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基底膜相关基因风险模型在胃癌中的分析应用
1
作者
李鸿昊
许鸣
+2 位作者
韩美霞
邓媛媛
黎丽旋
《现代消化及介入诊疗》
2022年第9期1090-1099,1105,共11页
目的 分析基底膜(BM)相关基因在胃癌中的表达意义。方法 从公共数据库下载BM相关基因、胃癌转录组数据与临床信息;基于TCGA筛选BM差异基因后进行COX和Lasso回归分析构建风险模型,分析风险评分与生存预后以及临床特征之间的关系,GSE2625...
目的 分析基底膜(BM)相关基因在胃癌中的表达意义。方法 从公共数据库下载BM相关基因、胃癌转录组数据与临床信息;基于TCGA筛选BM差异基因后进行COX和Lasso回归分析构建风险模型,分析风险评分与生存预后以及临床特征之间的关系,GSE26253队列验证其预测生存预后的准确性。功能富集、GSVA分析风险基因潜在的作用通路。计算免疫细胞浸润与风险评分之间的关系,基于风险基因模型发掘胃癌相关的免疫检查点。结果 基底膜相关基因高风险评分是胃癌患者生存预后的独立危险因素;风险基因与免疫功能密切相关(P<0.05);风险基因相关的免疫检查点及相关通路存在关联(P<0.05)。结论 基底膜相关风险基因模型在胃癌中具有重要的临床应用价值。
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关键词
胃癌
基底膜基因
风险模型
免疫检查点
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职称材料
题名
基底膜相关基因风险模型在胃癌中的分析应用
1
作者
李鸿昊
许鸣
韩美霞
邓媛媛
黎丽旋
机构
广东省第二人民医院
民航
院区
内二科
广东省第二人民医院琶洲院区消化内科
出处
《现代消化及介入诊疗》
2022年第9期1090-1099,1105,共11页
基金
广东省中药局科研项目(20211014)。
文摘
目的 分析基底膜(BM)相关基因在胃癌中的表达意义。方法 从公共数据库下载BM相关基因、胃癌转录组数据与临床信息;基于TCGA筛选BM差异基因后进行COX和Lasso回归分析构建风险模型,分析风险评分与生存预后以及临床特征之间的关系,GSE26253队列验证其预测生存预后的准确性。功能富集、GSVA分析风险基因潜在的作用通路。计算免疫细胞浸润与风险评分之间的关系,基于风险基因模型发掘胃癌相关的免疫检查点。结果 基底膜相关基因高风险评分是胃癌患者生存预后的独立危险因素;风险基因与免疫功能密切相关(P<0.05);风险基因相关的免疫检查点及相关通路存在关联(P<0.05)。结论 基底膜相关风险基因模型在胃癌中具有重要的临床应用价值。
关键词
胃癌
基底膜基因
风险模型
免疫检查点
Keywords
gastric cancer
basement membrane genes
risk modeling
Immune checkpoints
分类号
R-735 [医药卫生]
R-573 [医药卫生]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基底膜相关基因风险模型在胃癌中的分析应用
李鸿昊
许鸣
韩美霞
邓媛媛
黎丽旋
《现代消化及介入诊疗》
2022
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