子标本,共计317份,采用荧光定量PCR方法对样品进行诺如病毒检测,阳性样本进一步用逆转录PCR法同时对聚合酶区-衣壳区进行基因扩增,并进行测序和进化分析以鉴定其基因型。结果317例疑似病例中,实验室确诊156例,其中5岁以下儿童99例(63.46%,99/156)。29起聚集性胃肠炎疫情报告单位主要为幼儿园,占75.9%(22/29)。在317份标本中,156份为诺如病毒GII核酸阳性,阳性率为49.21%。未检出诺如病毒GI。对156份诺如病毒GH核酸阳性的标本进行聚合酶区-衣壳区序列逆转录PCR扩增,共82份阳性,获得82株毒株序列。系统发生树构建结果发现,2016年10月—2017年9月期间,引起深圳市龙华区诺如病毒疫情的基因型有4种,包括GII.P16-G11.2、GII.Pe-GII.4Sydney2012、GII.P17-GII.17和GH.P12-GII.3。其中,GII.P16-GII.2引起的有18起,占62.1%(18/29)。结论深圳市龙华区应进一步加强诺如病毒聚集性疫情监测,重点关注幼儿园5岁及以下儿童,并且要重点监测是否有变异株出现。
关键词
腹泻
诺如病毒
基因型
种系发生
Keywords
Diarrhea
Norovirus
Genotype
Phylogeny
分类号
R512.5 [医药卫生—内科学]
R181.3 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
2017年深圳市龙华区手足口病病原学特征分析
被引量:
3
2
作者
王金明
许少坚
姚相杰
任燕
陈龙
全德甫
郝夏琼
叶春立
赖晓玲
满云翔
林启辉
机构
广东省深圳市龙华区疾病预防控制中心龙华新区传染病预防控制重点实验室龙华区公共卫生应急检测重点实验室
深圳市
疾病预防控制中心
病原生物研究所
广东
医科大学
公共
卫生
学院
出处
《国际病毒学杂志》
2018年第4期258-261,共4页
基金
深圳市科技创新项目(JCYJ20160428143914757)
深圳市龙华区科技创新项目(20150618A0410009)
深圳市龙华区科技创新项目(20160825A041006)
文摘
目的 分析2017年深圳市龙华区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原学特点.方法 采用实时荧光PCR方法对哨点医院送检的242份HFMD临床诊断病例的肛拭子样品进行肠道病毒(enteroviurs,EV)、肠道病毒A组71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV A16)核酸检测,并对非EV71非CV A16的其他肠道病毒和EV71的VP1区序列进行测定,亚型鉴定和系统进化分析.结果 实验室确诊病例有190例,阳性率为78.51%(190/242),其中,EV71感染32例(16.84%,32/190)、CV A16感染11例(5.79%,11/190)、CV A6感染126例(66.32%,126/190).实验室确诊病例中,男性占57.9% (110/190),女性占42.1%(80/190);3岁以下儿童占78.95%(50/190).系统进化树分析结果显示,2017年深圳市龙华区流行的EV71属于C4a进化分支,CV A6属于D3进化分支,CV A10属于C进化分支.结论 深圳市龙华区应进一步加强辖区HFMD监测,重点关注3岁以下儿童及病原谱构成和重要病原体进化情况.
关键词
手足口病
肠道病毒属
生物进化
种系发生
Keywords
Hand,foot,and mouth disease
Enterovirus
Biological evolution
Phylogeny
分类号
R725.1 [医药卫生—儿科]
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2016-2017年深圳市龙华区诺如病毒疫情流行特征及病原学特点
任燕
靳淼
许少坚
张海龙
全德甫
赖晓玲
满云翔
郝夏琼
王金明
林启辉
《国际病毒学杂志》
2018
13
原文传递
2
2017年深圳市龙华区手足口病病原学特征分析
王金明
许少坚
姚相杰
任燕
陈龙
全德甫
郝夏琼
叶春立
赖晓玲
满云翔
林启辉
《国际病毒学杂志》
2018
3
原文传递
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