广灵驴分子系谱的建立及群体遗传结构分析

旨在对广灵县优种驴场保种群体进行调查的基础上构建分子系谱,并对其种群的遗传结构进行分析。本研究采集保种群成年、体况良好的广灵驴(体重350~400 kg)颈静脉血10 mL(n=107),其中公驴13份,母驴94份,抗凝处理后提取全血DNA。采用12个微卫星标记进行荧光PCR扩增后,用ABI3730测序仪进行分型。分型结果采用Cervus 2.0和Pedigraph 2.4软件构建分子系谱,同时采用STRUCTURE2.3和Fstat软件计算群体遗传参数,采用R语言的hclust函数绘制7头公驴及其后代的系统发生NJ树(邻接树)。结果,对107头种驴进行了分子系谱构建,找到了30头子代的父亲和7头子代的母亲,系谱可靠性>90%;微卫星标记的平均观测杂合度(H_(Obs))和多态信息含量(PIC)分别为0.6765和0.5939,标记遗传多样性较高;NJ树对7个公驴家系进行了聚类;群体分化系数(F_(ST))为0.184,群体平均近交系数(F_(IT))为0.033,群体内近交系数(F_(IS))为-0.238,且群体处于哈代-温伯格平衡状态,存在很弱的近交。本研究建立了广灵驴保种群可靠性较高的分子系谱并对其遗传结构进行了分析,证明该群体遗传多态性较高,群体近交系数较低,处于较好的保种状态,具有较大的品种资源开发潜力。

广灵驴体重与体尺指标的主成分分析和回归模型的建立

为研究广灵驴体重和体尺性状内在的相关性,实验选取广灵县优种驴场100头不同年龄阶段的种驴进行体重和4个体尺指标的测定。结果表明:年龄对广灵驴体重、体高、体长、胸围、管围具有极显著影响,性别对广灵驴管围具有极显著影响。不同年龄阶段驴的体重与各体尺指标都存在极显著相关关系。主成分分析结果显示:幼驴体重体尺指标相关矩阵特征值为4.61,累积贡献率为0.92;青年驴体重体尺指标相关矩阵特征值分别为3.12、0.75、0.64,累积贡献率为0.90;成年驴体重体尺指标相关矩阵特征值为3.33和0.76,累积贡献率为0.82。通过逐步回归方法和AIC(赤池信息量)准则判定体重体尺性状最优回归模型为:BW=4.35BL+2.18CM–579.39。