CRISPR/Cas12f及其衍生基因工程工具的研究进展

CRISPR关联基因12f(Cas12f)由于蛋白序列短,便于基因递送及后续的基因治疗,受到广泛的关注及越来越多的研究报道。本文系统性地回顾和总结了基因编辑系统CRISPR(成簇的规则间隔短回文重复序列)/Cas12f及其衍生的相关基因编辑工具的研究进展,深入探讨了Cas12f的结构特性、间隔子相邻基序(PAM)识别与切割机制,以及基于CRISPR/Cas12f的碱基编辑和转录调控,以期为进一步开发基于Cas12f的基因编辑及治疗工具提供参考。

利用三代测序技术识别小鼠早期胚胎等位基因特异的转录本和剪切事件

目的:探究三代测序技术在研究小鼠早期胚胎发育过程中等位基因特异的转录组和可变剪切中的优势。方法:收集已发表文献中小鼠早期胚胎的测序数据,用这些数据识别等位基因特异的转录本和可变剪切事件以及差异可变剪切事件,比较二代测序数据和三代测序数据识别的结果。结果:小鼠早期胚胎7个阶段的三代测序数据中分别识别出1288、759、734、955、976、953和834个等位基因特异的转录本,值得注意的是50%~94%的等位基因特异的转录本无法被二代测序数据所识别。与二代测序技术相比,三代测序在鉴别可变剪切事件方面具有更高的潜力,并且三代数据可以鉴别出大量准确且特异的剪切结。另外,在每个阶段平均鉴定出650个等位基因特异的可变剪切事件和26个差异可变剪切事件。结论:三代测序技术有助于发现新的等位基因特异的转录本和可变剪切事件以及差异可变剪切事件,从而为早期胚胎发育研究领域提供宝贵的注释资源。

新型RNA编辑系统在动物基因功能研究中的应用

RNA编辑指遗传信息转录后对RNA核苷酸序列的改变,包括碱基替换、核苷酸的插入和删除等过程。RNA编辑系统可分为基于CRISPR-Cas13和非CRISPR-Cas13 RNA编辑系统两种,该文分别阐述了两种系统的分子机制和编辑过程,并总结了新型RNA编辑系统的优势、缺陷以及应用价值。