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大豆NIN和NLP基因生物信息学分析及敲除载体构建
1
作者
廖春梅
陈丽玉
+2 位作者
杨涔
刘宝辉
孔凡江
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期1-11,共11页
为促进大豆NLP家族基因突变大豆材料的获得及大豆NIN和NLP基因功能的研究,本研究对大豆NIN和NLP基因进行生物信息学分析,通过CRISPR/Cas 9基因编辑技术构建基因敲除载体,并且通过大豆毛根转化实验验证靶点的有效性。结果表明:大豆基因...
为促进大豆NLP家族基因突变大豆材料的获得及大豆NIN和NLP基因功能的研究,本研究对大豆NIN和NLP基因进行生物信息学分析,通过CRISPR/Cas 9基因编辑技术构建基因敲除载体,并且通过大豆毛根转化实验验证靶点的有效性。结果表明:大豆基因组中一共存在4个NIN基因和10个NLP基因家族成员,这些基因都具有RWP-RK和PB1两个保守结构域。亚细胞定位预测表明所有成员都定位在细胞核中,此外GmNIN1b和GmNIN2a还定位于叶绿体。GmNIN1a/b、GmNIN2a/b、GmNLP2a/b及GmNLP3b在根瘤中的表达量相对较高,推测这些基因可能对结瘤过程具有重要的调控功能。成功构建了NLP4和NLP5两个敲除载体,得到可敲除GmNLP4a/b的3个有效靶点和敲除GmNLP5a/b的2个有效靶点。本研究获得了大豆NIN和NLP基因家族的生物信息学依据和创制GmNLP4a/b和GmNLP5a/b基因突变体的技术依据。
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关键词
大豆
根瘤
NLP基因
生物信息学分析
CRISPR/Cas
9基因编辑技术
基因敲除载体
GmNLP4a/b
GmNLP5a/b
下载PDF
职称材料
题名
大豆NIN和NLP基因生物信息学分析及敲除载体构建
1
作者
廖春梅
陈丽玉
杨涔
刘宝辉
孔凡江
机构
广州大学生命科学学院/分子遗传与进化创新研究中心
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期1-11,共11页
基金
广东省基础与应用基础研究重大项目(2019B030302006)。
文摘
为促进大豆NLP家族基因突变大豆材料的获得及大豆NIN和NLP基因功能的研究,本研究对大豆NIN和NLP基因进行生物信息学分析,通过CRISPR/Cas 9基因编辑技术构建基因敲除载体,并且通过大豆毛根转化实验验证靶点的有效性。结果表明:大豆基因组中一共存在4个NIN基因和10个NLP基因家族成员,这些基因都具有RWP-RK和PB1两个保守结构域。亚细胞定位预测表明所有成员都定位在细胞核中,此外GmNIN1b和GmNIN2a还定位于叶绿体。GmNIN1a/b、GmNIN2a/b、GmNLP2a/b及GmNLP3b在根瘤中的表达量相对较高,推测这些基因可能对结瘤过程具有重要的调控功能。成功构建了NLP4和NLP5两个敲除载体,得到可敲除GmNLP4a/b的3个有效靶点和敲除GmNLP5a/b的2个有效靶点。本研究获得了大豆NIN和NLP基因家族的生物信息学依据和创制GmNLP4a/b和GmNLP5a/b基因突变体的技术依据。
关键词
大豆
根瘤
NLP基因
生物信息学分析
CRISPR/Cas
9基因编辑技术
基因敲除载体
GmNLP4a/b
GmNLP5a/b
Keywords
soybean
nodule
NLP genes
bioinformatics analysis
CRISPR/Cas 9 gene editing technology
gene knockout vector
GmNLP4a/b
GmNLP5a/b
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆NIN和NLP基因生物信息学分析及敲除载体构建
廖春梅
陈丽玉
杨涔
刘宝辉
孔凡江
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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