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细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究
1
作者
李心悦
张亮
+6 位作者
吕莉娟
马健
周伟平
黄淑君
周香城
贺俊成
叶宁
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期506-509,共4页
目的:构建牙龈卟啉单胞菌(简称P.gingivalis)全基因组规模的微阵列比较基因组杂交(简称arrayCGH)芯片平台,分析不同菌株间基因组的差异,为后续检测临床分离株的毒力基因,进一步阐述牙周炎发病机制提供依据。方法:综合已经全基因组测序...
目的:构建牙龈卟啉单胞菌(简称P.gingivalis)全基因组规模的微阵列比较基因组杂交(简称arrayCGH)芯片平台,分析不同菌株间基因组的差异,为后续检测临床分离株的毒力基因,进一步阐述牙周炎发病机制提供依据。方法:综合已经全基因组测序的12株P.gingivalis菌的序列信息,设计探针序列,定制芯片。提取P.gingivalis高毒力株W83和低毒力株ATCC 33277的基因组DNA,利用array-CGH检测其全基因组的差异DNA片段,并运用PCR验证结果的准确性。结果:Array-CGH结果显示两组菌株间存在几个连续片段的拷贝数不同。P.gingivalis W83的部分特异片段参与编码毒力致病因子。在P.gingivalis ATCC 33277的特有片段中,部分编码蛋白可增强细菌表明粘附力,使其具有高粘附力。从中挑选12个基因进行PCR差异性验证,证实与芯片结果一致。结论:用array-CGH芯片的方法来分析全基因组拷贝数的变化具有分辨率高,能精确定位异常片段的特性。本文成功构建了array-CGH技术检测P.gingivalis不同毒力株基因差异的平台,为后续比较临床分离株的差异DNA片段,筛查毒力基因,深入阐述牙周炎的发病机制奠定基础。
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关键词
牙龈卟啉单胞菌
微阵列比较基因组杂交
基因组差异
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职称材料
题名
细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究
1
作者
李心悦
张亮
吕莉娟
马健
周伟平
黄淑君
周香城
贺俊成
叶宁
机构
广州医科大学附属广东省妇儿医院口腔科
广东省
妇幼保健院转化医学中心
广东省
妇幼保健院产科
广东省
妇幼保健院
口腔科
出处
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期506-509,共4页
文摘
目的:构建牙龈卟啉单胞菌(简称P.gingivalis)全基因组规模的微阵列比较基因组杂交(简称arrayCGH)芯片平台,分析不同菌株间基因组的差异,为后续检测临床分离株的毒力基因,进一步阐述牙周炎发病机制提供依据。方法:综合已经全基因组测序的12株P.gingivalis菌的序列信息,设计探针序列,定制芯片。提取P.gingivalis高毒力株W83和低毒力株ATCC 33277的基因组DNA,利用array-CGH检测其全基因组的差异DNA片段,并运用PCR验证结果的准确性。结果:Array-CGH结果显示两组菌株间存在几个连续片段的拷贝数不同。P.gingivalis W83的部分特异片段参与编码毒力致病因子。在P.gingivalis ATCC 33277的特有片段中,部分编码蛋白可增强细菌表明粘附力,使其具有高粘附力。从中挑选12个基因进行PCR差异性验证,证实与芯片结果一致。结论:用array-CGH芯片的方法来分析全基因组拷贝数的变化具有分辨率高,能精确定位异常片段的特性。本文成功构建了array-CGH技术检测P.gingivalis不同毒力株基因差异的平台,为后续比较临床分离株的差异DNA片段,筛查毒力基因,深入阐述牙周炎的发病机制奠定基础。
关键词
牙龈卟啉单胞菌
微阵列比较基因组杂交
基因组差异
Keywords
Porphyromonas gingivalis
Array comparative genomic hybridization
Difference of genomic
分类号
R780.2 [医药卫生—口腔医学]
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作者
出处
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被引量
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1
细菌array-CGH技术用于比较牙龈卟啉单胞菌不同菌株基因组差异的研究
李心悦
张亮
吕莉娟
马健
周伟平
黄淑君
周香城
贺俊成
叶宁
《口腔医学研究》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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