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番木瓜TCP转录因子鉴定及在果实成熟中的表达
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作者 周汪洋 吴飞燕 +4 位作者 赵苗羽 黄蕾 陈雄进 周艳 刘锴栋 《浙江农业科学》 2024年第11期2693-2702,共10页
TCP蛋白是植物特有的转录因子,在植物生长发育、信号转导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。该研究利用生物信息学方法对番木瓜TCP基因家族成员进行系统鉴定,并对其进化关系、保守基序、保守结构域、基因结构、蛋白三级结构和其在果实... TCP蛋白是植物特有的转录因子,在植物生长发育、信号转导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。该研究利用生物信息学方法对番木瓜TCP基因家族成员进行系统鉴定,并对其进化关系、保守基序、保守结构域、基因结构、蛋白三级结构和其在果实成熟中表达模式进行了相关分析。结果表明,番木瓜TCP基因家族中含有22个成员;TCP基因家族成员可分为2大类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可细分为CYC/TB1和CIN两个亚类;同一亚组内,TCP蛋白具有相似的保守基序和保守结构域,不同亚组之间具有较大差异,表明不同类型TCP蛋白可能具有独特的生理功能;22个家族成员均有bHLH(basic-helix-loop-helix)保守区,且其基因结构由1~7个外显子和1~6个内含子构成;ClassⅡ亚族基因表达量随着果实的成熟显著下调,推测ClassⅡ亚族成员能够抑制果实成熟。这些结果有助于今后揭示番木瓜TCP基因家族成员的功能。 展开更多
关键词 番木瓜 TCP转录因子 生物信息学分析 表达分析
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