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灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
被引量:
1
1
作者
沈彦辉
陈宏坤
+2 位作者
高璐阳
徐广飞
付强强
《山东农业科学》
2020年第3期13-18,共6页
本研究选取灰葡萄孢菌株BC05.10为试材,克隆Bctre1基因的核苷酸序列并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR法研究该基因在不同侵染时期、分生孢子萌发过程中以及不同碳源、海藻糖诱导下的表达情况。结果表明:该基因ID号为54282...
本研究选取灰葡萄孢菌株BC05.10为试材,克隆Bctre1基因的核苷酸序列并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR法研究该基因在不同侵染时期、分生孢子萌发过程中以及不同碳源、海藻糖诱导下的表达情况。结果表明:该基因ID号为5428296,全长3341bp,位于scaffold_17负链的495880~499211位置,与核盘菌Sstre1的同源关系较近;BcTRE1蛋白由1033个氨基酸残基编码组成,该蛋白N端具有2个6发卡结构的超糖苷酶家族和1个C端糖基水解酶家族63。荧光定量PCR结果显示,随着侵染时间的延长Bctre1表达量显著增加(P<0.05),48h后表达量增加不显著;Bctre1在分生孢子萌发24h时表达量最高;Bctre1在海藻糖为单一碳源的培养基中表达量最高,在海藻糖诱导下12h后Bctre1表达量显著增加(P<0.05)。综上,Bctre1与侵染寄主过程中分生孢子萌发及不同碳源利用密切相关,在侵染后期对促进菌丝生长发挥重要作用。
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关键词
灰葡萄孢
Bctre1
基因组定位
蛋白结构
表达分析
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职称材料
题名
灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
被引量:
1
1
作者
沈彦辉
陈宏坤
高璐阳
徐广飞
付强强
机构
金正大
生态工程
集团股份
有限公司
/养分资源高效开发与综合利用国家重点实验室
广东金正大生态工程有限公司/广东省缓控释肥工程技术研究中心
出处
《山东农业科学》
2020年第3期13-18,共6页
基金
2017年清远市创新创业科研团队项目(2017002)
清远市科技计划项目(DZXQY011)。
文摘
本研究选取灰葡萄孢菌株BC05.10为试材,克隆Bctre1基因的核苷酸序列并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR法研究该基因在不同侵染时期、分生孢子萌发过程中以及不同碳源、海藻糖诱导下的表达情况。结果表明:该基因ID号为5428296,全长3341bp,位于scaffold_17负链的495880~499211位置,与核盘菌Sstre1的同源关系较近;BcTRE1蛋白由1033个氨基酸残基编码组成,该蛋白N端具有2个6发卡结构的超糖苷酶家族和1个C端糖基水解酶家族63。荧光定量PCR结果显示,随着侵染时间的延长Bctre1表达量显著增加(P<0.05),48h后表达量增加不显著;Bctre1在分生孢子萌发24h时表达量最高;Bctre1在海藻糖为单一碳源的培养基中表达量最高,在海藻糖诱导下12h后Bctre1表达量显著增加(P<0.05)。综上,Bctre1与侵染寄主过程中分生孢子萌发及不同碳源利用密切相关,在侵染后期对促进菌丝生长发挥重要作用。
关键词
灰葡萄孢
Bctre1
基因组定位
蛋白结构
表达分析
Keywords
Botrytis cinerea
Bctre1
Genome location
Protein structure
Expression analysis
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
沈彦辉
陈宏坤
高璐阳
徐广飞
付强强
《山东农业科学》
2020
1
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