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基于生物信息学与网络药理学的芹菜素抗前列腺癌的分子机制研究
1
作者
苏智楷
周映霖
+3 位作者
胡磊
陈浩强
周建甫
殷振超
《现代药物与临床》
CAS
2024年第6期1417-1424,共8页
目的 利用生物信息学结合网络药理学及分子对接系统性探索芹菜素抗前列腺癌的分子机制。方法 通过ETCM、HERB、HIT2.0及SwissTargetPrediction数据库预测芹菜素靶点。计算TCGA和GEO数据集差异基因作为前列腺癌预测的疾病靶点,并检索Gene...
目的 利用生物信息学结合网络药理学及分子对接系统性探索芹菜素抗前列腺癌的分子机制。方法 通过ETCM、HERB、HIT2.0及SwissTargetPrediction数据库预测芹菜素靶点。计算TCGA和GEO数据集差异基因作为前列腺癌预测的疾病靶点,并检索GeneCards和OMIM数据库作为补充。应用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点。采用Metascape数据库进行富集分析,使用PyMOL、AutoDock Tools、AutoDock Vina软件以及PDB数据库进行分子对接。结果 共预测到236个芹菜素抗前列腺癌作用靶点,主要与激素反应、细胞死亡调控及激酶调节有关,且京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路与前列腺癌密切相关。筛选得到70个核心靶点,分子对接发现B细胞淋巴瘤因子-2(Bcl-2)、V-Jun肉瘤病毒癌基因同源物(JUN)、低氧诱导因子-1A(HIF-1A)、肿瘤坏死因子(TNF)、ERG、雌激素相关受体α(ESRRA)与芹菜素有良好结合力。结论 芹菜素通过多靶点和多通路实现抗前列腺癌作用。
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关键词
芹菜素
前列腺癌
生物信息学
网络药理学
分子对接
B细胞淋巴瘤因子-2
低氧诱导因子-1A
肿瘤坏死因子
原文传递
题名
基于生物信息学与网络药理学的芹菜素抗前列腺癌的分子机制研究
1
作者
苏智楷
周映霖
胡磊
陈浩强
周建甫
殷振超
机构
广州
中医药大学
广州
中医药大学第二附属
医院
泌
尿
外科
广州市东升医院泌尿外科
出处
《现代药物与临床》
CAS
2024年第6期1417-1424,共8页
基金
广东省医学科学技术研究基金项目(A2020239)。
文摘
目的 利用生物信息学结合网络药理学及分子对接系统性探索芹菜素抗前列腺癌的分子机制。方法 通过ETCM、HERB、HIT2.0及SwissTargetPrediction数据库预测芹菜素靶点。计算TCGA和GEO数据集差异基因作为前列腺癌预测的疾病靶点,并检索GeneCards和OMIM数据库作为补充。应用STRING数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并筛选核心靶点。采用Metascape数据库进行富集分析,使用PyMOL、AutoDock Tools、AutoDock Vina软件以及PDB数据库进行分子对接。结果 共预测到236个芹菜素抗前列腺癌作用靶点,主要与激素反应、细胞死亡调控及激酶调节有关,且京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路与前列腺癌密切相关。筛选得到70个核心靶点,分子对接发现B细胞淋巴瘤因子-2(Bcl-2)、V-Jun肉瘤病毒癌基因同源物(JUN)、低氧诱导因子-1A(HIF-1A)、肿瘤坏死因子(TNF)、ERG、雌激素相关受体α(ESRRA)与芹菜素有良好结合力。结论 芹菜素通过多靶点和多通路实现抗前列腺癌作用。
关键词
芹菜素
前列腺癌
生物信息学
网络药理学
分子对接
B细胞淋巴瘤因子-2
低氧诱导因子-1A
肿瘤坏死因子
Keywords
apigenin
prostate cancer
bioinformatics
network pharmacology
molecular docking
Bcl-2
HIF-1A
TNF
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学与网络药理学的芹菜素抗前列腺癌的分子机制研究
苏智楷
周映霖
胡磊
陈浩强
周建甫
殷振超
《现代药物与临床》
CAS
2024
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