长链非编码 RNA 在肾透明细胞癌组织中的表达

目的：分析长链非编码RNA（ long non－coding RNA，lncRNA）在肾透明细胞癌组织中的表达情况，并筛选出与肾透明细胞癌密切相关的lncRNA，探讨lncRNA在肾透明细胞癌诊断中的作用。方法2012年3月至2013年6月收集40例肾透明细胞癌患者的新鲜癌组织及癌旁组织，Trizol试剂提取总RNA，用Nanodrop 1000及变性琼脂糖凝胶电泳进行RNA检测。通过Arraystar Human LncRNA Microarray芯片筛选肾透明细胞癌组织与癌旁组织中的差异表达lncRNA，采用实时定量PCR方法验证所筛选的lncRNA在40对肾透明细胞癌组织与癌旁组织中的表达情况，采用受试者工作特征（ receiver－operating characteristic，ROC）曲线验证所筛选lncRNA的诊断效率。结果与癌旁组织相比，在肾透明细胞癌组织中差异表达2倍以上的lncRNA有1787个，其中941个表达上调、846个表达下调。实时定量PCR测定NR＿034095、NR＿038974、ENST00000571724及ENST00000566575的表达水平与基因芯片分析结果一致。 NR＿034095、NR＿038974、ENST00000571724及ENST00000566575诊断肾透明细胞癌的ROC曲线下面积分别为0．928（95％CI 0．873～0．984）、0．759（95％CI 0．647～0．871）、0．833（95％CI 0．747～0．919）及0．887（95％CI 0．815～0．959）。结论 NR＿034095、NR＿038974、ENST00000571724及ENST00000566575在肾透明细胞癌组织和癌旁组织中差异表达显著，可能与肾透明细胞癌的发生、发展密切相关，有可能成为肾透明细胞癌分子诊断和基因治疗的新靶点。