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基于网络药理学及分子对接探讨龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制
被引量:
1
1
作者
陈丹媛
罗敏
+8 位作者
高卓维
郝民琦
黄景彬
黄玉筠
朱亚莉
聂涛
陈锡传
龙德
林丽珠
《现代消化及介入诊疗》
2023年第9期1117-1124,共8页
目的本研究目的是通过网络药理学及分子对接方法探寻龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集龙葵-肿节风药对活性成分;在TTD、DrugBank、Pharmgkb等疾病靶点数据库搜索汇总出胃癌基因靶点。利用Cytoscape软件构建...
目的本研究目的是通过网络药理学及分子对接方法探寻龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集龙葵-肿节风药对活性成分;在TTD、DrugBank、Pharmgkb等疾病靶点数据库搜索汇总出胃癌基因靶点。利用Cytoscape软件构建“龙葵-肿节风药对活性成分—胃癌交集靶点”关系网络图。使用String数据库构建靶点蛋白相互作用网络(PPI)并用Cytoscape软件筛选出得出核心靶点。同时利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集从宏观角度分析核心靶点,并通过Autodock软件进行分子对接验证主要成分-核心靶点结合活性。结果我们确定了龙葵-肿节风药对主要的药物活性成分主要是槲皮素和β-谷甾醇;核心靶点分别为AKT1、TNF、IL6、TP53和IL1B。KEGG富集分析表明,PI3K-Akt信号通路及炎症相关信号通路可能是重要的通路。GO分析提示主要涉及的生物过程包括对激素的反应、细胞对氮化合物的反应、对异生刺激的反应等;参与的分子功能包括转录因子结合、蛋白质均二聚活性、蛋白质结构域特异性结合等;涉及的细胞组分主要是膜筏、转录调节复合体、质膜蛋白复合物等。分子对接结果表明,主要活性与核心靶点具有良好的结合活性。结论研究表明,龙葵-肿节风药对可能主要通过作用于AKT1、TNF、IL6、TP53和IL1B等靶点,进而调控PI3K-Akt通路、炎症等相关通路,从多靶点、多通路发挥治疗胃癌的作用。本研究为后续开展龙葵-肿节风药对抗胃癌的体内外实验研究奠定了基础。
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关键词
网络药理学
分子对接
龙葵
肿节风
PI3K-AKT信号通路
药对
下载PDF
职称材料
题名
基于网络药理学及分子对接探讨龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制
被引量:
1
1
作者
陈丹媛
罗敏
高卓维
郝民琦
黄景彬
黄玉筠
朱亚莉
聂涛
陈锡传
龙德
林丽珠
机构
广州中医药大学
顺德
医院
(
顺德区
肿瘤
诊疗
中心
)
南方医科
大学
南方
医院
南方医科
大学
中西医结合
医院
龙德省名
中医
传承工作室
广州中医药大学
第一附属
医院
岭南
肿瘤
研究所
出处
《现代消化及介入诊疗》
2023年第9期1117-1124,共8页
基金
广东省自然科学基金区域联合基金项目(2019A1515110416)
广东省中医药局广东省中医师承“薪火工程”(2021[5]号)
+1 种基金
龙德省名中医传承工作室项目
林丽珠省名中医传承工作室项目。
文摘
目的本研究目的是通过网络药理学及分子对接方法探寻龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集龙葵-肿节风药对活性成分;在TTD、DrugBank、Pharmgkb等疾病靶点数据库搜索汇总出胃癌基因靶点。利用Cytoscape软件构建“龙葵-肿节风药对活性成分—胃癌交集靶点”关系网络图。使用String数据库构建靶点蛋白相互作用网络(PPI)并用Cytoscape软件筛选出得出核心靶点。同时利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集从宏观角度分析核心靶点,并通过Autodock软件进行分子对接验证主要成分-核心靶点结合活性。结果我们确定了龙葵-肿节风药对主要的药物活性成分主要是槲皮素和β-谷甾醇;核心靶点分别为AKT1、TNF、IL6、TP53和IL1B。KEGG富集分析表明,PI3K-Akt信号通路及炎症相关信号通路可能是重要的通路。GO分析提示主要涉及的生物过程包括对激素的反应、细胞对氮化合物的反应、对异生刺激的反应等;参与的分子功能包括转录因子结合、蛋白质均二聚活性、蛋白质结构域特异性结合等;涉及的细胞组分主要是膜筏、转录调节复合体、质膜蛋白复合物等。分子对接结果表明,主要活性与核心靶点具有良好的结合活性。结论研究表明,龙葵-肿节风药对可能主要通过作用于AKT1、TNF、IL6、TP53和IL1B等靶点,进而调控PI3K-Akt通路、炎症等相关通路,从多靶点、多通路发挥治疗胃癌的作用。本研究为后续开展龙葵-肿节风药对抗胃癌的体内外实验研究奠定了基础。
关键词
网络药理学
分子对接
龙葵
肿节风
PI3K-AKT信号通路
药对
Keywords
Gastric cancer
Network Pharmacology
Molecular Docking
Solanum nigrum
Herba Sarcandrae
PI3K-Akt signaling pathway
Couplet medicines
分类号
R573 [医药卫生—消化系统]
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作者
出处
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被引量
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1
基于网络药理学及分子对接探讨龙葵-肿节风药对治疗胃癌的作用机制
陈丹媛
罗敏
高卓维
郝民琦
黄景彬
黄玉筠
朱亚莉
聂涛
陈锡传
龙德
林丽珠
《现代消化及介入诊疗》
2023
1
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