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光谱法结合分子对接研究普罗帕酮与牛血清白蛋白的相互作用
被引量:
7
1
作者
李楠
曾观娣
+1 位作者
孙正华
银兴峰
《分析试验室》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1148-1154,共7页
综合运用圆二色谱、停留-动力学、荧光、同步荧光、三维荧光、等温量热滴定法(ITC)等技术并结合分子对接进行表征牛血清白蛋白(BSA)与普罗帕酮的结合热力学及结合动力学参数。研究结果表明,BSA对普罗帕酮结合特异,在291K,298K,310K二者...
综合运用圆二色谱、停留-动力学、荧光、同步荧光、三维荧光、等温量热滴定法(ITC)等技术并结合分子对接进行表征牛血清白蛋白(BSA)与普罗帕酮的结合热力学及结合动力学参数。研究结果表明,BSA对普罗帕酮结合特异,在291K,298K,310K二者的亲和常数分别是2.612×105,2.879×105,6.793×105mol^-1,结合位点数n约为1。同步荧光光谱及三维荧光光谱表明,普罗帕酮与BSA结合后,荧光光谱发生蓝移,揭示BSA结合药物分子后高级构象发生变化。BSA结合普罗帕酮的停留-动力学反应符合三级指数方程曲线,快反应在约0.03 s完成结合,结合速率常数k1=0.097!0.02 s^-1,k2=1.058!0.18 s^-1,k3=31.410!1.18 s^-1。进一步通过分子对接显示普罗帕酮结合在蛋白的I域的IB疏水性口袋中,有12个氨基酸残基参与配体结合,其中Tyr160与Phe13各提供1个氢键参与配体结合,而带电氨基酸Glu125,Lys136,Arg185紧紧把配体束缚在结合口袋中。研究工作将有助于在分子水平上更为详细了解普罗帕酮与BSA的相互作用,并为进一步了解普罗帕酮在生物体内的作用提供理论基础。
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关键词
普罗帕酮
圆二色谱
荧光光谱
停留-动力学
分子对接
原文传递
题名
光谱法结合分子对接研究普罗帕酮与牛血清白蛋白的相互作用
被引量:
7
1
作者
李楠
曾观娣
孙正华
银兴峰
机构
广东省高等学校功能蛋白研究重点实验室
出处
《分析试验室》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第10期1148-1154,共7页
基金
国家自然科学基金项目(81603162)资助。
文摘
综合运用圆二色谱、停留-动力学、荧光、同步荧光、三维荧光、等温量热滴定法(ITC)等技术并结合分子对接进行表征牛血清白蛋白(BSA)与普罗帕酮的结合热力学及结合动力学参数。研究结果表明,BSA对普罗帕酮结合特异,在291K,298K,310K二者的亲和常数分别是2.612×105,2.879×105,6.793×105mol^-1,结合位点数n约为1。同步荧光光谱及三维荧光光谱表明,普罗帕酮与BSA结合后,荧光光谱发生蓝移,揭示BSA结合药物分子后高级构象发生变化。BSA结合普罗帕酮的停留-动力学反应符合三级指数方程曲线,快反应在约0.03 s完成结合,结合速率常数k1=0.097!0.02 s^-1,k2=1.058!0.18 s^-1,k3=31.410!1.18 s^-1。进一步通过分子对接显示普罗帕酮结合在蛋白的I域的IB疏水性口袋中,有12个氨基酸残基参与配体结合,其中Tyr160与Phe13各提供1个氢键参与配体结合,而带电氨基酸Glu125,Lys136,Arg185紧紧把配体束缚在结合口袋中。研究工作将有助于在分子水平上更为详细了解普罗帕酮与BSA的相互作用,并为进一步了解普罗帕酮在生物体内的作用提供理论基础。
关键词
普罗帕酮
圆二色谱
荧光光谱
停留-动力学
分子对接
Keywords
propafenone
circular dichroism
fluorescence spectroscopy
stopped-flow
molecular docking
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
光谱法结合分子对接研究普罗帕酮与牛血清白蛋白的相互作用
李楠
曾观娣
孙正华
银兴峰
《分析试验室》
CAS
CSCD
北大核心
2020
7
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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