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番木瓜TCP转录因子鉴定及在果实成熟中的表达
1
作者
周汪洋
吴飞燕
+4 位作者
赵苗羽
黄蕾
陈雄进
周艳
刘锴栋
《浙江农业科学》
2024年第11期2693-2702,共10页
TCP蛋白是植物特有的转录因子,在植物生长发育、信号转导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。该研究利用生物信息学方法对番木瓜TCP基因家族成员进行系统鉴定,并对其进化关系、保守基序、保守结构域、基因结构、蛋白三级结构和其在果实...
TCP蛋白是植物特有的转录因子,在植物生长发育、信号转导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。该研究利用生物信息学方法对番木瓜TCP基因家族成员进行系统鉴定,并对其进化关系、保守基序、保守结构域、基因结构、蛋白三级结构和其在果实成熟中表达模式进行了相关分析。结果表明,番木瓜TCP基因家族中含有22个成员;TCP基因家族成员可分为2大类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可细分为CYC/TB1和CIN两个亚类;同一亚组内,TCP蛋白具有相似的保守基序和保守结构域,不同亚组之间具有较大差异,表明不同类型TCP蛋白可能具有独特的生理功能;22个家族成员均有bHLH(basic-helix-loop-helix)保守区,且其基因结构由1~7个外显子和1~6个内含子构成;ClassⅡ亚族基因表达量随着果实的成熟显著下调,推测ClassⅡ亚族成员能够抑制果实成熟。这些结果有助于今后揭示番木瓜TCP基因家族成员的功能。
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关键词
番木瓜
TCP转录因子
生物信息学分析
表达分析
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职称材料
题名
番木瓜TCP转录因子鉴定及在果实成熟中的表达
1
作者
周汪洋
吴飞燕
赵苗羽
黄蕾
陈雄进
周艳
刘锴栋
机构
广东
海洋大学滨海农业学院
岭南师范学院生命科学与技术学院
湛江市农业科学研究院
广东省热带特色资源植物科技创新中心
湛江市
热带
特色
资源
植物
技术开发重点实验室
出处
《浙江农业科学》
2024年第11期2693-2702,共10页
基金
国家自然科学基金面上项目(32372414)
广东省自然科学基金项目(2022A1515010719,2023A1515012212)
+2 种基金
广东省科技专项资金项目(2021A05192,2021A05222)
岭南师范学院雷阳学者岗位计划项目(2022)
广东省大学生科技创新培育项目(pdjh2023b0328)。
文摘
TCP蛋白是植物特有的转录因子,在植物生长发育、信号转导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。该研究利用生物信息学方法对番木瓜TCP基因家族成员进行系统鉴定,并对其进化关系、保守基序、保守结构域、基因结构、蛋白三级结构和其在果实成熟中表达模式进行了相关分析。结果表明,番木瓜TCP基因家族中含有22个成员;TCP基因家族成员可分为2大类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可细分为CYC/TB1和CIN两个亚类;同一亚组内,TCP蛋白具有相似的保守基序和保守结构域,不同亚组之间具有较大差异,表明不同类型TCP蛋白可能具有独特的生理功能;22个家族成员均有bHLH(basic-helix-loop-helix)保守区,且其基因结构由1~7个外显子和1~6个内含子构成;ClassⅡ亚族基因表达量随着果实的成熟显著下调,推测ClassⅡ亚族成员能够抑制果实成熟。这些结果有助于今后揭示番木瓜TCP基因家族成员的功能。
关键词
番木瓜
TCP转录因子
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Carica papaya
TCP transcription factor
bioinformatics analysis
expression pattern
分类号
S661.6 [农业科学—果树学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番木瓜TCP转录因子鉴定及在果实成熟中的表达
周汪洋
吴飞燕
赵苗羽
黄蕾
陈雄进
周艳
刘锴栋
《浙江农业科学》
2024
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