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27重SNP系统推断种族来源的效能
被引量:
3
1
作者
冯杏玲
孙启凡
+5 位作者
刘宏
魏以梁
杜蔚安
李彩霞
陈玲
刘超
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期555-562,共8页
目的验证和评估27-plex SNPs复合扩增系统(简称27重SNP系统)推断种族来源的效能。方法验证27重SNP系统的灵敏度和种属特异性;用该系统检测非洲、华南地区汉族、回族、苗族、彝族、藏族、维吾尔族、欧洲、中亚、西亚、南亚、东南亚、南...
目的验证和评估27-plex SNPs复合扩增系统(简称27重SNP系统)推断种族来源的效能。方法验证27重SNP系统的灵敏度和种属特异性;用该系统检测非洲、华南地区汉族、回族、苗族、彝族、藏族、维吾尔族、欧洲、中亚、西亚、南亚、东南亚、南美洲等13个人群的533份样本,将其分型数据与Hap Map数据库的东亚(CHB)、欧洲(CEU)、非洲(YRI)3个代表人群的分型数据进行聚类分析,分析祖先成分,计算匹配概率;分析46份盲测样本的种族来源。结果该系统灵敏度达0.125 ng;除猩猩和猴子分别检出20和6个位点,其余动物样本仅在rs10496971位点检出扩增产物;该系统可以进行洲际人群区分,但是无法区分东南亚与东亚人群,无法细分广东汉族与彝族、回族、苗族和藏族等少数民族人群;盲测样本洲际人群推断的准确率为100%。结论27重SNP系统灵敏度高、特异性好,可准确区分个体的非洲、欧洲或东亚祖先成分。该系统不具备亚人群区分效力,有待后续筛选更多的特异性祖先信息标记,以满足区分东南亚人群以及中国不同族群的需要。
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关键词
法医物证学
SNP
祖先信息位点
种族来源推断
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职称材料
亚硝基化的二硫键异构酶介导甲基苯丙胺致小鼠相关脑区α-突触核蛋白表达升高
被引量:
1
2
作者
王悦
许文宁
+5 位作者
吴小芳
朱林楠
乔红花
陈玲
刘超
邱平明
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期1386-1390,共5页
目的研究亚硝基化的二硫键异构酶(PDI)对甲基苯丙胺(METH)致小鼠海马及纹状体区α-突触核蛋白(α-SN)表达的影响。方法利用C57小鼠METH亚急性中毒模型,使用一氧化氮合酶(NOS)抑制剂N-硝基-L-精氨酸(L-NNA)与METH共同造模,实验分为对照组...
目的研究亚硝基化的二硫键异构酶(PDI)对甲基苯丙胺(METH)致小鼠海马及纹状体区α-突触核蛋白(α-SN)表达的影响。方法利用C57小鼠METH亚急性中毒模型,使用一氧化氮合酶(NOS)抑制剂N-硝基-L-精氨酸(L-NNA)与METH共同造模,实验分为对照组、L-NNA组、METH组、METH+L-NNA组。Western Blotting技术检测各组海马及纹状体区内一氧化氮合酶(NOS)、PDI及其S亚硝基化(PDI-SNO)和α-SN表达情况。一氧化氮试剂盒检测各组一氧化氮含量。结果 METH给药后NOS、一氧化氮含量、PDI-SNO、α-SN表达较对照组均明显升高(P<0.05);L-NNA与METH共处理后与METH组对比,NOS表达下降(P<0.05),一氧化氮含量明显减少(P<0.05),能够显著抑制PDI-SNO表达(P<0.05),伴随α-SN表达降低(P<0.05)。而MET H+L-NNA组、L-NNA组与对照组比较均无明显差异(P>0.05)。结论 METH作用后诱导NOS活化,一氧化氮含量升高,PDI发生显著S亚硝基化而功能失活,导致相关脑区α-SN表达升高,而NOS抑制剂L-NNA能部分缓解METH神经毒性作用。
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关键词
甲基苯丙胺
二硫键异构酶
亚硝基化
Α-突触核蛋白
一氧化氮合酶
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职称材料
题名
27重SNP系统推断种族来源的效能
被引量:
3
1
作者
冯杏玲
孙启凡
刘宏
魏以梁
杜蔚安
李彩霞
陈玲
刘超
机构
南方医科大学
法医
学院
公安部物证鉴定中心//现场物证溯源国家工程
实验室
//
法医
遗传学
公安部
重点
实验室
广州市刑事科学技术研究所//广东省法医遗传学重点实验室
天津医科大学
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第4期555-562,共8页
基金
法医遗传学公安部重点实验室开放课题(2015FGKFKT03)
"十二五"国家科技支撑计划项目(2012BAK02B01-1)
文摘
目的验证和评估27-plex SNPs复合扩增系统(简称27重SNP系统)推断种族来源的效能。方法验证27重SNP系统的灵敏度和种属特异性;用该系统检测非洲、华南地区汉族、回族、苗族、彝族、藏族、维吾尔族、欧洲、中亚、西亚、南亚、东南亚、南美洲等13个人群的533份样本,将其分型数据与Hap Map数据库的东亚(CHB)、欧洲(CEU)、非洲(YRI)3个代表人群的分型数据进行聚类分析,分析祖先成分,计算匹配概率;分析46份盲测样本的种族来源。结果该系统灵敏度达0.125 ng;除猩猩和猴子分别检出20和6个位点,其余动物样本仅在rs10496971位点检出扩增产物;该系统可以进行洲际人群区分,但是无法区分东南亚与东亚人群,无法细分广东汉族与彝族、回族、苗族和藏族等少数民族人群;盲测样本洲际人群推断的准确率为100%。结论27重SNP系统灵敏度高、特异性好,可准确区分个体的非洲、欧洲或东亚祖先成分。该系统不具备亚人群区分效力,有待后续筛选更多的特异性祖先信息标记,以满足区分东南亚人群以及中国不同族群的需要。
关键词
法医物证学
SNP
祖先信息位点
种族来源推断
Keywords
forensics biological evidence
single nucleotide polymorphisms
ancestry-informative markers
ancestry inference
分类号
D919 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
亚硝基化的二硫键异构酶介导甲基苯丙胺致小鼠相关脑区α-突触核蛋白表达升高
被引量:
1
2
作者
王悦
许文宁
吴小芳
朱林楠
乔红花
陈玲
刘超
邱平明
机构
南方医科大学
法医
学院
上海交通大学医学院附属新华医院
顺德职业
技术
学院医药卫生学院
广州市刑事科学技术研究所//广东省法医遗传学重点实验室
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第10期1386-1390,共5页
基金
国家自然科学基金(81373240)
广东省自然科学基金(2014A030313300
2014A030310025)~~
文摘
目的研究亚硝基化的二硫键异构酶(PDI)对甲基苯丙胺(METH)致小鼠海马及纹状体区α-突触核蛋白(α-SN)表达的影响。方法利用C57小鼠METH亚急性中毒模型,使用一氧化氮合酶(NOS)抑制剂N-硝基-L-精氨酸(L-NNA)与METH共同造模,实验分为对照组、L-NNA组、METH组、METH+L-NNA组。Western Blotting技术检测各组海马及纹状体区内一氧化氮合酶(NOS)、PDI及其S亚硝基化(PDI-SNO)和α-SN表达情况。一氧化氮试剂盒检测各组一氧化氮含量。结果 METH给药后NOS、一氧化氮含量、PDI-SNO、α-SN表达较对照组均明显升高(P<0.05);L-NNA与METH共处理后与METH组对比,NOS表达下降(P<0.05),一氧化氮含量明显减少(P<0.05),能够显著抑制PDI-SNO表达(P<0.05),伴随α-SN表达降低(P<0.05)。而MET H+L-NNA组、L-NNA组与对照组比较均无明显差异(P>0.05)。结论 METH作用后诱导NOS活化,一氧化氮含量升高,PDI发生显著S亚硝基化而功能失活,导致相关脑区α-SN表达升高,而NOS抑制剂L-NNA能部分缓解METH神经毒性作用。
关键词
甲基苯丙胺
二硫键异构酶
亚硝基化
Α-突触核蛋白
一氧化氮合酶
Keywords
methamphetamine
protein disulphide isomerasec
nitrosation
α-synuclein
nitric oxide synthase
分类号
R749.64 [医药卫生—神经病学与精神病学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
27重SNP系统推断种族来源的效能
冯杏玲
孙启凡
刘宏
魏以梁
杜蔚安
李彩霞
陈玲
刘超
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
下载PDF
职称材料
2
亚硝基化的二硫键异构酶介导甲基苯丙胺致小鼠相关脑区α-突触核蛋白表达升高
王悦
许文宁
吴小芳
朱林楠
乔红花
陈玲
刘超
邱平明
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
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职称材料
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