靶向高通量测序鉴定非结核分枝杆菌菌种的应用价值

目的:探讨靶向高通量测序(targeted next-generation sequencing,tNGS)技术在非结核分枝杆菌菌种鉴定的应用价值。方法:收集2021年7月至2022年9月,在广州市胸科医院非结核分枝杆菌病诊疗中心住院患者的428份标本进行研究,其中,痰标本312份,支气管肺泡灌洗液标本116份。对上述标本进行tNGS分枝杆菌鉴定(简称“tNGS法”)和微生物培养(BACTEC MGIT 960)+DNA微阵列芯片法(简称“培养法”)进行分枝杆菌菌种鉴定,并对2种方法检测结果进行比较。结果:(1)tNGS法和培养法分别分离出结核分枝杆菌102份和56份,非结核分枝杆菌150份和182份。(2)tNGS法的分枝杆菌检出率为58.88%(252/428),与培养法阳性率55.61%(238/428)比较,差异无统计学意义(χ^(2)=0.936,P=0.333)。(3)以培养法为参照标准,tNGS法检测分枝杆菌的敏感度、特异度、假阴性率、假阳性率、阳性预测值、阴性预测值和Kappa值分别为80.65%(200/248)、92.22%(166/180)、22.43%(48/214)、6.54%(14/214)、93.46%(200/214)、77.57%(166/214)和0.710。结论:tNGS法与培养法一致性良好,具备很好的时效性、敏感度、特异度,利于早期制定临床治疗方案。

慢生黄分枝杆菌肺病一例

非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)是一大类普遍存在于灰尘、水源和土壤中的环境细菌[1],约1/3的NTM菌种对人类具有潜在致病性,可引起肺、淋巴结、关节、中枢神经系统等感染,但约有75%~94%表现为肺部病变,也可由导管相关性感染引起播散[2]。根据生长速度,NTM分为快速生长分枝杆菌(3~7 d内肉眼可见菌落)和缓慢生长分枝杆菌(7 d以上见生长菌落)[3]。慢生黄分枝杆菌(Mycobacterium lentiflavum)属于缓慢生长分枝杆菌,具有缓慢生长和产生黄色素的特点,近年来由其引起人类感染的患者逐年增多,不仅多见于呼吸道和皮肤感染,还可引起播散性传播。因此,笔者报告1例广州市胸科医院收治的慢生黄分枝杆菌引起呼吸道感染患者的诊治情况,以为临床提供参考。

21例肺诺卡菌病临床特征及耐药性分析

目的了解肺诺卡菌的菌种分布、感染特征及菌种耐药情况,为肺诺卡菌病的诊断和治疗提供依据。方法回顾性分析2021年1月至2023年12月在安徽省胸科医院确诊为肺诺卡菌病患者的临床资料,分析诺卡菌菌种分布、临床特点及耐药情况。结果21例肺诺卡菌病确诊患者共鉴定出诺卡菌22株,其中1例有合并感染。菌种包括盖尔森基兴诺卡菌7株(31.8%)、皮疽诺卡菌4株(18.2%)、脓肿诺卡菌2株(9.1%)、豚鼠耳炎诺卡菌2株(9.1%)、星型诺卡菌、华莱士诺卡菌、亚洲诺卡菌和南非诺卡菌各1株(4.5%),另有3株(13.6%)未能鉴别种属。患者平均年龄60.8岁,男女性别比为1∶1.1,症状主要表现为咳嗽/咳痰(85.7%)、胸闷(38.1%)、咯血(28.6%)等;胸部CT主要表现为支气管扩张(57.1%)及斑片状影(57.1%)等;气管镜可直观清晰展示气管内黏液、糜烂或血凝块等典型病变特征。11例药物敏感试验结果显示诺卡菌对利奈唑胺、阿米卡星敏感。结论肺诺卡菌病多为中老年患者,男女比例相当,感染菌种主要为盖尔森基兴诺卡菌,对利奈唑胺、阿米卡星敏感。患者临床表现不具备特异性,CT及电子支气管镜下表现具有一定的辅助诊断价值。