与胰腺癌免疫预后相关的自噬相关基因预测

目的通过表征自噬相关基因(ARGs)在胰腺癌(PAAD)中的表达模式和预后,寻找与胰腺癌免疫治疗预后不良相关的候选基因。方法从人类自噬数据库(HADb)和基因集富集分析(GSEA)网站获得566个自噬相关基因,通过GEPIA、Kaplan-Meier Plotter和cBioPortal数据库检测胰腺癌患者中ARGs的RNA-seq表达和生存分析数据,筛选出与无复发生存期(RFS)和总生存期(OS)显著相关的差异表达基因(DEGs)。利用DAVID及STRING数据库进行GO和KEGG分析,预测相关信号通路。利用TISIDB分析ARGs的表达量与肿瘤浸润淋巴细胞及免疫检查点抑制剂的相关性。结果GEPIA分析结果显示大部分DEGs在胰腺癌中表达高于正常胰腺组织(P<0.05)。生存分析结果表明CTTN、MET、MTDH、RALB、RIPK2、BCL2L1、CHMP2B、EIF2S1、ITGA3、NCKAP1、SH3GLB1表达高的患者有更低的OS和RFS。ATP6V0D1、ATP6V0A1、ATP6V0E2、MAP1LC3A表达高的患者有更高的OS和RFS。KEGG表明NOD样受体信号通路、PI3K-AKT信号通路和RAS信号通路是预后不良相关基因的主要的信号通路。TISIDB分析表明,候选ARGs与肿瘤浸润淋巴细胞之间的相关性趋势同ARGs与免疫检查点抑制剂之间的趋势存在相似性。结论自噬相关基因MET、RALB、RIPK2、BCL2L1、ITGA3在胰腺癌中表达升高,是潜在的影响免疫治疗预后不良的候选基因。